DNA損傷の多成分同時測定系開発

DNA损伤多组分同步测量系统的开发

• 批准号: 15651018
• 负责人: 松田 知成
• 金额: $ 2.43万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 2004
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-15651018/
• 关键词: LC; MS; DNA付加体; DNAアダクトーム解析; DNA損傷

DNA損傷は発癌や老化に関連しており、その正確で感度のよい定量手法が求められていた。本研究では、高速液体クロマトグラフタンデム質量分析器(LC/MS/MS)を用いて、多数のDNA付加体を同時に定量する手法を開発した。DNA付加体の種類にもよるが、10μgのDNAサンプルから10^8塩基あたり数個の感度で測定が可能であることがわかった。これは^<32>P-ポストラベル法に匹敵する感度であり、LC/MS/MSによるDNA付加体の分析は実用段階に達したといえる。次に、未知のDNA付加体を網羅的に解析する手法も開発した。DNAを構成するデオキシヌクレオシドは、デオキシリボースに塩基がグリコシド結合している化合物である。LC/MS/MSでデオキシヌクレオシドを分析すると、多くの場合、第一質量分析部で選択した親イオンが、CID部でアルゴンガスと衝突し、グリコシド結合の開裂が起こり、娘イオンとして、塩基部分のイオンが検出される。従って、親イオシと娘イオンのm/zの差をデオキシリボースの質量に対応する116にセットしておけば、感度良く検出できることが多い。この原理を利用して、親イオンと娘イオンのm/zの差を常に116になるように設定し、m/zの値を1刻みで増加させながら、しらみつぶしにDNA付加体を検出するプログラムを組み、分析を行う系を確立した。ヒト臓器のDNAを解析したところ多数の未知のDNA損傷が検出された。

DNA damage is related to cancer and aging. It is a quantitative method that is accurate and sensitive. In this study, a high-speed liquid chromatography mass analyzer (LC/MS/MS) was used, and a simultaneous quantitative method using multiple DNA admixtures was developed. It is possible to measure the sensitivity of several types of DNA add-ons such as 10 μg of DNA and 10 µg of DNA.これは^<32>The P-ポストラベル method is comparable to the sensitivity of するであり, and the LC/MS/MS DNA analysis method is based on the step-by-step method. The method of analysis and analysis of the unknown DNA plus body and snare is also open. DNA consists of するデオキシヌクレオシドは, デオキシリボースに塩组がグリコシドcombination している compound である. LC/MS/MS でデオキシヌクレオシドをanalytical すると、Multiple occasions, the first quality analysis department is selected by でイオンが, CI Part D: Conflict of Conflict and Combination of Crackこり, 女イオンとして, the base part of のイオンが検出される.従って、爱オシと女イオンのm/zの Poor をデオキシリボースのqualityに対応する116にセットしておけば、sensitivity good く検出できることが多い.この principle を use し て, aki イ オ ン と 女 イ オ ン の difference を often 116 に な る よ う に setting し, m/z の値 を 1 momentみでincrease and add させながら, しらみつぶしにDNA add body を検出するプログラムをgroup み, analyze を行う线をestablish した.ヒト蓓器のDNAをANALYSISしたところMultiple unknown DNA damageが検出された.

项目成果

Translesion synthesis past 2'-deoxyxanthosine, a nitric oxide-derived DNA adduct, by mammalian DNA polymerases.

通过哺乳动物 DNA 聚合酶跨损伤合成 2-脱氧黄苷（一种一氧化氮衍生的 DNA 加合物）。

• DOI: 10.1016/j.jmb.2004.09.064
• 发表时间: 2004
• 期刊: Journal of molecular biology.
• 作者: Yasui,Manabu;Suzuki,Naomi;Miller,Holly;Matsuda,Tomonari;Matsui,Saburo;Shibutani,Shinya
• 通讯作者: Shibutani,Shinya

「京大人気講義シリーズ 地球環境学のすすめ」第6章

《京都大学大众讲座系列：全球环境研究概论》第6章

• 发表时间: 2004
• 作者: Shogo Miyata;Katsuko S Furukawa;Takashi Ushida;Tetsuya Tateishi;松田知成(分担執筆)
• 通讯作者: 松田知成(分担執筆)

京都大学地球環境学研究会: "地球環境学のすすめ"丸善. 257 (2004)

京都大学全球环境研究小组：“全球环境研究建议”Maruzen 257（2004）。

DNA付加体の分析方法-LC/ESI/MS/MSはポストラベルを越えたか?

如何分析 DNA 加合物 - LC/ESI/MS/MS 是否超越了后标记？

• 发表时间: 2004
• 期刊: 環境変異原研究 26
• 作者: 川西 誠;田中 栄;中村 耕三;牛田 多加志;古川 克子;織田 弘美;福林徹;立石 哲也;松田知成
• 通讯作者: 松田知成

J.Adachi, Y.Mori, S.Matsui, T.Matsuda: "Comparison of Gene Expression Patterns between 2,3,7,8-TCDD and a Natural Arylhydrocarbon Receptor Ligand, Indirubin"Toxicol.Sci.. (In press). (2004)

J.Adachi、Y.Mori、S.Matsui、T.Matsuda：“2,3,7,8-TCDD 和天然芳基烃受体配体靛玉红之间基因表达模式的比较”Toxicol.Sci..（出版中）