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マウスモデルに基づくヒト大腸癌転移形質のバイオインフォーマティックスによる解析

基于小鼠模型的人结直肠癌转移特征的生物信息学分析

基本信息

批准号：
12217025
负责人：
入村達郎
金额：
$ 31.36万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2000
资助国家：
日本
起止时间：
2000 至 2004
项目状态：
已结题

项目摘要

肝臓に対する高転移性を指標にin vivoで5回選別されたマウス大腸癌細胞(SL1〜5細胞)の4回選別後の細胞(SL4)と親株(colon 38)における遺伝子発現の差異を接着条件及び非接着条件下で網羅的に解析した。接着条件下で両細胞の間で発現に大きな差のある遺伝子30個、接着条件と非接着条件を移した時にcolon 38においてのみ発現が変化する遺伝子270個を同定した。17遺伝子は両方に含まれ、この中にCdkn2aが見出された。その発現はcolon 38及びSL1〜2は高いが、SL3〜5では全く見られなかった。遺伝子サイレンシングの原因はDNAメチル化ではなく、遺伝子の欠損による可能性が高い。Cyclin D1の発現レベルがSL1〜5へ転移性と増殖性が高くなるのと併行して上昇した。colon 38とSL4の表面蛋白質の網羅的解析にレクチン結合性を組み合わせ、低転移性細胞にのみ存在するPNA結合性糖蛋白質と高転移性細胞のみに発現するMAH結合性糖蛋白質を複数同定した。これらの差異は、グリコシレーションによることが示唆された。MAHのループCを改変して作製したライブラリーを用いてcolon 38及びSL4を含む大腸癌細胞の表面のプロファイリングを行った。大腸癌細胞は他の細胞と異なるグループとしてクラスターされ、colon 38を含むクラスターとSL4と実験的に転移性が報告されているほとんどのヒト細胞を含むそれが形成された。

The differences in gene expression between 5-cycle selected colorectal cancer cells (SL1 ~ 5 cells) and 4-cycle selected colorectal cancer cells (SL4) and their parent strains (colon 38) were analyzed under both adhesion and non-adhesion conditions. 30 genes were found in the cells under the condition of adhesion, and 270 genes were found in the cells under the condition of adhesion and non-adhesion. 17. The seed is contained in the seed, and the seed is contained in the seed. Cdkn2a is found in the seed.その発现はcolon 38及びSL1〜2は高いが、SL3〜5では全く见られなかった。The cause of DNA fragmentation is highly probable, and the likelihood of DNA fragmentation is high. Cyclin D1 appears in SL1 ~ 5, and its mobility and reproduction are high and parallel. Analysis of the surface protein network of colon 38 and SL4: multiple identity of PNA-binding glycoproteins and MAH-binding glycoproteins in low mobility cells The difference between the two groups is that the two groups are different. MAHs are responsible for controlling the proliferation of colon cancer cells using colon 38 and SL4. Colorectal cancer cells are different from other cells, colon 38 cells are different from SL4 cells, colon 38 cells are different from SL4 cells, colon 38 cells are different from SL4 cells.