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Developing Softwares for Molecular Phylogenetics

Developing Softwares for Molecular Phylogenetics
开发分子系统发育软件
批准号：
12554037
负责人：
HASEGAWA Masami
金额：
$8.26万
依托单位：
The Institute of Statistical Mathematics
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2000
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2000 至 2002
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-12554037/
关键词：
molecular phylogeneticsmodel misspecificationphylogenetic inferencetree selectiondivergence timemolecular clockadaptive evolutioneutherian mammal多重比較分子進化速度階層モデル共進化集団サイズ遺伝子構造予測SINE法SINE-flanking配列分子時計進化速度の

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It is prerequisite to establish the phylogenetic relations among organises before studying biological evolution and biodiversity. We developed methods for inferring molecular phylogenies based on the likelihood approach and applied them tb various phylogenetic problems ;(1) The effect of model misspecification in phylogenetic inference,(2) Modelling in the phylogenetic inference ofmulti-gene data,(3) Tests of phylogenetic tree selection,(4) Methods for estimating divergence times without assuming a molecular clock,(5) Detecting adaptive molecular evolution,(6) Phylogenetic evolution of eutherian mammals
期刊论文(62)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
N.Arisue, T.Hashimoto, M.Hasegawa et al.: "The phylogenetic position of the pelobiont Mastigamoeba balamuti based on sequences of rDNA and translation elongation factors EF-1a and EF-2"J. Euk. Microbiol.. 49. 1-10 (2002)
N.Arisue、T.Hashimoto、M.Hasekawa 等：“基于 rDNA 序列和翻译延伸因子 EF-1a 和 EF-2 的多生物 Mastigamoeba balamuti 的系统发育位置”J.
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
後藤修: "配列のホモロジーと統計情報を併用した真核生物遺伝子構造の予測"統計数理. (印刷中). (2002)
Osamu Goto：“利用序列同源性和统计信息预测真核基因结构”统计数学（2002 年出版）。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
Y.Zhong, M.Hasegawa et al.: "Detecting evolutionary rate heterogeneity among mangroves and their close terrestrial relatives"Ecol. Lett.. 5. 427-432 (2002)
Y.Zhong、M.Hasekawa 等人：“检测红树林及其陆地近亲之间的进化速率异质性”Ecol。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
H. Shimodaira and M. Hasegawa: "CONSEL : a program for assessing the confidence of phylogenetic tree selection"Bioinformatics. 17. 1246-1247 (2001)
H. Shimodaira 和 M. Hasekawa：“CONSEL：评估系统发育树选择置信度的程序”生物信息学。
DOI： --
发表时间：
期刊：
影响因子： --
作者： []
通讯作者：
共 30 条
    Evolution on islands controlled by bottom-up allochthonous inputs and top-down cascading predation
    • 批准号：
      19H03307
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $6.82万
    • 财政年份：
      2019
    • 负责人：
      HASEGAWA Masami
    • 依托单位：
      Toho University
    Interplay between co-evolution and population dynamics in the predator - prey relationship in the island environments
    • 批准号：
      15H04426
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $9.07万
    • 财政年份：
      2015
    • 负责人：
      HASEGAWA Masami
    • 依托单位：
      Toho University
    A development of approach for the depression and suicidal behavior people with Emotion Modulation Therapy (EMT)
    • 批准号：
      25293463
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $5.24万
    • 财政年份：
      2013
    • 负责人：
      HASEGAWA Masami
    • 依托单位：
      Kanazawa Medical University
    Community assembly and adaptive evolution of prey and predator in insular environment
    • 批准号：
      24570031
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额：
      $3.41万
    • 财政年份：
      2012
    • 负责人：
      HASEGAWA Masami
    • 依托单位：
      Toho University
    海外基金