タンパク質の新規N末端特異的修飾法の開発とDNAリンクタンパク質の創製
タンパク質の新規N末端特異的修飾法の開発とDNAリンクタンパク質の創製
批准号:
18651068
负责人:
横川 隆志
金额:
$2.24万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份:
2006
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2006 至 2007
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本年度の課題は、Leucyl/Phenylalanyl-tRNA Protein Transferaseを利用するタンパク質のN末端修飾法の修飾効率がこれまで低かった点を改善し、実際に、タンパク質のN末端にDNAを結合させることであった。これまではN末端へのアジドフェニルアラニン導入効率をいかに高めるかについて条件検討を行ってきたが、アジド基選択的な修飾法として、これまで当研究室で利用してきたStaudinger-Bertozzi ligationよりも、Crick chemistryとして知られるアジド基とアセチレン誘導体のHuisgen 1,3-dipolar cycloadditionの方が修飾効率が高いことが判明したので、方針を転換してオリゴDNAの末端にアジド基を、タンパク質のN末端にはアセチレン誘導体であるエチニルフェニルアラニンを導入する系を構築することにした。まず当研究室で取得済みのフェニルアラニルtRNA合成酵素変異体(T415G)を用いてtRNAにエチニルフェニルアラニンが受容できるか検討したところ、T415Gにとってエチニルフェニルアラニンはアジドフェニルアラニンよりも1.5倍よい基質であることがわかった。次にαカゼインをモデルタンパク質として用いて、エチニルフェニルアラニンがN末端に導入され、さらに導入されたエチニル基がアジドフルオレセインとHuisgen 1,3-dipolar cycloadditionによって蛍光修飾されることを確かめた。残念ながら、オリゴDNAの末端に導入されたアミノ基をアジド基に変換する試薬の入手が遅れ、まだDNAをタンパク質のN末端に導入する実験を行えていない。今後、速やかにDNAリンクタンパク質の作製を試みたい。
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DOI:
10.1002/prot.21341
发表时间:
2007-05-15
期刊:
PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS
影响因子:
2.9
作者:
[Abe, Masato, Ohno, Satoshi, Endo, Yaeta]
通讯作者:
Endo, Yaeta
Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of yeast tyrosyl-tRNA synthetase complexed with its cognate tRNA.
酵母酪氨酰-tRNA 合成酶与其同源 tRNA 复合的结晶和初步 X 射线晶体分析。
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
Protein Pept. Lett. 13・4
影响因子:
--
作者:
[Tsunoda M., et. al., Fukunaga J. et al., Kenichi Yoshikawa, Kusakabe Y. et al.]
通讯作者:
Kusakabe Y. et al.
DOI:
10.1093/jb/mvm036
发表时间:
2007-03-01
期刊:
JOURNAL OF BIOCHEMISTRY
影响因子:
2.7
作者:
[Ohno, Satoshi, Matsui, Megumi, Nishikawa, Kazuya]
通讯作者:
Nishikawa, Kazuya
Structural basis for recognition of cognate tRNA by tyrosyl-tRNA synthetase from three kingdo
三界酪氨酰-tRNA合成酶识别同源tRNA的结构基础
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
Nucleic Acids Res. 35
影响因子:
--
作者:
[Tsunoda M., et. al.]
通讯作者:
et. al.
Misacylation of yeast amber suppressor tRNA^<lyr> by E. coli lysyl-tRNA synthetase and its effective repression by genetic engineering of the tRNA sequence.
大肠杆菌赖氨酰-tRNA合成酶对酵母琥珀抑制子tRNA^<lyr>的错酰化及其通过tRNA序列的基因工程的有效抑制。
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
J. Biochem. (Tokyo) 139・4
影响因子:
--
作者:
[Tsunoda M., et. al., Fukunaga J. et al., Kenichi Yoshikawa, Kusakabe Y. et al., 北畑裕之, Fukunaga J. et a1.]
通讯作者:
Fukunaga J. et a1.
共 9 条
メタン菌におけるtRNA環状化の制御機構
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批准号:23K04988
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2023
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负责人:横川 隆志
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依托单位:
バクテリアのタンパク質合成系に関与する未知遺伝子群の探索
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批准号:16013215
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.37万
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财政年份:2004
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负责人:横川 隆志
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依托单位:
バクテリアのタンパク質合成系に未知遺伝子は存在するか?
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批准号:15013220
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.92万
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财政年份:2003
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负责人:横川 隆志
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依托单位:
複数の蛍光プローブを用いた機能性RNA分子のモーションキャプチャー
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批准号:14658222
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.98万
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财政年份:2002
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负责人:横川 隆志
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依托单位:
分子進化工学を用いたチロシルtRNA合成酵素のアミノ酸特異性のスイッチング
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批准号:14704067
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
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资助金额:$15.23万
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财政年份:2002
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负责人:横川 隆志
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依托单位:
非天然アミノ酸を認識するアミノアシルtRNA合成酵素の創製
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批准号:12780507
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.15万
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财政年份:2000
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负责人:横川 隆志
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依托单位:
異常構造を持つtRNAに対するミトコンドリア・セリルtRNA合成酵素の認識機構
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批准号:06780555
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1994
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负责人:横川 隆志
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依托单位: