進化分子工学を基盤とした生体機能分子の設計と合成
進化分子工学を基盤とした生体機能分子の設計と合成
批准号:
17035072
负责人:
藤井 郁雄
金额:
$2.05万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2005
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2005 至 --
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本研究では,「進化分子工学」と「有機合成化学」とを融合させ,新しい「生体機能分子」の分子設計手法を開発する。すなわち,安定な立体構造(α-ヘリックスなど)を持つペプチドから構成される独自ファージ・ライブラリーを構築し,標的タンパク質(サイトカイ受容体など)に結合するペプチドを検索する.このライブラリーから得られる受容体結合性ペプチドは強固な立体構造を持つので,活性アミノ酸残基の3次元構造情報が容易に入手することができ,この情報をもとに低分子の「生体機能分子」の設計を行う。1.ファージ・ライブラリーのスクリーニング:ヘリックス・ループ・ヘリックス構造ペプチドからなるファージ・ライブラリーを顆粒球コロニー刺激因子(G-CSF)受容体に対してスクリーニングし,受容体結合性のファージ粒子を単離したのち,ペプチドのアミノ酸配列を決定した。2.活性残基の立体構造:ペプチドのアラニン・スキャンニングを行い,受容体結合に関与する活性残基の同定を検討したところ,Leu28,Lys29,Glu32が結合の関与していることが判明した。さらに,Leu3およびLeu28を15Nラベルし,受容体存在下,核磁気共鳴(HSQC)スペクトルを測定したところ,C端ヘリックス外側が受容体と相互作用していることが判明した。3.非ペプチド性テンプレート分子の検索:以上の事実から,受容体結合における,活性残基の立体構造情報が得られた。そこで,この情報をもとに低分子化合物データベースをバーチャルスクリーニングしたところ,テンプレート分子が検索された。4.受容体結合性低分子化合物の合成:テンプレート分子の適切な位置に,活性残基の側鎖に対応する官能基を移植し,非ペプチド性低分子を合成した。
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Directed Evolution of Peptide Ligands for G-CSF Receptor : A Correlation between α - Helix Stability and Binding Affinity.
G-CSF 受体肽配体的定向进化:α-螺旋稳定性与结合亲和力之间的相关性。
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
Peptide Science 2005
影响因子:
--
作者:
[Ikuo Fujii, Akiko Matsui, Takashi Kodama, Takeshi Tsumuraya, Mitsumori Kirihata]
通讯作者:
Mitsumori Kirihata
A Free Energy Calculation Study of the Effect of H→F Substitution on Binding Affinity in Ligand-Antibody Interactions
H→F 取代对配体-抗体相互作用中结合亲和力影响的自由能计算研究
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
J.Comput.Chem. 26
影响因子:
--
作者:
[Minoru Saito, Isao Okazaki, Masayuki Oda, Ikuo Fujii]
通讯作者:
Ikuo Fujii
Directed Mutagenesis Study of the Antibody 2D7 which Catalyzes a Reaction for Insersion of Cu2^+ into Mesoporphyrin.
抗体 2D7 的定向诱变研究,该抗体催化 Cu2+ 插入中卟啉的反应。
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
Journal of Bioscience, Bioengineering 99
影响因子:
--
作者:
[Naoki Hosomi, Yasuko Kawamura-Konishi, Ryota Kawano, Ikuo Fujii, Haruo Suzuki]
通讯作者:
Haruo Suzuki
Backbone resonance assignments for the Fv fragment of catalytic antibody 6D9 complexed with a transition state analogue
与过渡态类似物复合的催化抗体 6D9 的 Fv 片段的主链共振分配
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
Journal of Biomolecular NMR 33
影响因子:
--
作者:
[Mugishima, M.Tsuda, M.et al., M.Kitajima, S.Horie, H.Takayama, K.Matsumoto, K.Matsumoto, Masayoshi Sakakura, Masayoshi Sakakura]
通讯作者:
Masayoshi Sakakura
分子標的ペプチド(マイクロ抗体)による細胞周期の制御
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批准号:19021039
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2007
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负责人:藤井 郁雄
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依托单位:
立体構造規制ペプチドライブラリー:タンパク質標的親和性プローブの網羅的作製法
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批准号:18038036
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.24万
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财政年份:2006
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负责人:藤井 郁雄
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依托单位:
進化分子工学を基盤とした受容体標的分子の創製と機能解析
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批准号:18032064
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.46万
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财政年份:2006
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负责人:藤井 郁雄
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依托单位:
ファージ・ライブラリーを利用した膜インターフェイス製御分子の最適化と機能
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批准号:17048026
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.29万
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财政年份:2005
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负责人:藤井 郁雄
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依托单位:
セミラショナル医薬品設計:ファージライブラリーとコンピュータ支援薬物設計との融合
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批准号:17659008
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.73万
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财政年份:2005
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负责人:藤井 郁雄
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依托单位:
ファージライブラリーを基軸にした膜インターフェイス制御分子の設計と合成
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批准号:16048228
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2004
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负责人:藤井 郁雄
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依托单位:
海外基金