新規3Dゲノム構造同定法に基づいたニューロン分化・可塑性制御機構の解明

基于新型3D基因组结构识别方法阐明神经元分化和可塑性控制机制

基本信息

批准号：
22H00431
负责人：
後藤由季子
金额：
$ 27.21万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2025-03-31
项目状态：
未结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22H00431/
关键词：
クロマチン３次元構造ニューロン

项目摘要

近年、クロマチンの３次元構造が遺伝子の発現制御において重要な要素であることが明らかになってきた。ヘテロクロマチンやユークロマチンといった古典的な染色体の凝集状態や、エンハンサーとプロモーターの近接状態（ループ構造）に加えて、種々の核内ボディ（相分離した空間的な集合体）の遺伝子発現制御における役割が注目されてきている。しかし、それぞれの核内ボディにいかなるゲノム領域や制御タンパク質が局在し、いかなるコンテクストで核内ボディの制御が行われているのかについては、未だ不明な点が多い。本年度までの研究において、神経幹細胞の未分化性を保ちつつニューロン分化能を付与する因子を同定し、この因子が核内ボディを作ることを見出した。そしてこの因子がいかにして神経幹細胞の未分化性を維持するのか、ニューロン分化能を付与できるのか、について検討するためにクロマチン免疫沈降によるこの因子の結合ゲノム領域を探索した。またこの因子によって発現制御される遺伝子を調べるために遺伝子破壊と過剰発現を行なった際の変動遺伝子を調べた。その結果、この因子が遺伝子内に結合する遺伝子の多くがこの因子によって発現抑制されていることが示唆された。以上の結果は、核内ボディの一つについてその構成因子と遺伝子制御における役割、さらには神経幹細胞制御における役割を明らかにしたものである。

近年来，很明显，染色质的三维结构是基因表达调节的重要元素。除了经典染色体的聚集状态（例如异染色质和全染色质）以及增强子和启动子的接近态（环结构），以及各种核体（相分开的空间组件）的基因表达控制的作用。但是，关于哪些基因组区域和调节蛋白在每个核体中以及在哪些背景下受到控制的情况下，仍然存在许多未知数。在截至今年的研究中，我们确定了赋予神经元分化能力的因素，同时保持神经干细胞的不分化性质，并发现该因素会产生核内体。为了研究该因素如何保持神经干细胞的不分化并赋予神经元分化潜力，我们通过染色质免疫沉淀搜索了该因子的结合基因组区域。另外，为了检查该因素表达的基因，我们研究了进行基因中断和过表达时产生的可变基因。结果表明，许多结合该因子在基因内的基因都被该因素抑制。以上结果揭示了其中一个核体的基因调节中的组成因素和作用，以及在神经干细胞调节中的作用。

项目成果

期刊论文数量（37）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

細胞内カルボキシル化タンパク質の同定とストレス刺激応答における機能解析

应激刺激反应中细胞内羧化蛋白的鉴定和功能分析

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Tomoaki Kajiwara;Yoshihiro Yoshitake;Megumi Iwano;Shogo Kawamura;Yukiko Yasui;Shohei Yamaoka;Takayuki Kohchi;金宥利,後藤昂宏,川口大地,後藤由季子;Hitoshi Sakano;齋藤里歩,岡崎朋彦,後藤由季子;Hitoshi Sakano;野崎啓史,岡崎朋彦,小迫英尊,後藤由季子
通讯作者：
野崎啓史,岡崎朋彦,小迫英尊,後藤由季子

What determines the survival fate upon lethal viral infection? -properties and dynamics of blood immune cells-

是什么决定了致命病毒感染后的生存命运？

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Katoh Takayuki;Suga Hiroaki;桑山尚大,岸雄介,鯨井智也,平野里奈,越後谷健太,石黒啓一郎,胡桃坂仁志,後藤由季子;Riho Saito,Tomohiko Okazaki,Yukiko Gotoh
通讯作者：
Riho Saito,Tomohiko Okazaki,Yukiko Gotoh

リカレンスプロット逆変換を用いた染色体3 次元構造の高速再構成

使用递归图反转快速重建 3D 染色体结构

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Katoh Takayuki;Suga Hiroaki;平田祥人
通讯作者：
平田祥人

Identification of immune cells protecting from lethal viral infection in the central nervous system

鉴定中枢神经系统免受致命病毒感染的免疫细胞

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Wakabayashi Risa;Kawai Marina;Katoh Takayuki;Suga Hiroaki;Akisawa Satomi,Tomohiko Okazaki,Yukiko Gotoh
通讯作者：
Akisawa Satomi,Tomohiko Okazaki,Yukiko Gotoh

Mechanisms defining embryonic origin of adult neural stem cells

成体神经干细胞胚胎起源的定义机制

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Naohiro Kuwayama,Tomoya Kujirai,Yusuke Kishi,Rina Hirano,Kenta;Echigoya,Yutaka Suzuki,Mitsuyoshi Nakao,Naoki Tani,Kei-ichiro\;Ishiguro,Hitoshi Kurumizaka,Yukiko Gotoh;Yukiko Gotoh;Yukiko Gotoh;李彩維,川口大地,後藤由季子
通讯作者：
李彩維,川口大地,後藤由季子