候補遺伝子アプローチによるIPMN感受性遺伝子のGENE-BASED相関検定

使用候选基因方法进行 IPMN 易感基因的基于基因的相关性测试

• 批准号: 18659387
• 负责人: 田中 雅夫
• 金额: $ 2.11万
• 依托单位: Kyushu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2007
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18659387/
• 关键词: IPMN; 膵癌; 遺伝子多型; 相関解析; 発がん感受性

我が国や先進欧米各国において、膵癌は最も予後不良な癌であり、その解決のためには、膵癌発症関連遺伝子の同定が急務である。膵癌は複数の遺伝要因と環境要因の相互作用によって発症する多因子疾患であり、これまで、国際的にもいくつかの発症関連候補遺伝子が報告されたが、相反する結果も示され、未だ明確な答えが得られていない。その大きな原因の一つは、膵癌の遺伝的異質性にあり、したがって、通常型膵癌をはじめ、他臓器癌を高率に合併する易発癌性を示すIPMN症例に解析対象を特化したゲノム解析が、膵癌発症関連遺伝子解明の端緒となる。平成18年度は、IPMN発症感受性を規定する遺伝要因を探索する目的で、膵がんを含め、種々のがんにおいて発がんの遺伝要因となる可能性が報告されている候捕遺伝子多型について相関検定を実施した。具体的には、TP53、MTHFR、PPARG、IGFBP3、STKI5、MBD4、ADPRT、XRCC1、OGG1、APC、MMP2、STCH、ODC、MMP7計14遺伝子の主に遺伝子機能変化を伴うcSNPについて、IPMN患者群215名、健常対照群476名を対象としてTaqMan法によるSNPタイピングを実施し、こ群間における対立遺伝子頻度分布、遺伝子型頻度分布の差異をカイ2乗検定により検定した。その結果、対立遺伝子頻度分布、および、遺伝子型頻度分布の何れにおいても、有意差を認める遺伝子多型は同定されなかった。したがって、今回対象とした遺伝子多型は、IPMNの遺伝背景を説明するものではないと考えられた。今後も、候補遺伝子解析を継続するが、優先遺伝子として、STK11、BRCA2、SPINK1、PRSS1を挙げる。これらについては、今回解析した遺伝子群とは異なり、主として遺伝子領域にマーカーSNPを設定し、連鎖不平衡を利用した相関解析を実施する。

In our country, we have made the same decision on the emergency treatment of cancer patients in Omi countries, cancer patients, cancer patients and cancer patients. The complexity of cancer is due to the fact that the environment has to be affected by multiple factors of disease, such as the disease of typhoid, the disease of the disease, and the international epidemic of the disease. On the contrary, the results of the report show that the results are not clear and have not been clearly answered. The etiology of IPMN is similar to that of specialization, diagnosis of cancer, high incidence of cancer, high incidence of cancer, and high incidence of cancer. In Pingcheng, the susceptibility test of IPMN syndrome in the 18th year stipulates that it is necessary to apply the drug because of the exploration of the purpose of the disease, the content of the drug, and the possibility to report the possibility of the disease. The specific cluster, TP53, MTHFR, PPARG, IGFBP3, STKI5, MBD4, ADPRT, XRCC1, OGG1, APC, MMP2, STCH, ODC, MMP7 are 14 sub-cluster hosts that are able to convert the patients with cSNP disease, the IPMN patient group, the healthy health group, the TaqMan method, and the SNP cluster. There is a difference in the degree distribution of the sub-type. The result of the test, the distribution of the degree of the child, the distribution of the subtype of the child, the distribution of the subtype of the child, and intentionally recognized that the polymorphisms of the child were the same as those of the subtype. This time, please tell me that you have a lot of polymorphisms, and IPMN that you have a background that shows that you have a lot of information. In the future, you will be able to analyze your child, STK11, BRCA2, SPINK1, and PRSS1. This time, you can analyze the SNP settings of the sub-group, the main domain, and the unbalanced link using the phase analysis.