低温適応酵素における低温適応機構の分子メカニズムの解明

阐明冷适应酶的冷适应分子机制

基本信息

  • 批准号:
    17H06955
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.75万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
  • 财政年份:
    2017
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2017-08-25 至 2019-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

①低温細菌Shewanella sp. AS-11 由来の無機ピロフォスファターゼ(Sh-PPase)を大腸菌にて過剰発現し、精製を行った。Sh-PPaseは活性中心に2つのマンガンイオンを有するが、精製試料は金属結合体で無かったため、過剰量のMnイオンを含む緩衝液で活性化処理を行いEPR測定を行った。ところが、フリーのMnイオン由来のEPR信号に邪魔されて酵素由来の信号の解析が困難であった。そこで金属イオン活性化条件の再検討を行い、フリーのMnイオンを除去し、不純物のない活性型Sh-PPaseを精製することに成功した。この試料を用いて種々の条件でのEPR測定を行い、電子状態の解析を行った。解析結果より、2つのマンガンイオン間の距離が3.55Aであり、これまで明らかになっている2つのマンガンイオンを有する酵素と比較して非常に小さな磁気相互作用を持っていることを明らかにした。今後はこの活性化法を用いて、基質結合型での活性中心近傍の構造解析、さらに基質結合型、非結合型における活性中心の構造と酵素活性の温度依存性を明らかにしていく。②上記低温菌由来酵素との比較対象として、新たに中温菌由来無機ピロフォスファターゼの遺伝子を組み込んだプラスミドを作製した。またこれを用いて大腸菌での発現系の構築にも成功した。今後精製系をさらに精査し、低温菌由来酵素との比較実験を行う予定である。③Sh-PPaseの構造変化の温度依存性を直接観測するための変異体作製の設計を行った。今後数種類の変異体の発現・精製を行う予定である。④これまで開発してきた高速混合凍結装置について、さらに再現性良く試料の作製を行うため、ミキサー部の改良を行った。これを用いて現在試料のクエンチ時間の再構成実験を行っている。
1. Low temperature bacteria Shewanella sp. AS-11 originated from inorganic bacteria and developed from Escherichia coli. Sh-PPase is activated in a buffer solution containing Mn and active center 2. EPR measurement is performed in a refined sample containing Mn and active center 2. EPR signal analysis of the origin of the enzyme is difficult. The re-examination of the activation conditions of these metals, the removal of impurities and the purification of active Sh-PPase were successful. EPR determination of the sample using the same conditions, analysis of the electronic state The analysis results show that the distance between the two groups is 3.55A, and the enzyme is very small compared with the magnetic interaction. In the future, the activation method will be used to analyze the structure near the active center of matrix-bound type, and the temperature dependence of the active center and enzyme activity of matrix-bound type and unbound type will be clarified. 2. The comparative study on the origin of low-temperature bacteria and the control on the origin of low-temperature bacteria The construction of the development system using E. coli was successful. In the future, the purification system will be carefully investigated, and the comparison of enzymes from low temperature bacteria will be carried out. (3) The temperature dependence of Sh-PPase structure is directly measured, and the design of heterogeneous structure is carried out. In the future, several kinds of variants will be developed and refined. (4) The development of high-speed mixing and freezing device, the improvement of sample preparation with good reproducibility, This is the first time that a sample has been reconstructed.

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
低温適応酵素グルコキナーゼの低温機構解明に向けて
阐明冷适应酶葡萄糖激酶的低温机制
  • DOI:
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    林 芙由子;渡邉 啓一;堀谷 正樹
  • 通讯作者:
    堀谷 正樹
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电子自旋共振法分析低温无机焦磷酸酶活性位点Mn2+离子的电子结构
  • DOI:
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    榊原 由季;木原 有理;堀谷 正樹;渡邉 啓一
  • 通讯作者:
    渡邉 啓一
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