癌発症に関連する大規模コピー数多型(CNP)の同定に関する研究

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CNP自体が明らかになって4年が経過したに過ぎないが、単にゲノム構造という生物学的興味から、既に疾患との関連性が研究対象となっている。CNPとがんとの関連性は可能性としては指摘されてはいるものの、そのような報告は未だない。「アレイCGHの技術を利用して、がん組織(細胞)とその組織提供者の正常組織(リンパ球)とに於けるDNAコピー数異常を解析するとともに、非がん者より提供された正常細胞におけるコピー数を網羅的に測定することにより、当該がん(がんの種類によって関係するCNPが異なる)に関連した候補CNVを同定する。」ことを目的として、研究を行った。がん(乳がん、大腸がん)を正常組織とともに約20例収集し、BAC(bacterial artificial chromosome)クローンが約4,000種類スポットされているゲノムアレイを用いてDNAコピー数異常の検出を行った。内部標準DNAは、非癌患者20人から採取したDNAを混合したものを使用した。また、同時にがん患者における非がん検体を測定し、がんと同様に高頻度に出現したコピー数異常部位をCNV候補とし、非がん者DNAにおけるコピー数測定結果と比較により、がんとの関連性が考えられる候補CNVとした。この分野での過去に報告されたデータ蓄積は皆無であり、小規模といえども得られたデータの意義は極めて大きい。各人のがん感受性と極めて密接に関連するCNP候補が決定された。現在引き続き検討を行っているが、これ以降の過程は本格研究で実施する(当初の研究申請どおり)。