ゲノム解析技術GP法をもちいた浮遊性原生生物における種概念の構築

利用基因组分析技术GP法构建浮游原生生物物种概念

• 批准号: 17654100
• 负责人: 松岡 篤
• 金额: $ 2.11万
• 依托单位: Niigata University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 2006
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17654100/
• 关键词: 放散中; 有孔虫; ゲノム; 種概念; 原生生物; 放散虫

沖縄近海の東シナ海において1回の,佐渡島近海の日本海において3回のプランクトン採取を行った.沖縄の瀬底臨海実験所(琉球大学)および佐渡臨海実験所(新潟大学)において,Didymocyrtis, Dictyocoryne, Euchitonia, Eucyrtidiuum, Spongosphaera, Spongodiscus, Actinosphaera, Acanthodesmia, Pseudocubus, Pterocanium, Eucyrtidium属(放散虫),Globigerinoides属(有孔虫)を主対象とした浮遊性原生生物の生態観察を実施した.新潟大学大学院自然科学研究科に既設の走査型電子顕微鏡(日本電子 5300LV)を用いて,殻の画像を取得した.詳細な形態解析により,殻形態の種間関係や種内変異を把握した.埼玉大学でゲノム・プロフィリング(GP)法を実施し,Didymocyrtis, Dictyocoryne, Eucyrtidium属などのPolycystine放散虫とPhaeodaria・Acantharia放散虫との分子生物学的近縁度を求めた.研究成果を,日本地球惑星連合大会(2006年5月,千葉幕張メッセ),第61回形の科学会(2006年6月,名古屋大学),第2回万国古生物会議(2006年6月北京),日本古生物学会(2006年6月島根大学),第62回形の科学会(2006年11.月,大阪大学),などで発表した.論文としては,GP法の結果をBMC Genomics誌などに発表し,GP法が原生生物の種を識別するのにも有効であることを示した.

Okinawa Offshore's East Coast Sea 1 Return, Sado Island Offshore Sea of Japan's Sea of Japan 3 Returns Continental Travel.Okinawa Didymocyrtis, Sado Rinkai Research Institute (Niigata University) Dictyocoryne, Euchitonia, Eucyrtidiuum, Spongosphaera, Spongodiscus, Actinosphaera, Acanthodesmia, Pseudocubus, Pterocanium, The genus Eucyrtidium (emitted insects) and the genus Globigerinoides (foraminifera) are mainly responsible for the ecological observation of planktonic protists. The established walk-through electron microscope at the Graduate School of Natural Science, Niigata University (JEOL) 5300LV) is used, the shell image is obtained, the detailed morphological analysis is done, the shell morphology is related to the interspecific relationship and the intraspecific value is obtainedでゲノム・プロフィリング(GP)法を実士し of Saitama University, Didymocyrtis, Dictyocoryne, Eucyrtidium genus Polycystine worms, Phaeodaria・Acantharia worms, and molecular biology. Research results, Japan Federation of Earth Planets Conference (May 2006, Chiba Makuhari University), 61st Chapter Society (June 2006, Nagoya University), The 2nd International Conference on Paleontology (June 2006, Beijing), Japanese Paleontological Society (June 2006, Island Root University), the 62nd Science Society of Japan (November 2006, Osaka University), などで発智した. Paper としては, GP method results をBMC Genomics records the list, and the GP method identifies the species of protists and identifies the species. It is effective and effective.

项目成果

Phylogenetic position of the small solitary phaeodarians (Radiolaria) based on 18S rDNA sequences by single cell PCR analysis

• DOI: 10.1016/j.marmicro.2006.01.003
• 发表时间: 2006-04
• 期刊: Marine Micropaleontology
• 影响因子: 1.9
• 作者: Tomoko Yuasa;O. Takahashi;J. K. Dolven;S. Mayama;A. Matsuoka;D. Honda;K. Bjørklund

進化・情報・かたち"生命知"のパースペクティブ

进化、信息、形成“生物智能”视角

• 发表时间: 2006
• 作者: 伏見謙;西垣功一;松岡篤 ほか
• 通讯作者: 松岡篤 ほか

A solution for universal classification of species based on genomic DNA.

基于基因组DNA的物种普遍分类的解决方案。

• DOI: 10.1155/2007/27894
• 发表时间: 2007
• 期刊: International journal of plant genomics
• 作者: Kouduka, Mariko;Sato, Daisuke;Komori, Manabu;Kikuchi, Motohiro;Miyamoto, Kiyoshi;Kosaku, Akinori;Naimuddin, Mohammed;Matsuoka, Atsushi;Nishigaki, Koichi
• 通讯作者: Nishigaki, Koichi

Quantitative morphological analyses and evolutionary history of the Middle Jurassic polycystine radiolarian genus Striatojaponocapsa Kozur

• DOI: 10.1016/j.marmicro.2006.11.001
• 发表时间: 2007-04
• 期刊: Marine Micropaleontology
• 影响因子: 1.9
• 作者: K. Hatakeda;N. Suzuki;A. Matsuoka

Water temperature, salinity, algal-chlorophyll profiles and radiolarian fauna in the surface and subsurface waters in early June, off Tassha, Sado Island, central Japan

• 发表时间: 2006-03
• 期刊: Science reports of Niigata University
• 作者: T. Kurihara;Toyokazu Shimotani;A. Matsuoka