バクテリオロドプシンの変性キネティクス
バクテリオロドプシンの変性キネティクス
批准号:
02680218
负责人:
美宅 成樹
金额:
$1.34万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
财政年份:
1990
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1990 至 --
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膜タンパク質系は機能的に大変高度なものが多い。しかし、膜タンパク質の構造形成についてはまだ情報が乏しい状態である。つまり、X線回析など構造解析が進んでいないだけではなく、構造形成機構を調べるための変性実験などもまだほとんで行われていない。そこで本研究では、バクテリオロドプシンを例として、膜タンパク質の変性挙動を詳細に調べ、膜タンパク質の立体構造形成機構を明らかにすることを目的としている。変性実験において重要なことは、次の2つのことを明らかにすることである。1つは変性状態の構造がどういう構造をとっているか、もう1つは変性するときにどういう結合が切れるかということである。前者、つまり変性状態の構造の特徴を明らかにするには円二色性(CD)、蛍光、光吸収などのスペクトル測定を用いる。バクテリオロドプシンはレチナ-ルを含んでおり、その光吸収だけでも変性点を検出することができる。そして、二次構造の有無、三次構造の有無などは主としてCD測定により評価する。後者には、親水基や疎水基などが異なる種々の有機溶媒を用い、それらの比較から相互作用を推定する。平衡状態の研究から、アルコ-ルなどの有機溶媒による変性には膜内の水素結合性基の濃度が本質的であり、変性時には三次構造が壊れることがわかった。このことから、三次構造の形成には水素結合が重要である。さらに、熱変性のキネティクスの測定を種々の温度で行った結果、活性化エネルギ-は約30kcal/molであった。それを水素結合の数に換算すると、10個くらいとなり、最近わかったバクテリオロドプシンの分子構造からの評価とほぼ同じである。このことからも膜タンパク質の立体構造の形成には膜内の水素結合が重要であるということが確認された。
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Shigeki Mitaku,Fumio Kukita and Michiki Kasai: "Denaturation of Membrane Proteins:Ion Channel,CalsiumーATPase and Bacteriorhodopsin" Protein Structural Analisis,Folding and Design Ed.Masahiro Hatano,Japan Scientific Society Press(Tokyo) Elsevier(Amsterdam)
Shigeki Mitaku、Fumio Kukita 和 Michiki Kasai:“膜蛋白的变性:离子通道、钙-ATP 酶和细菌视紫红质”蛋白质结构分析、折叠和设计版,日本科学学会出版社(东京)爱思唯尔(阿姆斯特丹)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Norimitu Hrose,Kazunori Yamamoto and Shigeki Mitaku: "Ultrasonic Measurement of Lipid Bilayer Transition in The Presence of Melittin" Japan.J.Appl.Phys.29ー1. 25 (1990)
Norimitu Hrose、Kazunori Yamamoto 和 Shigeki Mitaku:“蜂毒肽存在下脂质双层转变的超声测量”Japan.J.Appl.Phys.29-1 (1990)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Makiko Suwa,Shigeki Mitaku,Kazuko Shimizu and Tatsuji Chuman: "Probe Helix Method of Molecular Energy Calculation for Estimating the Amphiphiliciticity of Transmembrane Helices" Biophys.J.
Makiko Suwa、Shigeki Mitaku、Kazuko Shimizu 和 Tatsuji Chuman:“用于估计跨膜螺旋两亲性的分子能量计算探针螺旋法”Biophys.J。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Shigeki mitaku,Sayoko Ishido,Yosimi Hirano,Hiroyasu Itoh,Ryouichi Kataoka and Nobuhiko Saito: "Hydrophobic Core of MoltenーGlobule State of Bovine Carbonic Anhydrase B" Biophys.Chem.
Shigeki mitaku、Sayoko Ishido、Yosimi Hirano、Hiroyasu Itoh、Ryouichi Kataoka 和 Nobuhiko Saito:“牛碳酸酐酶 B 熔球状态的疏水核心”Biophys.Chem。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Makiko Suwa,Shigeki Mitaku,Kazuko Shimizu and Tatsuji Chuman: "Probe Helix Method of Molecular Energy Calculation for Estimating the Amphiphiliciticity of Transmembrane Helices" Biophys.J.Masahiro Hatano:
Makiko Suwa、Shigeki Mitaku、Kazuko Shimizu 和 Tatsuji Chuman:“用于估计跨膜螺旋两亲性的分子能量计算的探针螺旋方法”Biophys.J.Masahiro Hatano:
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
ホモロジーのないアミノ酸配列からのタンパク質構造・機能情報の抽出
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批准号:12024208
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.34万
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财政年份:2001
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负责人:美宅 成樹
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依托单位:
ホモロジーのないアミノ酸配列からのタンパク質構造・機能情報の抽出
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批准号:11149208
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.6万
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财政年份:1999
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负责人:美宅 成樹
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依托单位:
ホモロジーのないアミノ酸配列からのタンパク質構造・機能情報の抽出
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批准号:10168208
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.92万
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财政年份:1998
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负责人:美宅 成樹
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依托单位:
連続体理論による大量アミノ酸配列に対する物理知識情報処理
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批准号:09272209
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.73万
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财政年份:1997
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负责人:美宅 成樹
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依托单位:
膜タンパク質立体構造予測システム(MAKU)の開発とWWWへの公開
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批准号:08558077
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$6.53万
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财政年份:1996
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负责人:美宅 成樹
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依托单位:
連続体理論による大量アミノ酸配列に対する物理知識情報処理
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批准号:08283206
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.6万
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财政年份:1996
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负责人:美宅 成樹
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依托单位:
生体膜を中心とした生体物質のゆらぎに関する力学的研究
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批准号:07236211
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.02万
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财政年份:1995
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负责人:美宅 成樹
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依托单位:
ハイブリッド型超音波スペクトル自動測定装置
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批准号:57880036
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项目类别:Grant-in-Aid for Developmental Scientific Research
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资助金额:$2.56万
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财政年份:1982
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负责人:美宅 成樹
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依托单位:
透析型差動超音波音速計を用いた生体膜に対する薬物の効果の研究
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批准号:X00210----278112
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.19万
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财政年份:1977
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负责人:美宅 成樹
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依托单位:
海外基金