ホヤ遺伝子発現調節領域の構造と機能の網羅的解析
海鞘基因表达调控区结构与功能综合分析
基本信息
- 批准号:14011244
- 负责人:
- 金额:$ 3.26万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
- 财政年份:2002
- 资助国家:日本
- 起止时间:2002 至 无数据
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
1.ホヤ幼生の神経系に特異的に発現する遺伝子の上流領域のクローニング:カタユウレイボヤのEST配列およびゲノムプロジェクトのデータを用い、約60個の神経系特異的遺伝子の上流領域を含むゲノム配列を収集した。各遺伝子の上流領域(2kb〜4kb)を単離し、それぞれをレポーター遺伝子(GFPとlacZ)につないだプラスミドを順次作製した。2.遺伝子上流領域-レポーター融合遺伝子のホヤ胚における発現解析:1で得られた上流領域にレポーター遺伝子をつないだ融合遺伝子を電気穿孔法によりホヤ胚に導入して、レポーター遺伝子の発現を調べた。神経系特異的な発現が得られ、細胞タイプ特異的な発現に関わる調節領域をみいだした。3.遺伝子上流領域の塩基配列の比較解析:単離・同定した各神経系遺伝子のオーソログを近縁種Ciona savignyiで同定し、ゲノム配列の種間比較を行った。その結果、2種は同じ属に分類される近縁種であるにも関わらず、翻訳領域以外の配列は非常に異なっていることが明らかになった。イントロンや上流領域にも種間で部分的に保存された領域がみつかり、これらは重要な転写調節配列と推定される。またこの比較により、これまで困難だった既知遺伝子との相同性がない遺伝子の5'末端の同定が容易になった。発現パターンの共通な遺伝子間で上流領域の配列を比較することにより、神経系特異的な転写に関与するシスエレメントの候補を発見した。遺伝子情報、遺伝子上流領域の塩基配列、シスエレメントの情報、上流領域の機能解析結果のデータベース化を進めた。
1. ホ ヤ larval の god 経 department に specific に 発 now す る posthumous son 伝 の upper field の ク ロ ー ニ ン グ : カ タ ユ ウ レ イ ボ ヤ の EST match column お よ び ゲ ノ ム プ ロ ジ ェ ク ト の デ ー タ を い, about 60 の god 経 system specific heritage 伝 son の を upper field containing む ゲ ノ ム match column を 収 set し た. The heritage 伝 son の upper field (2 KB ~ 4 KB) を 単 し, そ れ ぞ れ を レ ポ ー タ ー heritage 伝 child (GFP と lacZ) に つ な い だ プ ラ ス ミ ド を progressive cropping し た. 2. Heritage 伝 child upper field - レ ポ ー タ ー fusion heritage 伝 son の ホ ヤ embryo に お け る 発 is analytic: 1 で ら れ た upper field に レ ポ ー タ ー posthumous son 伝 を つ な い だ fusion heritage 伝 son を 気 perforation method に よ り ホ ヤ embryo に import し て, レ ポ ー タ ー heritage 伝 son の 発 now を adjustable べ た. God 経 system specific な 発 が must now ら れ, cell タ イ プ specific な 発 now に masato わ る adjust field を み い だ し た. 3. Heritage 伝 child upper field の salt base with column の is analytic: 単 leaves, with fixed し た each god 経 system heritage 伝 son の オ ー ソ ロ グ を about try species Ciona savignyi で with し, ゲ ノ ム match column の を is compared between rows っ た. そ の classification results, with two は じ に さ れ る about try species で あ る に も masato わ ら ず, turn 訳 areas outside の match column は very に different な っ て い る こ と が Ming ら か に な っ た. イ ン ト ロ ン や upper field に も interspecific で part に save さ れ た field が み つ か り, こ れ ら は important な planning write tuning と presumption さ れ る. ま た こ の is に よ り, こ れ ま で difficult だ っ た son already know but 伝 と の identity が な い posthumous son 伝 の 5 'end の with fixed が easy に な っ た. 発 now パ タ ー ン の な common heritage 伝 の で high field match column を comparison between child す る こ と に よ り, god 経 specific な planning write に masato and す る シ ス エ レ メ ン ト の alternate を 発 see し た. Heritage 伝 child intelligence, but 伝 upper field の salt base columns, シ ス エ レ メ ン ト の の function intelligence, high field analytical results の デ ー タ ベ ー ス change を into め た.
