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Reinforcement learning on Caenorhabditis elegans

Reinforcement learning on Caenorhabditis elegans
秀丽隐杆线虫的强化学习
批准号:
20K21805
负责人:
飯野 雄一
金额:
$4.16万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
财政年份:
2020
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2020-07-30 至 2024-03-31

项目摘要

项目成果

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本研究では、コンピュータに強化学習により、線虫を目的の場所に向かわせるための刺激を学習させることを目的とした。後退を引き起こすASH神経に光遺伝学プローブ(ChR2)を発現させて、行動を記録しつつ機械が決定したタイミングで光刺激をし、後解像度を高く撮影した。このデータを使い、線虫の姿勢も含めて行動のモデル化を行なった。線虫の姿勢は主成分分析により、主要な5つの姿勢の線形結合として表現できることが知られている。この係数(a1;a5)の時系列を確率的生成モデル、MDN-RNN(混合正規分布-自己回帰ニューラルネットワークモデル)に学習させた。これにより、線虫行動の時系列が自動的に生成でき、さらに、混合正規分布で行動が自動的に分類されていることが分かった。このモデルをバーチャル線虫とし、その線虫に対して光刺激をコンピューターが行い、強化学習により設定したゴールに向かうよう学習を行わせた。その結果、学習により目的地に達することがよりよくできるようになることが確認された。次に再度実線虫に戻り、コンピュータが学習したタイミングで光刺激を行ったところ、実際の線虫はやはり設定したゴールに向かう傾向が見られた。以上より、線虫シミュレータが得られたことに加え、強化学習により、よりよい学習が得られたことが成果として挙げられる。
期刊论文(15)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
線虫の行動制御神経回路機構の強化学習による探索
利用强化学习探索线虫行为控制神经回路机制
DOI: --
发表时间: 2021
期刊:
影响因子: --
作者: [山内直寛, 森啓太, 飯野雄一, 銅谷賢治]
通讯作者: 銅谷賢治
線虫の混合密度再帰型ニューラルネットワークによる行動シミュレーションと強化学習による行動制御
使用混合密度循环神经网络的行为模拟和使用强化学习的行为控制线虫
DOI: --
发表时间: 2020
期刊:
影响因子: --
作者: [Yicheng Du, Robin Scheibler, Masahito Togami, Kazuyoshi Yoshii, Tatsuya Kawahara, 山内直寛]
通讯作者: 山内直寛
DOI: 10.1073/pnas.2106974119
发表时间: 2022-01-18
期刊: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
影响因子: 11.1
作者: [Hiroki S, Iino Y]
通讯作者: Iino Y
線虫が侵害受容から忌避応答を引き起こす神経回路の解析
触发线虫伤害性厌恶反应的神经回路分析
DOI: --
发表时间: 2022
期刊:
影响因子: --
作者: [久世晃暢, 田澤右京, 豊島有, 大江紗, 寺本孝行, 石原健, 飯野雄一]
通讯作者: 飯野雄一
13
    Artificial evolution of brain structure by a whole brain-whole body model
    • 批准号:
      23K18149
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
    • 资助金额:
      $4.16万
    • 财政年份:
      2023
    • 负责人:
      飯野 雄一
    • 依托单位:
    Comprehensive understanding of avoidance behavior caused by environmental sensing
    • 批准号:
      22H00416
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
    • 资助金额:
      $27.12万
    • 财政年份:
      2022
    • 负责人:
      飯野 雄一
    • 依托单位:
    Study of Molecular and Neural Circuit Mechanisms for Behavioral Switching
    • 批准号:
      17H00890
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
    • 资助金额:
      $26.96万
    • 财政年份:
      2017
    • 负责人:
      飯野 雄一
    • 依托单位:
    機能ゲノミクスによる感覚受容と神経機能に関わる遺伝子ネットワークの解明
    • 批准号:
      18016006
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $5.12万
    • 财政年份:
      2006
    • 负责人:
      飯野 雄一
    • 依托单位:
    海外基金