新しいGC配列特異的DNA結合分子の開発と金属イオンによる結合の制御

开发新的 GC 序列特异性 DNA 结合分子并控制金属离子的结合

• 批准号: 09235227
• 负责人: 佐々木 茂貴
• 金额: $ 1.22万
• 依托单位: Kyushu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 1997
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1997 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-09235227/
• 关键词: DNA結合分子; ジアミノビステトラヒドロフラン; ジアミノフラン; DNA配列特異的結合; 認識分子; 遺伝子発現制御; 金属錯体

平成9年度はdiaminoBis-THF化合物(2)のアミノ基の立体化学が(R,R),(S,S)のものを選択的に合成した。また、diamino-bisfuran化合物(3)はアミノ基の立体化学は混合物としてアルキル鎖の長さの異なるリガンドを合成した。このように合成したリガンドdiaminoBis-THF(2)およびdiamino-bisfuran化合物(3)とDNAとの相互作用を数種類の2本鎖DNAを用いて測定した結果、以下のことが明らかになった。1)(R,R)-2はGC-richの2本鎖DNAを選択的に安定化し、C-G:C-rich3本鎖DNAも安定化した。2)(R,R)-2とGCrichなDNAとの結合はNaCl緩衝液中よりKCl緩衝液中の方が速やかに起こった。3)立体異性体の(S,S)-2はこのような安定化効果は全く見られず、配位子の立体化学がDNA認識に重要であることが示された。4)(R,R)-2はGC-richな2本鎖DNAとの相互作用によって大きな構造変化を引き起こした。5)diamino-bisfuran化合物(3)では選択性の転換が行われ、AT配列選択的な2本鎖DNAの安定化を示した。6)短いアルキル鎖を持つdiamino-bisfuran化合物(3)は全く2本鎖DNAを安定せず、DNA結合における長鎖アルキル基の重要性が示された。以上のように、類似する骨格のdiaminobis-THF(2)およびdiamino-bisfuran化合物(3)が全く異なる配列選択性を持ち、それぞれ選択的にGC-richDNAおよびAT-richDNAを認識できることが明らかになった。これらの部分は遺伝子発現制御で重要な配列によく見られることから、遺伝子発現の阻害を行う分子としての展開が期待される。

The stereochemistry of diaminoBis-THF compound (2) and its derivatives (R,R),(S,S) were synthesized in 2009. The stereochemical mixtures of the diamino-bisfuran compounds (3) and (4) were synthesized. Diaminobis-THF(2) and diamino-bisfuran compounds (3) were synthesized and the DNA interactions between them were determined. 1)(R,R)-2 is stabilized by the selection of GC-rich 2-basic DNA, and C-G:C-rich3-basic DNA is stabilized. 2)(R,R)-2 GCrich DNA binding in NaCl buffer in KCl buffer. 3)The stereochemistry of the (S,S)-2 ligand is important for DNA recognition. (4)(R,R)-2 GC-rich DNA interaction in the structure of large changes in the beginning of the game. 5)Diamino-bisfuran compound (3) is shown to be stable in both selective and at-selective DNA sequences. 6)The importance of the long chain in DNA binding and DNA stability was demonstrated for the short chain in diamino-bisfuran compounds (3). The above compounds are similar to diaminobis-THF(2) and diamino-bisfuran compounds (3). Some of these factors are important for the development of genetic control systems.

项目成果

Nagatsugi,Fumi: "2-Aminopurine Derivatives with C6-Substi tuted Olefin as Novel Cross-Linkig Agents and the Synthesis of the Corresponding b-Phosphoramidite Precursors" Tetrahedron. 53(9). 3035-3044 (1997)

Nagatsugi,Fumi：“C6-取代烯烃的 2-氨基嘌呤衍生物作为新型交联剂以及相应的 b-亚磷酰胺前体的合成”四面体。

Sasaki,Shigeki: "In Vitro Antitumor Activities of New Synthetic Bistetrahydrofuran Derivatiaves as Analogs of Annonaceous Acetogenins" Chem.Pham.Bull. 46(1). 154-158 (1998)

Sasaki，Shigeki：“新型合成双四氢呋喃衍生物作为番荔枝苷类似物的体外抗肿瘤活性”Chem.Pham.Bull。

Nagatsugi,Fumi: "Novel Cross-Linking Reaction of Oligonuceotides Incorporation New Base Analogs with Selective Reactivity towad Cytidine" Nucleic Acids,Symp.Ser.37. 67-68 (1997)

Nagatsugi，Fumi：“寡核苷酸掺入新碱类似物的新型交联反应，对胞苷具有选择性反应性”核酸，Symp.Ser.37。

Sasaki,Shigeki: "Novel Acyclic Ligands for Metal Cations Based on the Adjacent Bistetrahydrofuran as Analogs of Natural ANNONACEOUS Acetogenins" Tetrahedron. 印刷中. (1998)

Sasaki，Shigeki：“基于邻接双四氢呋喃的新型非环状金属阳离子配体作为天然人工乙酸酯的类似物”四面体（1998 年）。

Nagatsugi,Fumi;: "Design of Cross-Linking Agent for Activation by Metabolic Oxidation" Nucleic Acids,Symp.Ser.35. 79-80 (1996)

Nagatsugi，Fumi；：“代谢氧化活化交联剂的设计”核酸，Symp.Ser.35。