全身性強皮症における病的B細胞の形質変化や機能の解明

B細胞特異的Fli1欠失マウスおよびコントロールマウスの脾臓からそれぞれage-associated B細胞を単離し、RNA抽出およびTn5 transposaseを用いたDNAのタグメンテーションを行いRNA-seqおよびATAC-seqを実施した。その結果、RNA-seqにおいて両者の間にはage-associated B細胞の特徴であるCD11b, CD11c, T-betの発現がいずれも上昇しており、CD21の低下およびCD23の著明な低下などの特徴も一致していた。また発現変動遺伝子を用いたGO解析ではcytokine productionやimmune system processなど、B細胞の機能に関わる項目の変化が上位に多数位置していた。さらに、ATAC-seqで検出されたオープンクロマチン領域のpeak siteの結果をRNA-seqの発現変動遺伝子の結果と組み合わせることにより、いずれにおいても有意な変化が見られていたものを抽出し、特にB細胞特異的Fli1欠失マウスで発現遺伝子量の上昇およびpeak siteの増加が有意にみられたものとして120個の遺伝子を抽出した。今後、これらの中でB細胞の分化や機能に特に関係している遺伝子、および全身性強皮症との関連が過去に報告されている遺伝子に着目して、その機能変化に関する検討を行っていくとともに、ヒト全身性強皮症患者におけるB細胞の変化との類似性を評価していく予定である。

B細胞特異的Fli1欠失マウスおよびコントロールマウスの脾臓からそれぞれage-associated B細胞を単離し、RNA抽出およびTn5 transposaseを用いたDNAのタグメンテーションを行いRNA-seqおよびATAC-seqを実施した。その結果、RNA-seqにおいて両者の間にはage-associated B細胞の特徴であるCD11b, CD11c, T-betの発現がいずれも上昇しており、CD21の低下およびCD23の著明な低下などの特徴も一致していた。また発現変動遺伝子を用いたGO解析ではcytokine productionやimmune system processなど、B細胞の機能に関わる項目の変化が上位に多数位置していた。さらに、ATAC-seqで検出されたオープンクロマチン領域のpeak siteの結果をRNA-seqの発現変動遺伝子の結果と組み合わせることにより、いずれにおいても有意な変化が見られていたものを抽出し、特にB細胞特異的Fli1欠失マウスで発現遺伝子量の上昇およびpeak siteの増加が有意にみられたものとして120個の遺伝子を抽出した。今後、これらの中でB細胞の分化や機能に特に関係している遺伝子、および全身性強皮症との関連が過去に報告されている遺伝子に着目して、その機能変化に関する検討を行っていくとともに、ヒト全身性強皮症患者におけるB細胞の変化との類似性を評価していく予定である。