巨大ヘモグロビン複合体の構造生物学
巨型血红蛋白复合物的结构生物学
基本信息
- 批准号:13033014
- 负责人:
- 金额:$ 2.3万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
- 财政年份:2001
- 资助国家:日本
- 起止时间:2001 至 2002
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
能登半島九十九湾の水深25m付近に生息する無脊椎動物Oligobrachia mashikoiは口も消化管も無く、共生する細菌が化学合成する有機物を利用してエネルギーを獲得する有鬚動物である。宿主のヘモグロビンは細胞外に存在し、分子量が約45万と巨大であり、酸素だけでなく共生細菌に硫化水素を運搬するという特徴ある機能を有している。本研究では巨大ヘモグロビン複合体の結晶化と立体構造の解明により超分子複合体形成の生物学的意義を解明することを目的に、本タンパク質の結晶化とX線結晶構造解析を試みた。その結果、(1)Oligobrachia mashikoi巨大ヘモグロビンの結晶を得るために様々な条件でハンギングドロップ法を用いて結晶化に取り組み、前年度より大きな結晶を得ることに成功した。(2)京都大学理学部三木邦夫教授との共同研究により、同結晶をガラスキャピラリに封入し、室温でのX線回折実験を行った。その結果、最大で4Å前後の回折像が観測された。しかしながら、室温での測定でもありX線による損傷のため、フルデータを収集するには至らなかった。一方、鹿児島湾に生息する有髭動物Lamellibrachia satsumaはOligobrachia mashikoiと異なり、分子量45万と400万の2種類のヘモグロビンを持つ。本研究では、両ヘモグロビンの結晶化を試みたが、分子量45万ヘモグロビンの結晶は得られなかった。一方、分子量400万のヘモグロビンに関しては良好な結晶が得られた。しかしながら、この結晶は温度感受性が高く、また、分子量400万としては、その大きさが微小な為に未だにX線回折像は得られていない。
Ninety-nine bays of Noto Peninsula are located at a depth of 25m. Invertebrates Oligobrachia mashikoi are living in the vicinity of the bay. The host has a molecular weight of about 450,000 and a large molecular weight of about 450,000. The symbiotic bacteria have the characteristics of transporting sulfur and water. In this study, the crystallization and three-dimensional structure of supramolecular complexes were analyzed, and the biological significance of supramolecular complex formation was analyzed. The results are as follows: (1)Oligobrachia mashikoi large crystal structure, large crystal structure, large crystal structure, (2)During joint research by Professor Kunio Miki of the Faculty of Science at Kyoto University, the same crystals were sealed in a transparent manner, and X-ray folding at room temperature was actually performed. The results, maximum and reflection before and after 4 were measured. X-ray damage measurement at room temperature One side, Kagoshima Bay has moustache animal Lamellibrachia satsuma, Oligobrachia mashikoi, molecular weight 450,000 to 4,000,000, and two species. In this study, the molecular weight of 450,000 crystals was determined. A square, molecular weight of 4 million, is related to good crystallization. The crystal has a high temperature sensitivity, a molecular weight of 4 million, and a small X-ray reflection.
项目成果
期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
K.Denda, A.Oshima, Y.Fukumori: "Structural analyses of the deduced amino acid sequences of a novel type heme-copper terminal oxidases, Cytochrome aco3 from Alkaliphilic Bacillus YN-2000"Can.J.Microbiol..
K.Denda、A.Oshima、Y.Fukumori:“新型血红素铜末端氧化酶(来自嗜碱性芽孢杆菌 YN-2000 的细胞色素 aco3)推导的氨基酸序列的结构分析”Can.J.Microbiol..
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
小野田聖子 他: "サツマハオリムシ巨大ヘモグロビンの精製,性質,結晶化"生化学. 74(8). 768 (2002)
Seiko Onoda 等人:“巨型血红蛋白的纯化、特性和结晶”生物化学 74(8) (2002)。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Y.Okuda, Y.Fukumori: "Expression and characterization of a magnetosome-associated protein, TPR-containing MAM22, in Escherichia coli"FEBS Lett..
Y.Okuda、Y.Fukumori:“磁小体相关蛋白(含 TPR 的 MAM22)在大肠杆菌中的表达和表征”FEBS Lett..
