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ファージライブラリーを基軸にした膜インターフェイス制御分子の設計と合成

ファージライブラリーを基軸にした膜インターフェイス制御分子の設計と合成
基于噬菌体库的膜界面控制分子的设计与合成
批准号:
16048228
负责人:
藤井 郁雄
金额:
$2.3万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2004
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2004 至 --

项目摘要

项目成果

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de novoペプチドライブラリーの構築α-ヘリックス構造は酵素やレセプターのターゲットモチーフとして数多く報告されている.私たちはヘリックス・ループ・ヘリックス構造を完全de novoデザインし、この溶媒面に位置する残基をランダム化したα-ヘリカルペプチド・ライブラリーをファージ上に構築した.土台としたヘリックス・ループ・ヘリックスペプチドは2本のヘリックス(N-ヘリックス,C-ヘリックス)の内側に位置するロイシン残基の疎水性相互作用とN-ヘリックスの側面のグルタミン酸残基とC-ヘリックスの側面のリジン残基の静電相互作用によって安定化されている.そこでN-ヘリックスを構造支持領域とし、C-ヘリックスの溶媒面の残基をランダム化することで3次構造を保持したライブラリーを作製した.このペプチドライブラリーをM13ファージのp8蛋白上に発現させファージ・ライブラリーを構築した(ライブラリーサイズ:1.5×10^6).G-CSF受容体結合性ペプチドのスクリーニング上記ライブラリーをG-CSF受容体に対してスクリーニングした,受容体膜外ドメインのサイトカイン結合領域をプレート上に固定化し,バイオパンニングを繰り返したところ,受容体に特異的に結合するペプチドを同定した.ペプチドの構造活性相関このペプチドの立体構造と結合活性の関係を調べるために,CDスペクトルを解析したところ10%TFE(Trifluoro ethanol)存在下,α-ヘリックス構造を形成していた.そこで,水溶液中でのヘリックスの安定化を図り,変異体を作製した.その結果,ヘリックスの安定化にともない受容体結合活性が向上することが判明した.
期刊论文(8)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Phage-display selection of antibodies to the left end of CTX3Cusing synthetic fragments
使用合成片段对 CTX3C 左端抗体进行噬菌体展示选择
DOI: --
发表时间: 2004
期刊: Journal of Immunological Methods 289
影响因子: --
作者: [Ikuo Fujii, Akiko Matsui, Takashi Kodama, Takeshi Tsumuraya, Mitsumori Kirihata, Yin Lin, Yin Lin, Yoko Nagumo]
通讯作者: Yoko Nagumo
Isolation of novel catalytic antibody clones from combinatorial library displayed on yeast-cell surface
从酵母细胞表面展示的组合文库中分离新型催化抗体克隆
DOI: --
发表时间: 2004
期刊: Journal of Molecular Catalysis B : Enzymatic 28
影响因子: --
作者: [Y.Lin, S.Shirage, T.Tsumuraya, I.Fujii, T.Matsumoto, A.Kondo, M.Ueda]
通讯作者: M.Ueda
Comparison of two forms of catalytic antibody displayed on yeast-cell Surface
酵母细胞表面展示的两种形式的催化抗体的比较
DOI: --
发表时间: 2004
期刊: Journal of Molecular Catalysis B : Enzymatic 28
影响因子: --
作者: [Y.Lin, S.Shirage, T.Tsumuraya, T.Matsumoto, A.Kondo, I.Fujii, M.Ueda]
通讯作者: M.Ueda
Directed evolution governed by controlling the molecular recognition between abzyme and haptenic transition-state analog
通过控制抗体酶和半抗原过渡态类似物之间的分子识别来控制定向进化
DOI: --
发表时间: 2004
期刊: Journal of Immunological Methods 294
影响因子: --
作者: [N.-T.Ando, H.Kakinuma, I.Fujii, Y.Nishi]
通讯作者: Y.Nishi
分子標的ペプチド(マイクロ抗体)による細胞周期の制御
  • 批准号:
    19021039
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额:
    $1.47万
  • 财政年份:
    2007
  • 负责人:
    藤井 郁雄
  • 依托单位:
立体構造規制ペプチドライブラリー:タンパク質標的親和性プローブの網羅的作製法
  • 批准号:
    18038036
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额:
    $2.24万
  • 财政年份:
    2006
  • 负责人:
    藤井 郁雄
  • 依托单位:
進化分子工学を基盤とした受容体標的分子の創製と機能解析
  • 批准号:
    18032064
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额:
    $3.46万
  • 财政年份:
    2006
  • 负责人:
    藤井 郁雄
  • 依托单位:
ファージ・ライブラリーを利用した膜インターフェイス製御分子の最適化と機能
  • 批准号:
    17048026
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额:
    $4.29万
  • 财政年份:
    2005
  • 负责人:
    藤井 郁雄
  • 依托单位:
海外基金