神経細胞の個性を作り出す細胞種特異的遺伝子発現のゲノムレベルでの解析

对创造神经元个性的细胞类型特异性基因表达进行基因组水平分析

基本信息

  • 批准号:
    16011212
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.5万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 财政年份:
    2004
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2004 至 无数据
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

神経系は非常に多様な細胞種からなっており、それぞれの細胞の違いがどのような遺伝子発現の差異に基づくのかはゲノムの機能発現の観点から重要な問題である。近年のマイクロアレイ技術の出現により、ゲノムの全遺伝子の発現パターンを解析することが可能となった。しかし、上記の目的のためには、特定の細胞種からmRNAを取得する方法が必要である。線虫C.elegansの神経系は雌雄同体成虫で302個の神経細胞を持ち、これらは118種類の多様な細胞種からなると言われている。そこで上記の目的を達成するために、以下の方法を開発した。すべてのmRNAが持つポリAテールに結合する性質のあるポリA結合蛋白質(PABP)にタグを付加したものを、細胞特異的プロモーターを用いて目的とする細胞に発現させ、in vivoクロスリンクの後、タグに対する抗体を用いて蛋白質-RNA複合体を精製し、目的のmRNAを回収する。この方法を感覚神経の遺伝子発現解析に適用した。感覚神経特異的プロモーターでタグ付加PABPを発現させ、上記の方法で回収したmRNAをESTプロジェクトにより得られたcDNAを配列したマイクロアレイにハイブリダイズさせ、感覚神経特異的遺伝子を同定した。コントロールと比べてシグナル比の高いものから順に15遺伝子の発現パターンをGFPレポーターにより調べたところ、13遺伝子(87%)が確かに感覚神経に発現しており、ほぼ正しく感覚神経に発現する遺伝子が同定されていると考えられる。同定された遺伝子の多くは今回はじめて感覚神経特異的と同定されたものであった。また、線虫のゲノムにコードされる遺伝子全体に比較して線虫に特異的なものが多い傾向がみられた。また、上位にランクされる遺伝子にはchromatin関連、核酸結合などの性質を持つものが多い傾向があった。
The brain system is very diverse in cell species, and the differences in the development of genes, the differences in the development of functions, and the important issues. With the advent of mobile technology in recent years, it has become possible to analyze the discovery of the entire genome of the genome. The purpose of the above note is to obtain mRNA from specific cell species. C.elegans has 302 neurons in hermaphroditic adults and 118 different cell species. To achieve the above objectives, the following methods are developed. The protein binding protein (PABP) is a protein that binds to the mRNA of interest and is used in cell development, in vivo, in antibody purification, and in protein RNA complex recovery. This method is applicable to the analysis of the occurrence of neural network. The method described above was used to detect and sequence the mRNA and cDNA of PABP. 15 percent of the 13 percent (87%) of the 15 percent (87%) of the 13 percent (87%) of the 15 percent (87%) of the 15 percent (87%) of the 13 percent (87%) of the 15 percent (87%) of the 13%) of the 13 percent (87%) of the 13 percent (87%) of The same is true of the same number of children. In addition, there is a tendency to increase the number of fish in the fish. The relationship between chromosomes and nucleic acid binding properties is related to the relationship between chromosomes and nucleic acid binding properties.

项目成果

期刊论文数量(2)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Identification of ciliated sensory neuron-expressed genes in Caenorhabditis elegans using targeted pull-down of poly(A) tails
使用 Poly(A) 尾的靶向下拉鉴定秀丽隐杆线虫中纤毛感觉神经元表达的基因
  • DOI:
  • 发表时间:
    2005
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Kunitomo;H.;Uesugi;H.;Kohara;Y.;Iino;Y.
  • 通讯作者:
    Y.
The C.elegans eukaryotic initiation factor 5A homologue, IFF-1, is required for germ cell proliferation, gametogenesis and localization of the P-granule component PGL-1
线虫真核起始因子 5A 同源物 IFF-1 是生殖细胞增殖、配子发生和 P 颗粒成分 PGL-1 定位所必需的
  • DOI:
  • 发表时间:
    2004
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    M.Hanazawa;I.Kawasaki;H.Kunitomo 他4名
  • 通讯作者:
    H.Kunitomo 他4名
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  • 作者:
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飯野 雄一其他文献

自由に行動する線虫の全脳活動の計測と解析
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  • DOI:
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  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    豊島 有、 久世晃暢、田澤右京、永田大貴、金森 真奈美;佐藤 博文;石原 健;飯野 雄一
  • 通讯作者:
    飯野 雄一
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可乐定揭示了去甲肾上腺素在海马搜索过程中决策的作用。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    豊島 有;佐藤 研;三上 秀治;Stephen Wu; 佐藤 博文;Jang Moon-Sun;金森 真奈美;滝沢 拓己;大江 紗;寺本 孝行;徳永 旭将;広瀬 修; 合田 圭介;石原 健;吉田亮;飯野 雄一;Amemiya S
  • 通讯作者:
    Amemiya S
線⾍の塩⾛性⾏動の包括的理解に向けた全中枢神経活動と⾏動の⾼精度同時計測
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    豊島 有;佐藤 研;三上 秀治;Stephen Wu; 佐藤 博文;Jang Moon-Sun;金森 真奈美;滝沢 拓己;大江 紗;寺本 孝行;徳永 旭将;広瀬 修; 合田 圭介;石原 健;吉田亮;飯野 雄一
  • 通讯作者:
    飯野 雄一
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  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    大橋 智彦;酒井 奈緒子;大野 速雄;岩田 遼;飯野 雄一
  • 通讯作者:
    飯野 雄一
線虫の全脳イメージングによる行動を制御する情報処理機構の解析
使用线虫全脑成像分析控制行为的信息处理机制
  • DOI:
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    大江紗;勝目拓海;寺本孝行;豊島有;徳永旭将;Wu Stephan;広瀬修;Moon-Sun Jang;佐藤博文;滝沢拓己;久下小百合;岩崎唯史;吉田亮;飯野 雄一;石原 健
  • 通讯作者:
    石原 健

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線虫の化学走性の可塑性に関わる神経回路と機能分子の同定
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    $ 2.5万
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    22H03294
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    22H00943
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    2022
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    $ 2.5万
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知道了