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全長cDNAライブラリを用いたアピコンプレクサ原虫の比較ゲノム解析

使用全长 cDNA 文库对 Apicomplexa 原生动物进行比较基因组分析

基本信息

批准号：
17018012
负责人：
渡辺純一
金额：
$ 3.84万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17018012/
关键词：
マラリア原虫トキソプラズマ原虫遺伝子発現

项目摘要

アピコンプレクサ門にはトキソプラズマ原虫、マラリア原虫などが属し、人畜の寄生虫として重要な位置を占めている。これらの原虫は、微細構造の類似性は極めて高く、マラリア原虫が脊椎動物体内では、肝臓細胞と赤血球に寄生増殖するのに対し、トキソプラズマ原虫は、マクロファージ系の細胞内で増殖し、神経系細胞にも感染する。そして、先天性感染時には、重篤な奇形を来す。我々は、これまでに熱帯熱マラリア原虫(Plasmodium falciparum)、ネズミマラリア原虫(P.yoelii)、トキソプラズマ原虫(Toxoplasma gondii RH株)について、オリゴキャップ法により全長cDNAライブラリを作成し、その解析を進めてきた。今年度は、マラリア原虫について、弱毒株を中心に4種類の全長cDNAライブラリを作製し、約2万のEST配列決定を行なった。さらに、昨年度作製したトキソプラズマ原虫(Toxoplasma gondii RH株)全長cDNA約1万クローンから、1300クローンを選び、全長シークエンスを行った。この結果得られたシークエンスを、公開された、トキソプラズマ原虫、マラリア原虫のゲノムシークエンス上にマップし、エキソン-イントロン構造を確定すると共に、発現遺伝子の転写開始点のマップを精密化し、Full-malaria(http://fullmal.ims.u-tokyo.ac.jp)上にて公開した。同時に、多数のESTについてもゲノム上の位置を決定し表示した。

The most important position of parasites in animals and humans is in the human body. These protozoa, microstructural similarities, and high levels of protozoa are found in vertebrates, liver cells, and erythrocytes. Congenital infection occurs when the disease is severe. The full length cDNA of Plasmodium falciparum, P. yoelii, Toxoplasma gondii RH strain was prepared and analyzed by PCR. This year, four full-length cDNA fragments of attenuated strains were produced, and about 20,000 EST sequences were determined. The full-length cDNA of Toxoplasma gondii RH strain is about 10,000, 1300, and the full-length cDNA of Toxoplasma gondii RH strain is about 10,000. The results were published on Full-malaria (http://www.example.com) and published on the website of Full-malaria(fullmal.ims.u-tokyo.ac.jp). At the same time, most of the ESTs are located on the top of the list.