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Development of methods for quantitative description and perturbation of biomolecular pathways and networks

Development of methods for quantitative description and perturbation of biomolecular pathways and networks
开发生物分子途径和网络的定量描述和扰动方法
批准号：
17017004
负责人：
ITO Takashi
金额：
$66.56万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2005
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2005 至 2009
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17017004/
关键词：
転写開始点次世代シーケンサ定量プロテオミクスユビキチン化FRET遺伝子発現GIS-PETゲノムトランスクリプトームプロテオーム定量性454シークエンサ非コードRNA安定同位元素標識質量分析代謝物蛋白質問相互作用リン酸化質最分析定量蛋白質間相互作用

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As a basis for understanding dynamics of biomolecular pathways and networks, we developed novel methods for absolute quantification of gene expression using next generation DNA sequencing, absolute quantification of protein-protein interactions and quantitative analysis of ubiquitinated proteomes by mass spectrometry, and real-time monitoring of intracellular metabolites using FRET.
期刊论文(33)
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会议论文
Absolute quantification of budding yeast transcriptome by means of competitive PCR between genomic and complementary DNAs
通过基因组和互补 DNA 之间的竞争性 PCR 对芽殖酵母转录组进行绝对定量
DOI： --
发表时间： 2008
期刊： BMC Genomics 9
影响因子： --
作者： [Miura, F., Kawaguchi, N., Yoshida, M., Uematsu, C., Kito, K., Sakaki, Y., Ito, T.]
通讯作者： T.
A novel, Cdc42-interacting domain of the yeast polarity establishment protein Bem1 : implications for modulation of mating pheromone signaling.
酵母极性建立蛋白 Bem1 的新型 Cdc42 相互作用结构域：对交配信息素信号传导调节的影响。
DOI： --
发表时间： 2007
期刊： J. Biol. Chem. 282
影响因子： --
作者： [Yamaguchi, Y., Ota, K., Ito, T.]
通讯作者： T.
A proteomic screen reveals the mitochondrial outer membrane protein Mdm34p as an essential target of the F-box protein Mdm30p
DOI： 10.1111/j.1365-2443.2008.01228.x
发表时间： 2008-10-01
期刊： GENES TO CELLS
影响因子： 2.1
作者： [Ota, Kazuhisa, Kito, Keiji, Ito, Takashi]
通讯作者： Ito, Takashi
Structure and Function of the PB1 Domain, a Protein Interaction Module Conserved in Animals, Fungi, Amoebas, and Plants
DOI： 10.1126/stke.4012007re6
发表时间： 2007-08
期刊： Science's STKE
影响因子： --
作者： [H. Sumimoto;S. Kamakura;Takashi Ito]
通讯作者： H. Sumimoto;S. Kamakura;Takashi Ito
共 22 条
    A novel therapeutic strategy targeting HMGB1 isoforms in sepsis
    • 批准号：
      18H02904
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $11.15万
    • 财政年份：
      2018
    • 负责人：
      ITO Takashi
    • 依托单位：
      Kagoshima University
    A Comprehensive Analysis of Direct Democracy in the Case of Local Government and Referendums in Osaka through Repeated Cross-sectional Surveys
    Chromatin remodeling and Induction of pluripotency via Sox2/TBP complex
    • 批准号：
      17H04044
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $11.4万
    • 财政年份：
      2017
    • 负责人：
      ITO Takashi
    • 依托单位：
      Nagasaki University
    Helicobacter pylori induces somatic mutations in TP53 via overexpression of CHAC1 in infected gastric epithelial cells
    • 批准号：
      16K19077
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    • 资助金额：
      $2.5万
    • 财政年份：
      2016
    • 负责人：
      ITO Takashi
    • 依托单位：
      Tokyo Medical and Dental University
    海外基金