hnRNP蛋白質の機能,構造相関

hnRNP蛋白的功能和结构关系

• 批准号: 05265208
• 负责人: 石川 冬木
• 金额: $ 2.24万
• 依托单位: Tokyo Institute of Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 1993
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1993 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-05265208/
• 关键词: hnRNP; RNA結合蛋白質; RNA結合ドメイン; cDNA

本年度において、我々はhnRNP DのcDNAをクローニングし、その一次構造を決定すると共に、アミノ酸配列から予想されるhnRNP Eの一次構造と比較を行った。その結果、以下のことが明らかになった。1.hnRNP DのcDNAは、既に肝炎ウイルスのエンハンサーに結合する蛋白質のcDNAとして報告されたものと一致する。ただし、この報告されたcDNAは、全長のうち、5'端約500塩基欠失しており、また、一塩基の配列の読み間違えのがあるために、予想されたアミノ酸配列のフレームが異なっている。2.我々のクローニングしたhnRNP DのcDNAは約1.8kbの長さを持つ。予想されるアミノ酸配列には二つのRBDが存在する。また、アミノ端にはU1 snRNP 70kD蛋白質やtransformer蛋白質にも見られる塩基性アミノ酸の多い領域が見られた。カルボキシル端にはRGGboxが3個存在する。このように、本蛋白質は、RBDの他に、少なくとも二つのドメインを有している可能性がある。3.hnRNP Eのアミノ酸配列は、既に報告されているtype A/B hnRNP proteinと完全に一致しているため、この二つは同じ遺伝子産物である可能性が高い。報告されているtype A/B hnRNP蛋白質ののcDNAと上記の我々のhnRNP D cDNAと比較すると、全長にわたって、50%以上のホモロジーがあり、互いによく似ている。また、type A/B cDNAから予想されるアミノ酸配列によれば、これもhnRNP Dと同じように、二つのRBDとRGG motifからなり、構成にも類似性があった。現在、この蛋白質のcDNAをクローニング中である。

This year's において, I 々はhnRNP DのcDNA をクローニングし, そのprimary structure をdetermination すると公に, アミノacid alignment から yu want to されるhnRNP E's one-time structure and comparison are the same.そのRESULTS、The following のことが明らかになった. 1.hnRNP DのcDNAは, both hepatitis virus and protein binding protein cDNA report are consistent.ただし、このreport されたcDNAは、Full length のうち、About 500 bases are missing at the 5' end しており、また、一The base of the base of the arrangement of the の読みbetween violation of the えのがあるために, and the thought of the acid arrangement of the のフレームがisoなっている. 2. My 々のクローニングしたhnRNP DのcDNA is about 1.8kb long and さをhold. I want to know the existence of the されるアミノ acid combination には二つのRBDが.また、アミノ多にはU1 snRNP 70kD protein やtransformer protein にも见られる塩 Basic アミノ acid の多い地が见られた.カルボキシルENDにはRGGboxが 3 existする.このように, 本proteinは, RBDのTAに, 小なくとも二つのドメインを有しているpossibilityがある. 3.hnRNP The protein is completely consistent and the product is highly likely to be the same product. Reportされているtype A/B hnRNP proteinののcDNAと上记の我々のhnRNP D cDNA compares the DNA, full-length DNA, 50% or more DNA, and mutual DNA.また, type A/B cDNA からyu want されるアミノ acid ligation によれば, これもhnRNP Dと同じように, 二つのRBDとRGG Motifからなり, compositionにもsimilarityがあった. Now, このproteinのcDNAをクローニング中である.

项目成果

Fuyuki Ishikawa: "Nuclear proteins that bind the pre-mRNA 3' splice site sequence r(UUAG/G)and the human telomeric DNA sequence d(TTAGGG)n" Mol.Cell.Biol.13. 4301-4310 (1993)

Fuyuki Ishikawa：“结合前体 mRNA 3 剪接位点序列 r(UUAG/G) 和人类端粒 DNA 序列 d(TTAGGG)n 的核蛋白”Mol.Cell.Biol.13。