海洋嗜热古菌新型限制性内切酶基因组的综合开发研究-猫眼课题宝

海洋嗜热古菌新型限制性内切酶基因组的综合开发研究

批准号：

14656082

负责人：

左子芳彦

金额：

$2.18万

依托单位：

Kyoto University

依托单位国家：

日本

项目类别：

Grant-in-Aid for Exploratory Research

财政年份：

2002

资助国家：

日本

项目状态：

已结题

起止时间：

2002 至 2004

来源：

https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-14656082/

关键词：

古細菌ゲノム多型イントロンホーミング遺伝子水平伝播ホーミングエンドヌクレアーゼ利己的遺伝子可動性イントロン超好熱菌ゲノム有用遺伝子資源 II型制限酵素タンパク質-DNA相互作用制限修飾系バイオインフォマテイックス無細胞蛋白質合成系耐熱性酵素

项目摘要

项目成果

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中文摘要

翻译

古細菌rRNA遺伝子には多数の可動性イントロンが散在し,その各々の内部ORFにはLAGLIDADG型ホーミングエンドヌクレアーゼ(HEase)がコードされている.HEaseはこれらのイントロンの部位特異的転移を司る鍵酵素であり,ゲノム塩基配列の中からイントロンの転移標的を検索・切断しホーミング(homing)過程を開始させる役割を担う.またLAGLIDADG型HEaseは14-40bpの長いDNA配列を認識するレアカッター酵素であることもこれまでの我々の研究から明らかになっている.本年度は,広義の「制限酵素」の範疇に属するLAGLIDADG型HEaseの構造と機能について解析した.海洋性超好熱古細菌Aeropyrum pernixおよび陸上温泉から分離された超好熱古細菌Pyrobaculum oguniense, Thermoproteus spp.から19種の新規な認識配列をもつ酵素を同定し,I-ApeI,I-ApeII,I-Tsp061I等と名づけた.いずれも14〜22bpの長さの偽回文配列または非回文配列を認識するレアカッター酵素であり,それらの基質特異性を詳細に検討した.I-Tsp061Iの結晶については分解能2.0Åの精密立体構造を解明することに成功し,その原子座標をPDBに登録した(PDB ID : 1VAW).I-ApeII遺伝子にランダム変異を導入することにより,その基質特異性が野生型とは異なる人工レアカッター酵素の創製に成功した.立体構造のモデリングから,この変異体における基質特異性の変化は,標的DNAとの相互作用を司るDNA結合表面(βサドル構造)の柔軟性が増強されたことによるものと推測された.

英文摘要

期刊论文(38)

专著(0)

科研奖励(0)

会议论文

Morinaga, Y., Nomura, N., Sako, Y.: "Population dynamics of archaeal mobile introns in natural environments : A shrewd Invasion strategy of the latent parasitic DNA"Microbes and Environments. 17・4. 153-163 (2002)

Morinaga, Y., Nomura, N., Sako, Y.：“自然环境中古菌移动内含子的种群动态：潜在寄生 DNA 的精明入侵策略”微生物与环境 17・4 (2002)。

DOI： --

发表时间：

期刊：

影响因子： --

作者：

[]

通讯作者：

Takai K, Inagaki F, Nakagawa S, Hirayama H, Nunoura T, Sako Y, Nealson KH, Horikoshi K.: "Isolation and phylogenetic diversity of members of previously uncultivated epsilon-Proteobacteria in deep-sea hydrothermal fields"FEMS Microbiology Letters. 218・1. 1

Takai K、Inagaki F、Nakakawa S、Hirayama H、Nunoura T、Sako Y、Nealson KH、Horikoshi K.：“深海热液场中先前未培养的 epsilon-Proteobacteria 成员的分离和系统发育多样性”FEMS 微生物学快报 218。・1.1

DOI： --

发表时间：

期刊：

影响因子： --

作者：

[]

通讯作者：

Nitratiruptor tergarcus gen.nov., sp.nov. and Nitratifractor salsuginis gen.nov., sp.nov., two nitrate-reducing chemolithoautotrophs within the epsilon-Proteobacteria isolated from a deep-sea hydrothermal system in the Mid-Okinawa

Nitratiruptor tergarcus gen.nov., sp.nov.

DOI： --

发表时间： 2005

期刊：