核コードシグマ因子群によるシロイヌナズナ色素体DNA転写制御
核编码西格玛因子对拟南芥质体 DNA 转录的调控
基本信息
- 批准号:14340248
- 负责人:
- 金额:$ 9.28万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
- 财政年份:2002
- 资助国家:日本
- 起止时间:2002 至 2004
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
植物色素体DNAの転写は、核コードのバクテリオファージ型RNAポリメラーゼ(NEP)と、色素体ゲノムにコードされ、特異性を核コードのシグマ因子に調節されるRNAポリメラーゼ(PEP)により行われる。本研究では核コードの6種のシグマ因子の機能を知るために以下の解析を行った。1.核コードのシグマ因子の一つ、SIG2の変異株を用い、これまでにSIG2への依存性の知られているtrnEプロモーター、およびpsbDの複合プロモーター領域について、転写開始点の同定を行った。その結果、trnEプロモーターおよびpsbD上流の-256プロモーターがSIG2に依存して転写されることを確定した。さらにこれらのRNA末端が、RNAプロセシングでなく転写開始点であることを示した。これらはコンセンサス型の-10配列を持っプロモーターであった。2.SIG2に依存して転写される色素体遺伝子を網羅的に解析するために、シロイヌナズナ色素体の全ての蛋白質遺伝子をカバーするDNAマイクロアレイを構築した。これを用いた解析の結果、野生株よりも転写産物の減少している遺伝子はpsaJのみであり、この減少はノザン解析やSlマッピングによっても確認された。NEPに依存して転写される遺伝子群が、sig2変異株で過剰発現していることも判明し、SIG2に依存したNEPの抑制機構が強く示唆された。3.ストレスに依存した遺伝し発現制御を調べるため、ストレス条件下における6種のシグマ因子遺伝子の発現を解析した。その結果、SIG5の遺伝子発現のみが、強光、低温、高浸透圧、塩で強く誘導されることを見いだした。そして、SIG5の発現は、従来は青色光で誘導されるプロモーターとして知られてきたpsbD-BLRPプロモーターの発現と一致することが判明した。即ち、BLRPは青色光のみならず、様々なストレスでSIG5に依存して発現する。SIG5欠損株を用いた解析により、SIG5とBLRPの関係、そしてSIG5のストレス耐性への関与が示された。
Plant chromosome DNA transcription, nuclear DNA transcription, nuclear DNA transcription, RNA transcription (NEP), chromosome DNA transcription, nuclear DNA transcription, nuclear DNA transcription factors regulate RNA transcription (PEP). In this study, the functions of 6 kinds of nuclear factors were analyzed. 1. The first step of the core selection factor, SIG2 variant, SIG2 dependency, SIG2 dependency, SI As a result, trnE is dependent on psbD and the SIG is dependent on psbD. The end of the RNA sequence is indicated by the beginning of the sequence.これらはコンセンサス型の-10配列を持っプロモーターであった。2. SIG2 depends on the analysis of the whole protein gene of the chromosome and the construction of the DNA sequence. The results of this analysis, the reduction of the wild plant's production, the reduction of the plant's production, and the identification of the plant's production. The NEP is dependent on the SIG 2 and the NEP is dependent on the SIG 2 and the NEP is dependent on the SIG 2. 3. The analysis of six kinds of factors under the condition of the dependence of the factors on the development of the system As a result, SIG5's emission occurs at high light, low temperature, high saturation pressure, and high temperature. The occurrence of SIG5 in the presence of blue light is recognized as the occurrence of psbD-BLRP. That is, BLRP and SIG5 are dependent on each other. SIG5 is the most important factor in the analysis of SIG5 and BLRP.
