DNA結合タンパク質に関連したHg・Znペプチド錯体の合成・NOESY・XAFS

与 DNA 结合蛋白相关的 Hg/Zn 肽复合物的合成/NOESY/XAFS

• 批准号: 04225231
• 负责人: 山村 剛士
• 金额: $ 0.96万
• 依托单位: Tokyo University of Science
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 1992
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1992 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-04225231/
• 关键词: DNA結合金属蛋白質; ペプチド亜鉛錯体; XAFS; NOESY; 距離幾何学; 分子動力学; ペプチド液相合成

1.ペプチドとしてBoc-Cys-Pro-Leu-Cys-Gly-Ala-OMe,1,Boc-Cys-Pro-Leu-Cys-Cly-Ala-Cys-OMe,2,を合成した。Boc-Cys-Pro-Leu-Cys-OMe,3,及びこれらの配位子を用いて亜鉛、カドミウムと水銀錯体の合成を試み、(1)・Hgを単離・精製した。又、XAS測定とNMR測定に耐える(1)・Zn,4,(2)・Zn,5,と(3)・Zn,6,の溶液調整条件を見いだした。同様に(1)・Cd,7,(2)・Cd,8,(3)・Cd,9,の調整条件も見いだした。2.亜鉛錯体4,5,6のXAFS(EXAFS,XANES)を解析し、種々のモデル化合物と比較・検討して、4が4配位、6が5配位であることを見いだした。それぞれのZn-S結合距離も明確にした。一方、COSY等による各錯体のペプチド部分の ^1H-, ^<13>C-バンドの帰属は現在進行中である。カップリング定数、水素結合の同定NOESYからの水素原子間距離情報抽出はまだ済んでいない。3.AMBERによる分子動力学計算ため、金属イオンと周辺配位子に関する諸パラメター(電荷分布、van der Waals半径、力の定数)を分子軌道法(MOPAC)等を用いて決定した(金属イオンに関するパラメターを露に求めて応用して例は分子動力学では極めて少ない)。次いでこれらの値を用いてBoc-Cys-Pro-Leu-Cys-OMeの2配位及び2配位水銀錯体動力計算を行い、距離幾何学の結果と比較して、最も確実な構造がその共通構造であることを確認した。又、Zinc Finger蛋白質やブレドキシン中の金属イオン局所構造とわぼ一致することを確認した。現在、ペプチド亜鉛錯体4、5、6の分子動力学計算を行っている。

1. Boc-Cys-Pro-Leu-Cys-Gly-Ala-OMe,1,Boc-Cys-Pro-Leu-Cys-Cly-Ala-Cys-OMe,2, 2. Boc-Cys-Pro-Leu-Cys-OMe,3, and 3-D ligands were used in the synthesis of lead, mercury and mercury complexes, and (1) Hg was isolated and purified. Also, XAS determination and NMR determination are resistant to (1)·Zn,4,(2)·Zn,5,(3)·Zn,6, and solution adjustment conditions are described. The same is true for (1)·Cd,7,(2)·Cd,8,(3)·Cd,9, and the adjustment conditions are set forth below. 2. XAFS(EXAFS,XANES) analysis of lead complexes 4,5,6 and their species were compared with those of lead complexes 4,5 and 6. The Zn-S binding distance is very clear. A side, COSY, etc., each wrong body of the selection part of the ^1H-, ^<13>C-, the genus is now in progress. The information of the distance between water atoms is extracted from the constant number of water atoms and the constant number of water atoms. 3. Molecular dynamics calculations for metals and peripheral ligands are determined by molecular orbital method (MOPAC). 2-coordinate and 2-coordinate mercury complex dynamometer calculations of Boc-Cys-Pro-Leu-Cys-OMe were carried out, and the results of distance geometry were compared and confirmed. In addition, Zinc Finger protein protein in the metal structure of the body is confirmed. Now, molecular dynamics calculations of the selected compounds 4, 5 and 6 are carried out.

项目成果

Takeshi YAMAMURA: "Tetrakis(thiolato)nickelate(II),[Ni(RS)_4]^<2->;Ligand Dissociation and Electronic Spectra" Bull.Chem.Soc.Jpn.,. 65. 1799-1806 (1992)

Takeshi YAMAMURA：“Tetrakis(thiolato)nickelate(II),[Ni(RS)_4]^<2->;配体解离和电子光谱”Bull.Chem.Soc.Jpn.,。