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
福森 義宏其他文献
生細胞蛍光イメージングを用いた磁性細菌のアクチン様細胞骨格MamKの機能解析
使用活细胞荧光成像对磁性细菌中的肌动蛋白样细胞骨架 MamK 进行功能分析
- DOI:
- 发表时间:
2015 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
清河 文子;田岡 東;福森 義宏 - 通讯作者:
福森 義宏
走磁性細菌の細胞内磁気センサー「マグネトソーム」の生細胞蛍光イメージング
磁小体的活细胞荧光成像,磁小体是趋磁细菌的细胞内磁传感器
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
田岡 東;上杉 知佳;Zachery Oestreicher;福森 義宏 - 通讯作者:
福森 義宏
磁性細菌に特異的な細胞骨格蛋白質MamKによるマグネトソーム細胞内配置調節
MamK(一种磁性细菌特有的细胞骨架蛋白)对磁小体细胞内定位的调节
- DOI:
- 发表时间:
2015 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
田岡 東;清河 文子;上杉 知佳;福森 義宏 - 通讯作者:
福森 義宏
高速AFMによるバクテリアの膜小胞の一粒子物性解析
使用高速 AFM 对细菌膜囊泡进行单粒子物理性质分析
- DOI:
- 发表时间:
2018 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
菊池 洋輔;尾花 望;豊福 雅典;野村 暢彦;古寺 哲幸;安藤 敏夫;福森 義宏;田岡 東 - 通讯作者:
田岡 東
福森 義宏的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('福森 義宏', 18)}}的其他基金
磁性細菌のGタンパク質融合型鉄輸送体 -精製と再構成-
磁性细菌G蛋白融合铁转运蛋白-纯化和重构-
- 批准号:
16048211 - 财政年份:2004
- 资助金额:
$ 2.3万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
NO還元酵素の構造解析と機能変換
NO还原酶的结构分析及功能转换
- 批准号:
10129208 - 财政年份:1998
- 资助金额:
$ 2.3万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
NO還元酵素の構造解析と機能変換
NO还原酶的结构分析及功能转换
- 批准号:
09235207 - 财政年份:1997
- 资助金额:
$ 2.3万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
酸素還元能を持つ新規NO還元酵素の構造解析と機能変換
一种具有氧还原能力的新型NO还原酶的结构分析及功能转化
- 批准号:
08249209 - 财政年份:1996
- 资助金额:
$ 2.3万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
好アルカリ性細菌の呼吸鎖末端酸化酵素の分子構造とプロトンポンプ活性
嗜碱菌呼吸链末端氧化酶的分子结构及质子泵活性
- 批准号:
05259207 - 财政年份:1993
- 资助金额:
$ 2.3万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
原核生物チトクロムaa3の結晶化
原核细胞色素aa3的结晶
- 批准号:
63780208 - 财政年份:1988
- 资助金额:
$ 2.3万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
aa_3型チトクロムc酸化酵素の銅原子の役割
铜原子在aa_3型细胞色素c氧化酶中的作用
- 批准号:
61780196 - 财政年份:1986
- 资助金额:
$ 2.3万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
チトクロムc__-酸化酵素のカオトロピックイオンによる精製
使用离液离子纯化细胞色素 c__-氧化酶
- 批准号:
60780183 - 财政年份:1985
- 资助金额:
$ 2.3万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
紅色イオウ細菌 Chromatium, vinosum における硫化物酸化機構について
紫硫菌Chromatium、vinosum中硫化物氧化机制
- 批准号:
56740280 - 财政年份:1981
- 资助金额:
$ 2.3万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
相似海外基金
鉄欠乏耐性植物の新規「光化学系の超分子複合体」の機能・構造の解明とその応用
耐缺铁植物中新型“光系统超分子复合物”功能和结构的阐明及其应用
- 批准号:
24K01656 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 2.3万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
光合成・超分子複合体のアセンブリー因子の構造と機能の解析
光合作用/超分子复合物组装因子的结构与功能分析
- 批准号:
24K09488 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 2.3万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
光合成超分子複合体における光エネルギー伝達ダイナミクスの理論的解明
光合超分子复合物中光能传递动力学的理论阐明
- 批准号:
22K05022 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 2.3万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Supramolecular complex of peroxiredoxin
过氧化还原蛋白超分子复合物
- 批准号:
20K05740 - 财政年份:2020
- 资助金额:
$ 2.3万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Biophysical and biochemical techniques for the analysis and targeting of the Fc receptor supramolecular complex
用于分析和靶向 Fc 受体超分子复合物的生物物理和生化技术
- 批准号:
RGPIN-2014-03967 - 财政年份:2018
- 资助金额:
$ 2.3万 - 项目类别:
Discovery Grants Program - Individual
RNA編集に関わる超分子複合体の構造解析
RNA编辑中涉及的超分子复合物的结构分析
- 批准号:
17J06162 - 财政年份:2017
- 资助金额:
$ 2.3万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
Three-dimensional control of polynuclear metal centers by metallo-supramolecular complex with "ligand space"
具有“配体空间”的金属超分子配合物对多核金属中心的三维控制
- 批准号:
17J06579 - 财政年份:2017
- 资助金额:
$ 2.3万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
Structural investigation of the multi-membrane spanning bacterial cellulose synthase (Bcs) supramolecular complex
多膜跨细菌纤维素合酶(Bcs)超分子复合物的结构研究
- 批准号:
9468670 - 财政年份:2017
- 资助金额:
$ 2.3万 - 项目类别:
Biophysical and biochemical techniques for the analysis and targeting of the Fc receptor supramolecular complex
用于分析和靶向 Fc 受体超分子复合物的生物物理和生化技术
- 批准号:
RGPIN-2014-03967 - 财政年份:2017
- 资助金额:
$ 2.3万 - 项目类别:
Discovery Grants Program - Individual
Biophysical and biochemical techniques for the analysis and targeting of the Fc receptor supramolecular complex
用于分析和靶向 Fc 受体超分子复合物的生物物理和生化技术
- 批准号:
RGPIN-2014-03967 - 财政年份:2016
- 资助金额:
$ 2.3万 - 项目类别:
Discovery Grants Program - Individual