项目成果
期刊论文数量(10)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Yuki Nakashima: "Origin of vertebrate visual cycle : genes encoding retinal photoisomerase and two putative visual cycle proteins are expressed in_whole brain of a primitive chordate"Journal of Comparative Neurology. (印刷中). (2003)
Yuki Nakashima:“脊椎动物视觉周期的起源:编码视网膜光异构酶和两种假定的视觉周期蛋白的基因在原始脊索动物的整个大脑中表达”《比较神经学杂志》(2003 年)。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Takehiro Kusakabe: "Phototransduction and visual cycle in the ascidian tadpole larva"Journal of Photoscience. 9・2. 37-40 (2002)
Takehiro Kusakabe:“海鞘蝌蚪幼虫的光转导和视觉周期”《光科学杂志》9・2(2002)。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Yutaka Satou: "Ciona intestinalis cDNA projects : EST analyses and gene expression profiles during embryogenesis"Gene. 287・1-2. 83-96 (2002)
佐藤裕:“海鞘cDNA计划:胚胎发生过程中的EST分析和基因表达谱”基因287・1-96。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Takehiro Kusakabe: "Gene expression profiles in tadpole larvae of ciona intestinalis"Developmental Biology. 242・2. 188-203 (2002)
Takehiro Kusakabe:“海鞘蝌蚪幼虫的基因表达谱”发育生物学242・2(2002)。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Reiko Yoshida: "Central nervous system-specific expression of G protein alpha subnits in the ascidian Ciona intestinalis"Zoological Science. 19・10. 1079-1088 (2002)
Reiko Yoshida:“海鞘中 G 蛋白 α 亚基的中枢神经系统特异性表达”动物学科学 19・10(2002)。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
日下部 岳広其他文献
ホヤの光受容システム
海鞘感光系统
- DOI:
- 发表时间:
2004 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
Yoshii;T.;Funada;Y.;Ibuki;T.;Matsumoto;A.;Tanimura;T.;Tomioka;K.;Takehiro Kusakabe;Edgar A.Otto;Reiko Yoshida;Takehiro Kusakabe;Hironori Ando;日下部 岳広 - 通讯作者:
日下部 岳広
ホヤの光受容システムから探る脊椎動物の頭部感覚器官の起源
从海鞘感光系统探索脊椎动物头部感觉器官的起源
- DOI:
- 发表时间:
2007 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
Tu;X.;Joeng;K.S.;Nakayama;K.I.;Nakayama;K.;Rajagopal;J.;Carroll;T.J.;McMahon;A.P.;Long;F.;Takehiro G.Kusakabe;日下部 岳広 - 通讯作者:
日下部 岳広
Comparative genomic analysis of two avian-quail and chicken-major histocompatibility complex regions.
两个禽鹌鹑和鸡主要组织相容性复合体区域的比较基因组分析。
- DOI:
- 发表时间:
2004 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
Yoshii;T.;Funada;Y.;Ibuki;T.;Matsumoto;A.;Tanimura;T.;Tomioka;K.;Takehiro Kusakabe;Edgar A.Otto;Reiko Yoshida;Takehiro Kusakabe;Hironori Ando;日下部 岳広;Shiina T;International Chicken Genome Sequencing Consortium;Shiina T;Kulski JK;Hurt P;Shiina T - 通讯作者:
Shiina T
Phylogenic conservation of a cis-acting regulator that controls polarized expression of Sonic hedgehog (Shh) in limb buds.
控制肢芽中音刺猬 (Shh) 极化表达的顺式作用调节因子的系统发育保守性。
- DOI:
- 发表时间:
2004 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
Yoshii;T.;Funada;Y.;Ibuki;T.;Matsumoto;A.;Tanimura;T.;Tomioka;K.;Takehiro Kusakabe;Edgar A.Otto;Reiko Yoshida;Takehiro Kusakabe;Hironori Ando;日下部 岳広;Shiina T;International Chicken Genome Sequencing Consortium;Shiina T;Kulski JK;Hurt P;Shiina T;Ogasawara M.;Ogasawara M. et al.;Sakai T.;Oka A.;Sagai T. - 通讯作者:
Sagai T.
