Identification of tumor driver lncRNAs in myeloid tumors and development of lncRNA-targeting therapies

骨髓瘤中肿瘤驱动lncRNA的鉴定和lncRNA靶向疗法的开发

• 批准号: 22H03100
• 负责人: 合山 進
• 金额: $ 11.15万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2026-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22H03100/
• 关键词: lncRNA; 骨髄系腫瘍; NEAT1; CRISPR/Cas13; 核酸医薬; NONO; Cas13; Split-GFP

DNAから転写されるRNAには、タンパク質をコードするRNA（mRNA）と、タンパク質をコードしないノンコーディングRNA（ncRNA）がある。これまではmRNAが研究の中心だったが、最近の研究でncRNAも様々な生命現象の制御に関与していることがわかってきた。本研究では、長鎖ノンコーティングRNA (long noncoding RNA：lncRNA)の動態を解析するための新しい技術を開発し、またlncRNAを標的とする核酸医薬もしくは低分子化合物を開発する。これまでに、骨髄系腫瘍細胞で高発現している主要なRNAおよびRNA結合タンパクを、OOPS法を用いて同定した。また、パラスペックル構成因子であるNEAT1 (lncRNA)-NONO(RNA結合タンパク)複合体を対象に様々な技術開発を行い、NEAT1-NONO結合を可視化するdCas13/Split-GFPシステム、NEAT1-NONO結合を定量することのできるdCas13/Split-NanoBitシステム、そしてNEAT1-NONO複合体周囲の分子をビオチン化するdCas13/Split-TurboIDシステムを開発した。さらに、dCas13/Split-TurboIDシステムを用いて、NEAT1-NONO複合体と相互作用する分子やゲノム領域の網羅的解析を行った。これらの結果を基に、パラスペックルを中心とする分子ネットワークの全貌を解明すべく進めている。さらに、骨髄系腫瘍におけるIMPDH(GTP合成系の律速酵素)やDTX2(E3ユビキチンリガーゼ)の役割を明らかにした。今後はこれらの成果を基に、lncRNAを標的とした治療法、治療薬の開発を進めていきたい。

DNA is the most important part of RNA, RNA (mRNA) and RNA (ncRNA). This is the center of mRNA research, and recent studies have shown that ncRNA is involved in the control of biological phenomena. In this study, we developed new techniques for the dynamic analysis of long noncoding RNA (lncRNA) and the development of low molecular weight compounds. The high level of RNA expression in tumor cells was determined by the OPS and RNA binding assays. NEAT1 (lncRNA)-NONO(RNA-binding protein) complex target technology development, NEAT1-NONO binding visualization dCas13/Split-GFP system, NEAT1-NONO binding quantification dCas13/Split-NanoBit system, NEAT1-NONO complex molecular cycle development. In addition, the analysis of molecular interaction domain of NEAT1-NONO complex and dCas13/Split-TurboID system was carried out. The results of the study are as follows: In addition, the gene expression of IMPDH(GTP synthase) and DTX2(E3) was also detected. In the future, the development of therapeutic methods and therapeutic drugs based on the results of lncRNA will be promoted.

项目成果

Mitotic perturbation is a key mechanism of action of decitabine in myeloid tumor treatment

• DOI: 10.1016/j.celrep.2023.113098
• 发表时间: 2023-09-26
• 期刊: CELL REPORTS
• 影响因子: 8.8
• 作者: Yabushita，Tomohiro;Chinen，Takumi;Goyama，Susumu
• 通讯作者: Goyama，Susumu

CRISPR-dCas9 activation全ゲノムスクリーニング法による骨髄系腫瘍に対するDecitabineの作用機序の解明

利用CRISPR-dCas9激活全基因组筛选方法阐明地西他滨对骨髓瘤的作用机制

• 发表时间: 2023
• 作者: 藪下 知宏;知念 拓実;西山 敦哉;南谷 泰仁;中西 真;北川 大樹;北村 俊雄;合山 進
• 通讯作者: 合山 進

健康長寿実現のために、CHIPとどう向き合うか？

我们该如何对待CHIP才能实现健康长寿？

• 发表时间: 2022
• 作者: 藪下 知宏;知念 拓実;西山 敦哉;南谷 泰仁;中西 真;北川 大樹;北村 俊雄;合山 進;合山進;合山進
• 通讯作者: 合山進

Identification of tumor regulators in myeloid neoplasms using in vivo CRISPR-Cas9 screening

使用体内 CRISPR-Cas9 筛选鉴定骨髓肿瘤中的肿瘤调节因子

• 发表时间: 2022
• 作者: Yu-Hsuan Chang;Takeshi Fujino,Toshio Kitamura;Susumu Goyama2
• 通讯作者: Susumu Goyama2

Decitabine induces excessive DNA-DNMT1 crosslinks and perturbs faithful mitosis of myeloid tumors

地西他滨诱导过度的 DNA-DNMT1 交联并扰乱骨髓瘤的忠实有丝分裂

• 发表时间: 2022
• 作者: Tomohiro Yabushita;Shuhei Asada;Keita Yamamoto;Naru Sato;Yutaka Enomoto;Yosuke Tanaka;Tomofusa Fukuyama;Atsuya Nishiyama;Makoto Nakanishi;Toshio Kitamura;Susumu Goyama
• 通讯作者: Susumu Goyama