项目成果
期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
田中 寛: "葉緑体の転写調節系、葉緑体分化を支える転写カスケード"蛋白質核酸酵素. 48. 2161-2167 (2003)
Hiroshi Tanaka:“叶绿体转录调控系统,支持叶绿体分化的转录级联”蛋白质核酸酶。 48. 2161-2167 (2003)
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Akitomo Nagashima: "Microarray analysis of plastid gene expression in an Arabidopsis mutant deficient in a plastid transcription factor sigma, SIG2"Biosci.Biotechnol.Biochem.. 68. 694-704 (2004)
Akitomo Nagashima:“质体转录因子 Sigma、SIG2 缺陷的拟南芥突变体中质体基因表达的微阵列分析”Biosci.Biotechnol.Biochem.. 68. 694-704 (2004)
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Sousuke Imamura, Satoshi Yoshihara, Serina Nakano, Noriko Shiozaki, Akiko Yamada, Kan Tanaka, Hideo Takahashi, Munehiko Asayama, Makoto Shirai: "Punfication Characterization, and Gene Expression of all sigma factors of RNA polymerase in a Cyanobacterium"J
Sousuke Imamura、Satoshi Yoshihara、Serina Nakano、Noriko Shiozaki、Akiko Yamada、Kan Tanaka、Hideo Takahashi、Munehiko Asayama、Makoto Shirai:“蓝藻中 RNA 聚合酶所有 Sigma 因子的标点特征和基因表达”J
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Mitsumasa Hanaoka: "Molecular genetic analysis of chloroplast gene promoters dependent on SIG2, a nucleus-encoded sigma factor for the plastid-encoded RNA polymerase, in Arabidopsis thaliana"Nucleic Acids Res.. 31. 7090-7098 (2003)
Mitsumasa Hanaoka:“拟南芥叶绿体基因启动子依赖于 SIG2 的分子遗传学分析,SIG2 是质体编码 RNA 聚合酶的核编码 σ 因子”,《核酸研究》31. 7090-7098 (2003)
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Akitomo Nagashima: "The Multiple-Stress Responsive Plastid Sigma Factor, SIG5, Directs Activation of the psbD Blue Light-Responsive Promoter (BLRP) in Arabidopsis thaliana"Plant Cell Physiol.. (印刷中). (2004)
Akitomo Nagashima:“多重应激反应质体 Sigma 因子,SIG5,指导拟南芥中 psbD 蓝光反应启动子 (BLRP) 的激活”植物细胞生理学 (2004 年出版)。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
田中 寛其他文献
原始紅藻における光シグナル伝達に関わるE3ユビキチンリガーゼCul4複合体の解析
原始红藻中参与光信号转导的E3泛素连接酶Cul4复合物分析
- DOI:
- 发表时间:
2021 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
小林 勇気;北川 美也子;吉川 瞳子;大原 ひかる;華岡 光正;今村 壮輔;田中 寛 - 通讯作者:
田中 寛
Surface and Interfacial Structures of Silsesquioxane-terminated Polystyrene Thin Films
倍半硅氧烷封端聚苯乙烯薄膜的表面和界面结构
- DOI:
- 发表时间:
2007 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
沖村千夏;作村諭一;島袋勝弥;岩楯好昭;Toshiji KANAYA;平島剛志;T.Yakoo;平島剛志;田中 寛;A.Takahara - 通讯作者:
A.Takahara
Approaches to the Elimination of Schistosomiasis on Bohol Island, Philippines
菲律宾保和岛消除血吸虫病的方法
- DOI:
- 发表时间:
1996 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
一男 安羅岡;B. Blas;松田 肇;入江 勇治;二瓶 直子;大前 比呂志;横井 一;R. Hambre;R. Pangilinan;Crispina Autentico;田中 寛 - 通讯作者:
田中 寛
葉緑体の転写装置.蛋白質核酸酵素増刊号「二層膜オルガネラの遺伝学」(林純一, 杉山康雄, 坂本亘, 田中寛, 正木春彦)
叶绿体的转录装置。蛋白质核酸酶特刊“双层膜细胞器的遗传学”(Junichi Hayashi、Yasuo Sugiyama、Wataru Sakamoto、Hiroshi Tanaka、Haruhiko Masaki)
- DOI:
- 发表时间:
2005 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
沖村千夏;作村諭一;島袋勝弥;岩楯好昭;Toshiji KANAYA;平島剛志;T.Yakoo;平島剛志;田中 寛 - 通讯作者:
田中 寛
田中 寛的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('田中 寛', 18)}}的其他基金
メガデヒドロゲナーゼ複合体が牽引するエネルギー獲得代謝モードとその制御
巨脱氢酶复合物驱动的能量获取代谢模式及其调控
- 批准号:
23K23503 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 9.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
メガデヒドロゲナーゼ複合体が牽引するエネルギー獲得代謝モードとその制御
巨脱氢酶复合物驱动的能量获取代谢模式及其调控
- 批准号:
22H02236 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 9.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Elucidation of the mechanism of tissue repair of macular hole and possibility of treatment using amniotic membrane
黄斑裂孔组织修复机制的阐明及羊膜治疗的可能性
- 批准号:
22K16957 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 9.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
単細胞紅藻葉緑体ゲノムにおける転写調節ネットワークの解明
阐明单细胞红藻叶绿体基因组中的转录调控网络
