連続体理論による大量アミノ酸配列に対する物理知識情報処理

利用连续介质理论对大量氨基酸序列进行物理知识信息处理

基本信息

  • 批准号:
    09272209
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.73万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 财政年份:
    1997
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    1997 至 无数据
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

ゲノム計画から得られるデータは多様な側面を持っている。アミノ酸配列のデータに限っても進化的な側面、機能的な側面、構造的な側面と多岐にわたる。これに応じて、データ処理も様々な手法を取り入れる必要がある。私達は、これまで物理学的な考え方(「分子に働く力によって、タンパク質の立体構造が形成される」ということ)にこだわって、アミノ酸配列データの情報処理法を工夫し、主として膜タンパク質の解析を行ってきた。その結果、分子間相互作用のあり方を正しく理論に取り込み、二次構造を連続体とみなす単純化を行うと、二次構造も三次構造も現実的な時間で予測が可能であることが分かってきた。「ゲノムサイエンス」では大量のアミノ酸配列が産み出されるが、それを現実的な時間内で解析するには、連続体の枠組みで計算していくことが最も適切であると私達は考えている。本研究では、構造形成のもっとも基本的な段階として、アミノ酸配列から膜タンパク質への分岐を高精度に予測できる方法を開発した。そして、このシステムを一般に利用可能な形にするためにWWW上のシステムとして構築した。
If you want to make a plan, you can get a lot of information about how to do it. The quality of the raw materials is limited to the improved ones, the mechanical ones, and the poly-bifurcated ones. Please tell me that you need to know how to use the necessary information. In the field of physics, there is a lot of research in physics (molecular physics, molecular physics, stereoscopic physics, physics, chemistry, physics, chemistry The results of the experiment, the theory of the intermolecular interaction, the time of the second generation, the second generation and the third generation of the operating system, the theory of the interaction between molecules and the theory of the interaction between molecules and the theory of intermolecular interaction. There are a large number of data sets that can be used to analyze the data in the time frame of the system, and to calculate the number of users. The purpose of this study is to establish a method for the development of high-precision and high-precision methods for the determination of bifurcation in thin films. In general, you can take advantage of the possibility that you may have a problem on the WWW.

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Keiko Suzuki,Taiji Nakae and Shigeki Mitaku: ""Flocculation and Membrane Binding of Outer Membrane Protein F,Porin,at Acidic pH"" Japanese Journal of Applied Physics. 37,4(in press). (1998)
Keiko Suzuki、Taiji Nakae 和 Shigeki Mitaku:“酸性 pH 条件下外膜蛋白 F、孔蛋白的絮凝和膜结合”,《日本应用物理学杂志》。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Akinori Etoh,Hiroyasu Itoh and Shigeki Mitaku: ""Light-Induced Denaturation of Bacteriorhodopsin Just above Melting Point of Two-Dimensional Crystal"" Journal of Physical Society of Japan. 66,4. 975-978 (1997)
Akinori Etoh、Hiroyasu Itoh 和 Shigeki Mitaku:“细菌视紫红质在二维晶体熔点之上的光诱导变性”,日本物理学会杂志。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Takatsugu Hirokawa,Seah Boon-Chieng and Shigeki Mitaku: ""SOSUI:Classification and Secondary Structure Prediction System for Membrane Proteins"" Bioinformatics. 1(in press). (1998)
Takatsugu Hirokawa、Seah Boon-Chieng 和 Shigeki Mitaku:“SOSUI:膜蛋白的分类和二级结构预测系统”生物信息学。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Masayuki Masuko,Shinya Toyoda,Makiko Suwa,Shigeki Mitaku,Akira Shimazu and Hiroyuki Ohtani: ""Optimal Configuration of Pyrene Excimer Induced by the Excimerforming Two-Probe Nucleic Acid Hybridization Method"" Nucleic Acids Symposium Series. 37. 83-84 (19
Masayuki Masuko、Shinya Toyoda、Makiko Suwa、Shigeki Mitaku、Akira Shimazu 和 Hiroyuki Ohtani:““准分子形成双探针核酸杂交方法诱导的芘准分子的优化构型””核酸研讨会系列。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
広川貴次、美宅成樹: "「生体高分子のつくる高次構造と機能」" 応用物理. 66,10. 1098-1101 (1997)
Takatsugu Hirokawa,Shigeki Miyake:“生物聚合物创造的高阶结构和功能”应用物理学 66,10 (1997)。
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  • 发表时间:
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  • 通讯作者:
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作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了