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カイコの新型トランスポゾンを用いた突然変異誘発法および遺伝子タギング法の開発

利用新型蚕转座子开发诱变和基因标记方法

基本信息

批准号：
14656023
负责人：
嶋田透
金额：
$ 2.24万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2002
资助国家：
日本
起止时间：
2002 至 2003
项目状态：
已结题

项目摘要

昨年度、カイコゲノムからAquila、Cygnus、Lyraと命名した昆虫レトロウイルス様因子を発見した。今年度は、さらにゲノム情報の網羅的探索を実施した。マイマイガ核多角体病ウイルスの膜融合タンパク質を手がかりに、カイコゲノム情報をin silicoで探索した。その結果、新規のレトロウイルス候補2種類の配列を得、それぞれArcturus、Denebolaと名付けた。Arcturusは三つのORFを持ちそれぞれがGag、Pol、Env様タンパク質をコードしており、それらORFの外側にはLTR配列が存在していた。またDenebolaは二つのORFを持ち、1番目のORFにGag様タンパク質及びPol様タンパク質をコードし、2番目のORFにEnv様タンパク質をコードするという構造を持っていたが、LTRは同定できなかった。また、envの塩基配列の一部を基準にしてコピー数を見積もったところ、Arcturusが10コピー、Denebolaが16コピー存在すると推定された。一方で、新たにpiggyBacに弱い相同性を示す新しいトランスポゾンを発見した。これは最初p50T系統のW染色体に由来するBACクローン1C7Cから発見され,全長、は3419bpであった。674アミノ酸残基からなるトランスポザーゼをコードしており、そのアミノ酸配列はpiggyBacと34%が一致していた。ORFの外側に16塩基の逆向き反復配列があり,左右の逆向き反復配列のさちに外側にTTAAというターゲット重複配列が認められた。PCRおよびサザンブロットによる解析より,W染色体におけるこのトランスポゾン様配列の挿入は,p50T系統に特異的であることが判明した。この結果から,このトランスポゾン様配列には転移能力がある可能性が高いと判断し,yabusame-Wと命名した。

Last year, Aquila, Cygnus, Lyra and other insect species were discovered. This year, we will continue to explore new ways to improve the quality of our services. Nuclear polyhedrosis, nuclear polyhedrosis The result of the new regulation is that the candidate 2 types are allocated to Arcturus and Denebola. Arcturus has three ORFs: Gag, Pol, Env, and LTR. Denebola has two ORFs, one ORF, one Gag sample, one Pol sample, one ORF, one Env sample, one Pol sample, two ORFs, one LTR sample, one LTR sample, and one LTR sample. A part of the base arrangement is presumed to exist in the presence of a number of elements, such as Arcturus, Denebola, etc. A new piggyBac shows the weak identity of the new piggyBac. The original p50T chromosome was derived from the BAC chromosome 1C7C, which was 3419bp in length. 674. The acid residues were removed and the piggy-bac was found to be consistent. ORFs are arranged in reverse on the outer side of the base, and in reverse on the left side of the base. PCR analysis of the W-chromosome sequence and p50T system analysis of the W-chromosome sequence. The result is that the probability of the shift ability is high, and the yabusame-W is named.

项目成果

期刊论文数量（8）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Hiroaki Abe, Toshiyuki Sugasaki, Tomoko Terada, Mariko Kanehara, Fumi Ohbayashi, Toru Shimada, Shinya Kawai, Kazuei Mita, Toshikazu Oshiki: "Nested retrotransposons on the W chromosome of the wild silkworm Bombyx mandarina."Insect Molecular Biology. 11(4)

Hiroaki Abe、Toshiyuki Sugasaki、Tomoko Terada、Mariko Kanehara、Fumi Ohbayashi、Toru Shimada、Shinya Kawai、Kazuei Mita、Toshikazu Oshiki：“野蚕 Bombyx mandarina W 染色体上的嵌套逆转录转座子。”昆虫分子生物学。

DOI：
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0
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Hiroaki Abe, Kazuei Mita, Yuji Yasukochi, Toshikazu Oshiki, Toru Shimada: "Retrotransposable elements on the W chromosome of the silkworm, Bombyx mori."Cytogenetic and Genome Research.Special issue (Retrotransposable elements and genome evolution). (印刷中).

Hiroaki Abe、Kazuei Mita、Yuji Yasukochi、Toshikazu Oshiki、Toru Shimada：“家蚕 W 染色体上的逆转录转座元件。”细胞遗传学和基因组研究。特刊（逆转录转座元件和基因组进化）。

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0
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Yoshiko Koike, Kazuei Mita, Masataka G.Suzuki, Susumu Maeda, Hiroaki Abe, Kazutoyo Osoegawa, Pieter J.deJong, Toru Shimada: "Genomic sequence of 320 kb containing a kettin ortholog on the Z chromosome in Bombyx mori"Molecular Genetics and Genomics. (印刷中).

Yoshiko Koike、Kazuei Mita、Masataka G.Suzuki、Susumu Maeda、Hiroaki Abe、Kazutoyo Osoekawa、Pieter J.deJong、Toru Shimada：“家蚕 Z 染色体上含有 kettin 直向同源物的 320 kb 基因组序列”分子遗传学和基因组学（在新闻）。

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Yoshiko Koike, Kazuei Mita, Masataka G.Suzuki, Susumu, Maeda, Hiroaki, Abe, Kazutoyo, Osoegawa, Pieter, J.deJong, Toru Shimada: "Genomic sequence of 320 kb containing a kettin ortholog on the Z chromosome in Bombyx mori"Molecular Genetics and Genomics. (印

Yoshiko Koike、Kazuei Mita、Masataka G.Suzuki、Susumu、Maeda、Hiroaki、Abe、Kazutoyo、Osoekawa、Pieter、J.deJong、Toru Shimada：“家蚕 Z 染色体上含有 kettin 直向同源物的 320 kb 基因组序列”分子遗传学和基因组学。

DOI：
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影响因子：
0
作者：
通讯作者：

Kazuei Mita, Mitsuoki Morimyo, Kazuhiro Okano, Yoshiko Koike, Junko Nohata, Hideki Kawasaki, Keiko Kadono-Okuda, Kimiko Yamamoto, Masataka G.Suzuki, Toru Shimada, Marian R.Goldsmith, Susumu Maeda: "The construction of an EST database for Bombyx mori and i

Kazuei Mita、Mitsuoki Morimyo、Kazuhiro Okano、Yoshiko Koike、Junko Nohata、Hideki Kawasaki、Keiko Kadono-Okuda、Kimiko Yamamoto、Masataka G.Suzuki、Toru Shimada、Marian R.Goldsmith、Susumu Maeda：“构建 EST 数据库