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生体高分子複雑系のナノカ学と工学操作

生物聚合物复杂系统的纳米力学和工程

基本信息

批准号：
11226202
负责人：
猪飼篤
金额：
$ 93.44万
依托单位：
Tokyo Institute of Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
1999
资助国家：
日本
起止时间：
1999 至 2002
项目状态：
已结题

项目摘要

原子・分子のナノ力学の領域で、我々は生体高分子、特にタンパク質立体構造の力学的特質を明らかにする実験に従事し、タンパク質ナノ力学という新しい研究分野を開拓することに成功した.非常に複雑な原子間相互作用の上に成り立っているタンパク質の立体構造の幾何学的な解析はX-線結晶解析及びNMRによりなされているが、その構造が持つ力学的な固さ、あるいは固い部分と柔らかい部分の分子内分布については従来研究手段が無かった.我々は原子間力顕微鏡を使用することにより、単一タンパク質分子をその両末端から引き伸ばす実験に成功し、その延伸における張力と延伸距離の関係を詳細に調べる方法を確立した.この方法を炭酸デヒドラターゼおよびカルモジュリンという典型的な球状タンパク質に適用したところ、それぞれ分子内に外力による破壊に対してとりわけ耐性を持つ固い芯(コア)と言ってよい構造が存在することがわかった.炭酸デヒドラターゼでは全長の60-70%まで伸ばすと、このコア構造は協同現象的に破壊される.同様な構造破壊はカルモジュリンにおいても見ることができた.カルモジュリンについては、機能部位に結合するメリチンなどの低分子との相互作用によりその力学的性質が大きく変わることも確認した.同じタンパク質を生物機能を持たない状態にするとこのコア構造は失われる.原子間力顕微鏡による研究では張力と延伸距離の関係の情報以上は得られないので、並行して分子動力学シミュレーションによる研究を行った.その結果、炭酸デヒドラターゼにおけるコア構造はβシート構造によって構成され、亜鉛イオンの配位によって活性中心を作っている部分であることが強く示唆された.このような基礎的な力学物性に対する知見から、生体構造の複雑性を解明するさらに高次な研究への展開を目指している.

In the field of atomic and molecular mechanics, we have successfully explored the new research field of biological polymers, special materials, three-dimensional structures and mechanical properties. The interaction between atoms in a very complex environment is characterized by the interaction between atoms, the interaction between atoms and atoms. We have established a detailed method for adjusting the relationship between tension and extension distance in the use of atomic force micromirrors. This method is suitable for the typical spherical particles, such as carbon dioxide, carbon 60-70% of the total length of carbon dioxide is due to the extension of carbon dioxide, and the structure of carbon dioxide is due to the coordination phenomenon. The same structure is used to break the circle. The mechanical properties of low molecular weight and low molecular weight are confirmed. This U-shaped structure is no longer in a state where the same substance can maintain biological functions. The relationship between tension and extension distance was studied by atomic force microscopy. The results showed that the relationship between tension and extension distance was studied by molecular dynamics. As a result, the carbon dioxide structure is composed of the active center and the coordination center. The fundamental mechanical properties of these materials are known, and the complexity of biological structures is explained.