- 批准号:
12206027 - 财政年份:2000
- 资助金额:
$ 9.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
高等植物における葉緑体RNAポリメラーゼシグマ因子の研究
高等植物叶绿体RNA聚合酶σ因子的研究
- 批准号:
12025204 - 财政年份:2000
- 资助金额:
$ 9.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
高等植物における葉緑体RNAポリメラーゼシグマ因子の研究
高等植物叶绿体RNA聚合酶σ因子的研究
- 批准号:
11151206 - 财政年份:1999
- 资助金额:
$ 9.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
高等植物葉緑体RNAポリメラーゼシグマ因子の研究
高等植物叶绿体RNA聚合酶σ因子的研究
- 批准号:
10170207 - 财政年份:1998
- 资助金额:
$ 9.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
高等植物葉緑体RNAポリメラーゼシグマ因子の研究
高等植物叶绿体RNA聚合酶σ因子的研究
- 批准号:
09274207 - 财政年份:1997
- 资助金额:
$ 9.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
大腸菌増殖定常期待特異的シグマ因子(σ^<38>)のプロモーター認識特異性
大肠杆菌生长平稳的启动子识别特异性预期特异性西格玛因子 (σ^<38>)
- 批准号:
07760074 - 财政年份:1995
- 资助金额:
$ 9.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
大腸菌増殖定常期および緊縮応答時に特異的なσ因子、σ^<38>の発現調節
在大肠杆菌生长稳定期和严格性响应期间调节特定 σ 因子 σ^<38> 的表达
- 批准号:
06760073 - 财政年份:1994
- 资助金额:
$ 9.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
相似国自然基金
PDM3及互作蛋白调控叶绿体发育的机理研究
- 批准号:31970653
- 批准年份:2019
- 资助金额:52.0 万元
- 项目类别:面上项目
CIA1 (Chloroplast Import Apparatus 1)调控拟南芥营养生长阶段转变的分子机理
- 批准号:31300997
- 批准年份:2013
- 资助金额:22.0 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
相似海外基金
Defining the molecular basis of chloroplast transcription of photosynthetic genes
定义光合基因叶绿体转录的分子基础
- 批准号:
BB/Y003802/1 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 9.28万 - 项目类别:
Research Grant
Molecular architecture and mechanism of the chloroplast's beta-barrel assembly machinery (ChlAM)
叶绿体β-桶组装机器(ChlAM)的分子结构和机制
- 批准号:
EP/Y036158/1 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 9.28万 - 项目类别:
Research Grant
Structure and function of the chloroplast transcription machinery
叶绿体转录机制的结构和功能
- 批准号:
MR/X033481/1 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 9.28万 - 项目类别:
Fellowship
A powerful directed-evolution tool for exploitation of chloroplast engineering biology
用于叶绿体工程生物学开发的强大定向进化工具
- 批准号:
BB/Y008162/1 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 9.28万 - 项目类别:
Research Grant
Conference: 2023 Chloroplast Biotechnology GRC & GRS: Harnessing the SynBio Revolution for Metabolic Engineering and Enhanced Photosynthesis
会议:2023年叶绿体生物技术GRC
- 批准号:
2243932 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 9.28万 - 项目类别:
Standard Grant
A study on division of photosynthetic metabolism associated with the uneven distribution of Rubisco and starch in the chloroplast stromal space
叶绿体基质空间中Rubisco和淀粉分布不均与光合代谢划分的研究
- 批准号:
23H02195 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 9.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Molecular analysis of nuclear factors governing the morphology and segregation chloroplast DNA
控制叶绿体 DNA 形态和分离的核因素的分子分析
- 批准号:
23H02509 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 9.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Elucidation on a transcriptional and post-transcriptional regulation mechanism of the diurnal expression rhythm of chloroplast genes.
阐明叶绿体基因昼夜表达节律的转录和转录后调控机制。
- 批准号:
23K05146 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 9.28万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Rotation 1: Validation of a putative MYB transcription factor involved in chloroplast development
第 1 轮:验证参与叶绿体发育的推定 MYB 转录因子
- 批准号:
2887717 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 9.28万 - 项目类别:
Studentship
RII Track-4:NSF:Chloroplast retrograde signaling during plant immunity: integrating signal transduction and cellular dynamics
RII Track-4:NSF:植物免疫过程中叶绿体逆行信号传导:整合信号转导和细胞动力学
- 批准号:
2329266 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 9.28万 - 项目类别:
Standard Grant