マラニアゲノム計画・第4クロモソームのP1ファージ整列ライブラリーの作成

Malania基因组计划：第四染色体P1噬菌体比对文库的创建

• 批准号: 09270101
• 负责人: 渡辺 純一
• 金额: $ 0.96万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 1997
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1997 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-09270101/
• 关键词: マラリア; P1ファージ; ライブラリー

近年、生物の前ゲノムの塩基配列を決定しようというゲノムプロジェクトが、急速な進歩を見せている。病原微生物ゲノムの研究は、とりわけ医学的に多大な成果が期待される分野である。マラリア原虫のゲノムは、3000万塩基対が14本のクロモソームに分かれて存在する。全塩基配列の決定を目的とするゲノム計画には、大量塩基配列解読に先だって、数年間にわたる準備段階が必要である。我々は、独自の戦略として整列化P1ファージライブラリーの作成を進めてきた。P1ファージが保持可能なDNAサイズは、約100kbとコスミドの2倍で、ゲノム全体をカバーするライブラリーの作成には特に有利と考えられる。1 熱帯熱マラリア原虫のゲノム研究は、3D7株を標準株として用いることで国際的に合意がなされた。本株を樹立者のWalliker博士より直接、入手し、原虫を大量培養した。これを材料として田代が開発した方法を使い、クロモソームサイズ(0.8〜3Mb)のDNAを含む巨大DNAの精製に成功した。同時にP1ファージ作成の条件を決定し、現在、原虫DNAについてライブラリーを作成中である。今後、我々が作成したプローブを用いて整列化を進める計画である。ゲノム研究は、DNA塩基配列の決定→遺伝子発現の解析→遺伝子機能の解明→生物学の本質の理解へと発展していく。2 我々は、遺伝子の発現についても、研究を行っている。赤内型原虫の材料として、cDANライブラリーを作成し、これまでに500クローンの塩基配列を決定した。データバンクとの比較によって約3分の2が新規遺伝子と判明した。詳細な分析は現在進行中であるが、その中にマラリアワクチン候補分子が含まれている可能性が期待されている。

In recent years, the basic arrangement of biological organisms has been determined, and rapid progress has been made. Pathogenic microorganism research is expected to be successful in medicine. 14 million base pairs of protozoa exist. To achieve the goal of determining the full base configuration, a project plan must be prepared in advance for a large number of base configuration solutions, and preparation stages over several years are necessary. I want to make sure that I have a complete list of P1 's. P1: The DNA fragment is about 100kb long and twice as long as it is possible to maintain the DNA fragment. 1. The study of heat transfer protozoa, 3D7 strains, and international consensus Dr. Walliker, the founder of this plant, started directly and cultured in large quantities. The method of developing the material and the method of purifying the DNA containing large DNA were successfully carried out. At the same time, the conditions for the preparation of P1 are determined, and the protozoan DNA is prepared. From now on, we will make a plan to integrate the system. The study of DNA sequence determination → analysis of gene expression → elucidation of gene function → understanding of the nature of biology → development 2. I am not interested in the development of genetic materials, and I am interested in research. The material of the red protozoan is prepared according to the principle of "cDAN", and the matrix arrangement of the red protozoan is determined according to the principle of "cDAN". The comparison between the two groups is about 3 minutes and 2 minutes. Detailed analysis is currently underway, and the candidate molecules are expected to be included.

项目成果

Junichi Watanabe: "cloning and characterization of heat shock protein Dna J homolognes from Plasmodiwn faleipamm" Molecular and Biochemical Parasitdogy. 88. 253-258 (1997)

Junichi Watanabe：“来自法莱帕姆疟原虫的热休克蛋白 Dna J 同源物的克隆和表征”分子和生化寄生虫学。