日本人メラノーマの予後に関する病型と進展の分子疫学

日本黑色素瘤预后的疾病类型和进展的分子流行病学

基本信息

批准号：
14031220
负责人：
神保孝一
金额：
$ 3.71万
依托单位：
Sapporo Medical University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2002
资助国家：
日本
起止时间：
2002 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-14031220/
关键词：
メラノーマ遺伝子解析 DNAマクロアレイ分子疫学がん転移

项目摘要

これまで原発巣と転移巣をもつメラノーマ6症例(NM:1例、ALM:5例)、ALM原発巣(転移なし)5検体、転移巣(鼠径リンパ節)4検体より、一部と凍結した後、一部よりRNAを抽出した。これらのうちALMの3症例は、色素性母斑、表皮内水平増殖層、真皮内垂直増殖層、転移巣の完全なセットを含んでいる。原発巣と転移巣を持つメラノーマ症例のうち、RNAの精製度の高いNMの1セット(原発巣と転移巣、症例Toki)及びALMの1セット(色素性母斑、表皮内水平増殖層、真皮内垂直増殖層、転移巣)のRNAをDNAマイクロアレイ解析に供した。NMの症例#1の原発巣と転移巣における8,300遺伝子の転写レベルを比較した結果、10倍以上の転移巣>原発巣を示すcDNAが33種、10倍以上の転移巣<原発巣を示すcDNAが20種見出された。特に、転移巣で発現が20倍以上低下した遺伝子群は細胞表面蛋白質、シグナル伝達経路蛋白質、メラノサイト特異蛋白質などをコードする興味深い遺伝子を含んでいた。これらのcDNAよりPCRプライマーを作製し、RT-PCRによって多くの原発メラノーマ組織と転移メラノーマ組織間に発現の差があるものを選択中である。今後、これらのcDNAよりPCRプライマーを作製しRT-PCRによって、又、candidate cDNAを固定したマイクロアレイを作製して、発癌と悪性化に関係する細胞遺伝子群の同定を行う予定である。

将RNA从6例黑色素瘤的一部分中提取（NM：1病例，ALM：5例），5个ALM原发性焦点（无转移）和4个转移性灶（innguinal淋巴结）的样品，并从样品的一部分中提取RNA。其中，三种ALM病例包括一组完整的色素柳，e骨内水平生长层，皮内垂直生长层和转移灶。在具有原发性和转移灶的黑色素瘤病例中，来自一组具有高RNA纯化（原发性和转移性灶，病例TOKI）的NMS和一组ALMS（色素内nevus，水平内部水平生长层，内部垂直生长层，转移性灶）的RNA经过DNA Micraray分析。当比较NM的情况1＃1中的原发灶和转移灶中8,300个基因的转录水平时，发现33个cDNA显示了原代焦点超过10次，并且20个cDNA显示了原发性灶超过10倍以上。特别是，在转移性灶中，表达降低20次或更多的基因包含了编码细胞表面蛋白，信号转导途径蛋白，黑素细胞特异性蛋白等的有趣基因。 PCR引物是由这些CDNA产生的，并且正在选择RT-PCR选择许多原发性黑色素瘤组织和转移性黑色素瘤组织之间表达差异的人。将来，将通过这些cDNA产生PCR引物，并产生具有候选cDNA的微阵列，以鉴定涉及致癌和恶性转化的细胞基因。