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シンビオジェネシスの基礎となるプロモーター獲得原理の解明

シンビオジェネシスの基礎となるプロモーター獲得原理の解明
阐明共生发生的启动子获取原理
批准号：
17018017
负责人：
小保方 潤一
金额：
$3.78万
依托单位：
Nagoya University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2005
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2005 至 --
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17018017/
关键词：
シンビオジェネシス遺伝子移動プロモーター獲得コアプロモーター遺伝子トラップ系統植物クリプティックプロモーター

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项目成果

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シンビオジェネシスとは細胞内共生者が宿主内でオルガネラ化する過程の総称であり、共生者ゲノムにコードされていた遺伝子群の宿主核への移動が生じる。この遺伝子移動は、遺伝子配列の宿主核へ転移と、それに引き続くプロモーターの獲得、という二つのステップを含んでいる。本研究では、植物核ゲノムをモデルに、ゲノム中に転移・挿入された新規構造遺伝子がプロモーターを獲得するメカニズムを、次の4つのアプローチから解析した。(1)植物ゲノム上の転写開始位置シグナルに関する解析TATA-boxやInrなどのコンセンサス配列を持たない植物プロモーターを詳細に解析し、植物ゲノム上の転写開始点の出現位置を比較的よく予測できるアルゴリズムを開発した。(2)植物のコアプロモーターに関する情報学的解析シロイヌナズナやイネのゲノム上で実際に機能している転写開始点やプロモーターの周辺領域について、包括的なモチーフの検索・抽出と種間比較を行い、塩基配列上で上記領域を特徴づける保存モチーフ群をカタログ化された。(3)遺伝子トラップ植物系統を用いた新生プロモーターの解析プロモーターのないマーカー遺伝子をシロイヌナズナの核にランダムに挿入し、野生型の転写単位とは無関係に挿入マーカーが発現した植物系統をT2,T3世代で同定し、新生プロモーターの候補を多数収集した。(4)クリプティックプロモーター活性化機構の解析プロモーターの新生に必要なシス因子を実験的に検討するため、種々のキメラ遺伝子群を設計作製し、シロイヌナズナに導入した。形質転換植物は順調に生育しており、その種子世代を用いて、次年度以降、実際の解析を行う。
期刊论文(5)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
C-to-U RNA編集.
C 到 U RNA 编辑。
DOI： --
发表时间： 2005
期刊： 医学のあゆみ 215
影响因子： --
作者： [宮本徹也, 小保方潤一, 杉浦昌弘, 小保方潤一, 小保方潤一]
通讯作者： 小保方潤一
Systematic enrichment of translational regulatory elements.
系统丰富翻译调控元件。
DOI： --
发表时间： 2006
期刊： Analytical Biochemistry 354
影响因子： --
作者： [Nagao, I., Obokata, J.]
通讯作者： J.
Rice nuclear genome continuously integrates, shuffles and eliminates the chloroplast genome to cause chloroplast-nuclear DNA flux.
水稻核基因组不断整合、改组和消除叶绿体基因组，导致叶绿体-核DNA通量。
DOI： --
发表时间： 2005
期刊： The Plant Cell 17
影响因子： --
作者： [Matsuo, M., Ito, Y., Yamauchi, R., Obokata, J.]
通讯作者： J.
葉緑体の転写後制御と翻訳.
叶绿体的转录后控制和翻译。
DOI： --
发表时间： 2005
期刊： 蛋白質核酸酵素 50
影响因子： --
作者： [宮本徹也, 小保方潤一, 杉浦昌弘]
通讯作者： 杉浦昌弘
転写開始点の超高速決定法の開発と植物ゲノム研究への応用
  • 批准号：
    19657016
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
  • 资助金额：
    $2.3万
  • 财政年份：
    2007
  • 负责人：
    小保方 潤一
  • 依托单位：
    Nagoya University
シンビオジェネシスの基礎となるプロモーター獲得原理の解明
  • 批准号：
    18017014
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额：
    $5.63万
  • 财政年份：
    2006
  • 负责人：
    小保方 潤一
  • 依托单位：
    Nagoya University
「植物ゲノムの転写単位新生能」を定量的に評価する手法の確立と応用
  • 批准号：
    17657016
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
  • 资助金额：
    $1.86万
  • 财政年份：
    2005
  • 负责人：
    小保方 潤一
  • 依托单位：
    Nagoya University
高等植物における葉緑体RNAエディティングの分子機構の解明
  • 批准号：
    17026014
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额：
    $3.52万
  • 财政年份：
    2005
  • 负责人：
    小保方 潤一
  • 依托单位：
    Nagoya University