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倍数性コムギの比較ゲノム解析

多倍体小麦的比较基因组分析

基本信息

批准号：
14011242
负责人：
荻原保成
金额：
$ 3.26万
依托单位：
Yokohama City University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2002
资助国家：
日本
起止时间：
2002 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

コムギは倍数化により進化してきたことを特徴とする。本研究は、温帯性冬作の重要作物である6倍性パンコムギの比較ゲノム解析を目的とする。パンコムギで高分子DNAを挿入したゲノミックライブラリーを構築する。このライブラリーから効率よく遺伝子をスクリーニングできるシステムを開発する。さらに、環境に応答して倍数種のゲノム間ででのように遺伝子発現を調節しているか、解析する。熱帯性・夏作のイネとの比較により、イネ科植物でみられる自然変異に分子発生遺伝学的基礎をあたえ、進化のメカニズムの解明をめざす。本年度の具体的成果は、1)コムギの生活環の代表的な10組織のcDNAクローン116232塩基配列を25971contigに整列化した。これらのうちから、比較的発現量の多い5199contigを選抜し、10組織における遺伝子発現のボディマップを作成した。2)5199遺伝子のうち3069遺伝子をゲノムあたり単一である、と推定した。これらのうち、90遺伝子についてPyrosequencing法とパンコムギのナリーテトラソーミクス系統を組み合わせることにより、A, B, Dゲノムの座乗染色体を決定した。さらに、10組織による3種ゲノムにおけるゲノム毎の遺伝子発現パターンの特徴を明らかにした。3)低温・高温、日長、塩・等の非生物的ストレス、またかび病等の病原菌等の生物的ストレスをかけ、cDNAライブラリーを構築した。構築したcDNAライブラリーを総括班に送り、塩基配列を決定している。4)日長に感応して出穂性を制御するHd遺伝子、および花の形態形成を支配するMADS box遺伝子であるAP1,PISTILATAおよびAGAMOUSをクローニングした。これらの遺伝子の発現パターンの特徴を解析している。

コムギは multiplexed によりevolution してきたことを特徴とする. The purpose of this study is to compare and analyze the 6-ploidy ploidy of an important crop of temperate winter crops.パンコムギでpolymer DNAをinsertionしたゲノミックライブラリーをconstructionする.このライブラリーからefficiencyよく伝子をスクリーニングできるシステムを开発する.さらに、Environmental に応 Answer して multiple species のゲノム间ででのように伝子発 appear を Adjustment しているか、Analysis する. Thermal characteristics, natural differences between the natural differences between summer-made のイネとのにより and イネfamily plants The basics of molecular biology and genetics, and the explanation of evolution. The specific results of this year are: 1) The cDNA sequence of 116232 radial base arrays and 25971 contigs of the 10 organizations represented by the Japanese Living Environment.これらのうちから、Comparative 発现quantityの多い5199contigを选抜し、10 Organization における伝子発现のボディマップを成した. 2) 5199弝子のうち3069缝子をゲノムあたり単一である、と presumedした.これらのうち、90坝子についてPyrosequencing method とパA, B, D is determined by chromosomes.さらに, 10 organization による 3 kinds of ゲノムにおけるゲノム毎の伝子発 appear パターンの特徴を明らかにした. 3) Low temperature, high temperature, day length, low temperature, etc. non-biological substances, pathogenic bacteria such as diseases, etc. and biological substances such as cDNA traces. The construction of cDNA templates and the selection of base sequences were carried out. 4) The long feeling of the day, the nature of the day, the control of the HD, the shape of the flowers, and the control of the flowers MADS box 伝子であるAP1,PISTILATAおよびAGAMOUSをクローニングした.これらの缝子の発成パターンの特徴をanalyticsしている.