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全長cDNAライブラリを用いたアピコンプレクサ原虫の比較ゲノム研究

使用全长 cDNA 文库对顶复门原生动物进行比较基因组研究

基本信息

批准号：
18017008
负责人：
渡辺純一
金额：
$ 5.12万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2007
资助国家：
日本
起止时间：
2007 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

ニワトリの消化管の寄生原虫として養鶏上重要性の高いEimeria tenellaについて、merozoiteからoligo-cap法で全長cDNAライブラリを作成した(英国動物衛生研究所との共同研究)。トキソプラズマ原虫に近縁で、ウシの習慣性流産の原因として獣医学的に重要なNeospora caninumについて、tachyzoiteから全長cDNAライブラリを作成し、1万クローンの両端ワンパスシークエンスを決定した(帯広畜産大学との共同研究)。アピコンプレクサ原虫の比較ゲノム解析において寄生原虫の外部対象として有用で、熱帯地方で多数の患者を擁し医学的に重要性の高い赤痢アメーバEntoamoeba histolyticaと、赤痢アメーバのシスト形成の研究に用いられるヘビアメーバE.invadensについて、trophozoite(栄養体)から全長cDNAライブラリを作成し、1万クローンの両端ワンパスシークエンスを決定した(慈恵医大との共同研究)。同様にぜん虫として比較ゲノム解析に有用で我が国に患者を抱えるEchinococcus multicolularisについて、幼虫から作成した全長cDNAライブラリの1万クローンの両端ワンパスシークエンスを決定した(北海道大学獣医学部、理化学研究所との共同研究)。同様に有鉤条虫Taenia soliumのlarvaから全長cDNAライブラリを作成、1万クローンの5'端ワンパスシークエンスを決定した(メキシコ大学との共同研究)。今後研究の重点は得られたシークエンスデータの解析に移ると思われる。そこで、バイオインフォマティクスの解析チームの形成に努めた。ゲノム塩基配列の解読が進み、また、全長クローンの全長シークエンスが効率よく解読可能になったことから、本格的に比較ゲノム解析を行う基盤が整ってきた。

Eimeria tenella is highly important for the development of parasites in the digestive tract. The merozoite oligo-cap method is used to generate full-length cDNA.(Joint study by the Institute of Animal Health, UK). The cause of recurrent abortion of protozoa is important in medicine. Neospora caninum is produced by tachyzoite and full-length cDNA is produced. 10,000 copies of protozoa are produced by tachyzoite. The study of the formation of Entoamoeba histolytica and red dysentery histolytica, which is of great importance to medical science, has been carried out in the study of the formation of E.invadens, trophozoite(trophozoite) and full-length cDNA. 1 million yuan to determine the end of the year (Cixi Medical University and joint research) (Joint research by the Faculty of Medicine and the Institute of Physical Chemistry, Hokkaido University) In the same way, Taenia solium's larva fragment was created and its 5'terminal cDNA fragment was determined (joint study of Taenia solium University). The future research focus is on the analysis of the problem. The analysis of the formation of the group is carried out in the following ways: For example, if the base array is selected, the total length of the base array will be selected.