Reinforcement learning on Caenorhabditis elegans
Reinforcement learning on Caenorhabditis elegans
批准号:
20K21805
负责人:
飯野 雄一
金额:
$4.16万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
财政年份:
2020
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2020-07-30 至 2024-03-31
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英文摘要
本研究では、コンピュータに強化学習により、線虫を目的の場所に向かわせるための刺激を学習させることを目的とした。後退を引き起こすASH神経に光遺伝学プローブ(ChR2)を発現させて、行動を記録しつつ機械が決定したタイミングで光刺激をし、後解像度を高く撮影した。このデータを使い、線虫の姿勢も含めて行動のモデル化を行なった。線虫の姿勢は主成分分析により、主要な5つの姿勢の線形結合として表現できることが知られている。この係数(a1;a5)の時系列を確率的生成モデル、MDN-RNN(混合正規分布-自己回帰ニューラルネットワークモデル)に学習させた。これにより、線虫行動の時系列が自動的に生成でき、さらに、混合正規分布で行動が自動的に分類されていることが分かった。このモデルをバーチャル線虫とし、その線虫に対して光刺激をコンピューターが行い、強化学習により設定したゴールに向かうよう学習を行わせた。その結果、学習により目的地に達することがよりよくできるようになることが確認された。次に再度実線虫に戻り、コンピュータが学習したタイミングで光刺激を行ったところ、実際の線虫はやはり設定したゴールに向かう傾向が見られた。以上より、線虫シミュレータが得られたことに加え、強化学習により、よりよい学習が得られたことが成果として挙げられる。
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線虫の行動制御神経回路機構の強化学習による探索
利用强化学习探索线虫行为控制神经回路机制
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[山内直寛, 森啓太, 飯野雄一, 銅谷賢治]
通讯作者:
銅谷賢治
線虫の混合密度再帰型ニューラルネットワークによる行動シミュレーションと強化学習による行動制御
使用混合密度循环神经网络的行为模拟和使用强化学习的行为控制线虫
DOI:
--
发表时间:
2020
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Yicheng Du, Robin Scheibler, Masahito Togami, Kazuyoshi Yoshii, Tatsuya Kawahara, 山内直寛]
通讯作者:
山内直寛
DOI:
10.1073/pnas.2106974119
发表时间:
2022-01-18
期刊:
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
影响因子:
11.1
作者:
[Hiroki S, Iino Y]
通讯作者:
Iino Y
線虫が侵害受容から忌避応答を引き起こす神経回路の解析
触发线虫伤害性厌恶反应的神经回路分析
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[久世晃暢, 田澤右京, 豊島有, 大江紗, 寺本孝行, 石原健, 飯野雄一]
通讯作者:
飯野雄一
Molecules and neural network underlying salt preference
盐偏好背后的分子和神经网络
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Shingo Hiroki, Hirofumi Sato, Yu Toyoshima, Llian Mabardi, Hikari Yoshitane, Hinako Mitsui, Manami Kanamori, Chie Umatani, Shinji Kanda, Mashiro Tomoioka, Koichi Hashimoto, Hirofumi Kunitomo, Yoshitaka Fukada, Takeshi Ishihara, Yuichi Iino]
通讯作者:
Yuichi Iino
共 13 条
Artificial evolution of brain structure by a whole brain-whole body model
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批准号:23K18149
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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资助金额:$4.16万
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财政年份:2023
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负责人:飯野 雄一
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依托单位:
Comprehensive understanding of avoidance behavior caused by environmental sensing
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批准号:22H00416
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$27.12万
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财政年份:2022
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负责人:飯野 雄一
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依托单位:
Study of Molecular and Neural Circuit Mechanisms for Behavioral Switching
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批准号:17H00890
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$26.96万
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财政年份:2017
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负责人:飯野 雄一
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依托单位:
機能ゲノミクスによる感覚受容と神経機能に関わる遺伝子ネットワークの解明
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批准号:18016006
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$5.12万
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财政年份:2006
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负责人:飯野 雄一
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依托单位:
行動スクリーニング系の開発
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批准号:18650100
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.11万
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财政年份:2006
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负责人:飯野 雄一
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依托单位:
線虫の化学走性学習に関わる分子パスウェイの機能解析
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批准号:18022011
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$5.38万
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财政年份:2006
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负责人:飯野 雄一
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依托单位:
神経可塑性を制御するシグナル伝達経路の機能解析
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批准号:17024014
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.66万
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财政年份:2005
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负责人:飯野 雄一
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依托单位:
機能ゲノミクスと遺伝学的に手法による線虫の化学走性学習の分子機構の解明
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批准号:17017011
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.24万
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财政年份:2005
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负责人:飯野 雄一
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依托单位:
神経細胞の個性を作り出す細胞種特異的遺伝子発現のゲノムレベルでの解析
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批准号:16011212
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.5万
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财政年份:2004
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负责人:飯野 雄一
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依托单位:
線虫の化学走性の可塑性に関わる神経回路と機能分子の同定
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批准号:15029213
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.48万
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财政年份:2003
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负责人:飯野 雄一
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依托单位:
多細胞生物における細胞個性の解析のための研究手法の開発
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批准号:15657051
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.18万
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财政年份:2003
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负责人:飯野 雄一
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依托单位:
神経系における細胞個性の理解に向けての方法の開発とリソースの整備
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批准号:15011211
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.46万
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财政年份:2003
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负责人:飯野 雄一
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依托单位:
神経系におけるゲノム機能解析のためのツール開発と行動遺伝学への応用
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批准号:14011208
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.71万
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财政年份:2002
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负责人:飯野 雄一
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依托单位:
線虫を用いた細胞特異的遺伝子発現プロファイルと細胞機能相関の研究
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批准号:13202013
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$5.12万
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财政年份:2001
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负责人:飯野 雄一
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依托单位:
線虫の化学走性とその可塑性に関わる神経回路と機能分子の同定
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批准号:13041012
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.61万
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财政年份:2001
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负责人:飯野 雄一
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依托单位:
線虫の神経系におけるRas-MAPキナーゼ系の機能の解明
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批准号:13035007
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$6.4万
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财政年份:2001
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负责人:飯野 雄一
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依托单位:
線虫の生殖と神経機能に関与する遺伝子のゲノムワイドなスクリーニング
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批准号:12024204
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.92万
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财政年份:2000
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负责人:飯野 雄一
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依托单位:
学習による線虫の行動パターンの切り替えの分子メカニズムの解明
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批准号:12048208
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$3.26万
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财政年份:2000
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负责人:飯野 雄一
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依托单位:
線虫を用いた細胞特異的遺伝子発現プロファイルと細胞機能相関の研究
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批准号:12202017
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$0.0万
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财政年份:2000
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负责人:飯野 雄一
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依托单位:
線虫の神経機能に関与する遺伝子のゲノムワイドなスクリーニング
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批准号:11149206
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.6万
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财政年份:1999
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负责人:飯野 雄一
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依托单位:
海外基金