日下部 岳広的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('日下部 岳広', 18)}}的其他基金
Studies on the mechanism of generation of cellular diversity in the central nervous system based on the detailed cell lineage and spatial omics
基于详细细胞谱系和空间组学研究中枢神经系统细胞多样性的产生机制
- 批准号:
23H02492 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 3.26万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
4色型色覚特異的マイクロRNAから探る色覚の制御と進化
从四色视觉特异性 microRNA 探索色觉的控制和进化
- 批准号:
21K19280 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 3.26万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
中枢神経系と筋細胞におけるGnRHの新奇な生理機能
GnRH 在中枢神经系统和肌肉细胞中的新生理功能
- 批准号:
20657018 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 3.26万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
ホヤ遺伝子発現調節領域の構造と機能の網羅的解析
海鞘基因表达调控区结构与功能综合分析
- 批准号:
16011252 - 财政年份:2004
- 资助金额:
$ 3.26万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
ホヤ遺伝子発現調節領域の構造と機能の網羅的解析
海鞘基因表达调控区结构与功能综合分析
- 批准号:
15011248 - 财政年份:2003
- 资助金额:
$ 3.26万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
ホヤ幼生の形態進化に伴う遺伝子プログラムの変化の解析
海鞘幼虫形态进化相关遗传程序变化分析
- 批准号:
14034250 - 财政年份:2002
- 资助金额:
$ 3.26万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
ホヤ無尾幼生の進化に伴う遺伝子プログラムの変化の解析
与海鞘无尾目幼虫进化相关的遗传程序变化分析
- 批准号:
13045040 - 财政年份:2001
- 资助金额:
$ 3.26万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
ホヤ遺伝子発現調節領域の構造と機能の網羅的解析
海鞘基因表达调控区结构与功能综合分析
- 批准号:
13202057 - 财政年份:2001
- 资助金额:
$ 3.26万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
ホヤ幼生脳胞における視細胞の分化機構の解析
海鞘幼虫脑泡感光细胞分化机制分析
- 批准号:
13780594 - 财政年份:2001
- 资助金额:
$ 3.26万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
メダカ胚における視細胞特異的グアニル酸シクラーゼ遺伝子ファミリーの発現制御機構
青鳉胚胎中感光细胞特异性鸟苷酸环化酶基因家族的表达调控机制
- 批准号:
11780527 - 财政年份:1999
- 资助金额:
$ 3.26万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
相似海外基金
ホヤ幼生の神経系細胞の発生過程における細胞増殖制御機構の解明―増殖と分化相関
阐明海鞘幼虫神经系统细胞发育过程中细胞增殖控制机制——增殖与分化的相关性
- 批准号:
24K09473 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 3.26万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
ホヤ幼生におけるグリア細胞の活動と生理機能の解析
海鞘幼虫胶质细胞活性及生理功能分析
- 批准号:
24KJ0145 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 3.26万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
ホヤ尾芽胚の側方湾曲とねじれの機構解明
海鞘尾芽胚胎侧向弯曲和扭曲机制的阐明
- 批准号:
24KJ1934 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 3.26万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
ホヤ幼生の時期ごとの遊泳方向変化をもたらす神経回路基盤の解明
阐明导致海鞘幼虫游动方向季节性变化的神经回路基础
- 批准号:
24KJ1624 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 3.26万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
ホヤ胚の運命決定機構の解明
阐明海鞘胚胎的命运决定机制
- 批准号:
24K02032 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 3.26万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
The role of allorecognition between egg and sperm
卵子和精子之间同种异体识别的作用
- 批准号:
23K05779 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 3.26万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
ホヤ幼生におけるカルシウムイメージング法を用いたグリア細胞の活動と生理機能の解析
钙成像法分析海鞘幼虫胶质细胞活性和生理功能
- 批准号:
22KJ3063 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 3.26万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
ホヤの心臓における拍動反転機構の解明を目指したHCNチャネル群の解析
HCN 通道分析旨在阐明海鞘心脏的搏动反转机制
- 批准号:
23KJ0080 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 3.26万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
ホヤが作るセルロース製構造の多様な形態につながる生体分子の特徴
导致海鞘产生多种形式纤维素结构的生物分子特征
- 批准号:
22KJ0877 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 3.26万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
二次代謝物で探るホヤの生理・生態
利用次生代谢物探索海鞘的生理学和生态学
- 批准号:
23K19313 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 3.26万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up