亜鉛タンパク質のサイトコア;ペプチド錯体モデルの動的挙動
亜鉛タンパク質のサイトコア;ペプチド錯体モデルの動的挙動
批准号:
06640734
负责人:
山村 剛士
金额:
$1.34万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
财政年份:
1994
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1994 至 --
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英文摘要
[成果]当初計画した4個の亜鉛錯体の内,この1年間に精製に成功したのは,Boc-Cys-Pro-Leu-Cys-OMeとBoc-Cys-Pro-Leu-Cys-Gly-Ala-OMeの亜鉛錯体の二つである。特に前者の亜鉛錯体は最小ユニットとして重要な出発点になるための多方面からの研究を進めた。即ち,1)室温から低温にわたるEXAFS実験からこの亜鉛錯体が本質的に4配位と5配位の何れも取り得るものであり,溶液中ではこれらの配位幾何の間に平衡が存在すること,2)両者のペプチド錯体のモデルとして[Zn(SMe)_2(CH_3COCH_3)_2]を始めとする数種の錯体について分子軌道法計算(MNDO法,ab initio法)による構造最適化を行なった。その結果,5配位は不安定で4配位テトラヘドラルが安定形である。又,MNDO/ESP計算から得た電荷とab initio/ESP計算から得た電荷の間の相関関係を調べ,良い直線的相関があることを見い出したが,傾は電荷に依存することがわかった。3)分子動力学計算の結果,配位幾何及びコンフォーメーションとも媒質の誘電率に大きく左右される。距離に依存する誘電率を使用するとε_<ij>=1.6R_<ij>で最適の水素結合距離及びZn-O距離(第五配位原子)が得られた。長時間の動力学計算から,4配位と五配位の間に平衡があり,そのためこのZn-O距離は非対称分布となるが,この結果はEXAFSの解析から得られた第三シェル(第一シェル,第二シェルは各ZnO_2,ZnS_2,第三シェルはZn-S又はZn-Oと帰属された)の位相シフトのエネルギー依存性をうまく説明出来ることがわかった。この研究によって,Zinc Fingerに於ける亜鉛局所構造の動的挙動を理解するための知識を得ることが出来た。しかし,塩基やリン酸エステルなど他の配位成分の存在の効果を系統的に調べることは諸種の要因により遂行出来なかった。
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专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Takeshi YAMAMURA: "Conformation Control of Model Peptides by Metal Ions 1:" J.Phys.Chem.(in press). (1995)
Takeshi YAMAMURA:“金属离子对模型肽的构象控制 1:”J.Phys.Chem.(印刷中)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
高酸化状態Mnクラスターのシロキサンネットによる被覆と酸素発生触媒化
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批准号:19655021
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.05万
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财政年份:2007
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负责人:山村 剛士
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依托单位:
有機無機複合光成膜の合成・アミノ酸型ポルフィリンオリゴマーの利用
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批准号:17029060
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.56万
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财政年份:2005
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负责人:山村 剛士
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依托单位:
DNA結合蛋白質を利用したナノドット・分子素子の自由配列と量子細線の形成
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批准号:16651051
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.37万
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财政年份:2004
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负责人:山村 剛士
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依托单位:
電極・界面上への光合成エネルギー変換モデル構築.ポルフィリンアミノ酸含有ペプチド
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批准号:15033266
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.39万
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财政年份:2003
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负责人:山村 剛士
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依托单位:
電極・界面上への光合成エネルギー変換モデル構築.ポルフィリンアミノ酸含有ペプチド
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批准号:14050091
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.86万
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财政年份:2002
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负责人:山村 剛士
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依托单位:
3中心ヘリツクスバンドルポルフィリン錯体の合成:人工電子伝達蛋白質
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批准号:07640763
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1995
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负责人:山村 剛士
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依托单位:
DNA結合蛋白質に関連したHg・Znペプチド錯体の合成・NOESY・XAFS
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批准号:05209227
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1993
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负责人:山村 剛士
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依托单位:
鉄硫黄クラスターのカプセル化-嵩高官能基付きカリックスアレン配位子の利用
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批准号:05640635
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1993
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负责人:山村 剛士
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依托单位:
DNA結合タンパク質に関連したHg・Znペプチド錯体の合成・NOESY・XAFS
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批准号:04225231
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.96万
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财政年份:1992
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负责人:山村 剛士
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依托单位:
DNA結合蛋白質に関連したHg・Znペプチド錯体の合成・NOESY・XAFS
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批准号:03241225
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.22万
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财政年份:1991
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负责人:山村 剛士
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依托单位:
ヒドロゲナ-ゼ・COデヒドロゲナ-ゼのサイトアナログ合成
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批准号:03640528
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1991
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负责人:山村 剛士
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依托单位:
ヒドロゲナーゼの生物無機化学-高酸化状態ニッケルチオレートの合成とその性質
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批准号:62540475
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1987
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负责人:山村 剛士
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依托单位:
鉄‐硫黄クラスター活性点近傍の化学的修飾による反応制御
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批准号:59540385
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$0.77万
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财政年份:1984
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负责人:山村 剛士
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依托单位:
界面活性化金属ポルフィリン及び界面活性化ビスポルフィリンの合成とその光化学の研究
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批准号:X00095----564192
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (D)
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资助金额:$0.29万
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财政年份:1980
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负责人:山村 剛士
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依托单位: