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シンビオジェネシスの基礎となるプロモーター獲得原理の解明

阐明共生发生的启动子获取原理

基本信息

批准号：
17018017
负责人：
小保方潤一
金额：
$ 3.78万
依托单位：
Nagoya University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

シンビオジェネシスとは細胞内共生者が宿主内でオルガネラ化する過程の総称であり、共生者ゲノムにコードされていた遺伝子群の宿主核への移動が生じる。この遺伝子移動は、遺伝子配列の宿主核へ転移と、それに引き続くプロモーターの獲得、という二つのステップを含んでいる。本研究では、植物核ゲノムをモデルに、ゲノム中に転移・挿入された新規構造遺伝子がプロモーターを獲得するメカニズムを、次の4つのアプローチから解析した。(1)植物ゲノム上の転写開始位置シグナルに関する解析TATA-boxやInrなどのコンセンサス配列を持たない植物プロモーターを詳細に解析し、植物ゲノム上の転写開始点の出現位置を比較的よく予測できるアルゴリズムを開発した。(2)植物のコアプロモーターに関する情報学的解析シロイヌナズナやイネのゲノム上で実際に機能している転写開始点やプロモーターの周辺領域について、包括的なモチーフの検索・抽出と種間比較を行い、塩基配列上で上記領域を特徴づける保存モチーフ群をカタログ化された。(3)遺伝子トラップ植物系統を用いた新生プロモーターの解析プロモーターのないマーカー遺伝子をシロイヌナズナの核にランダムに挿入し、野生型の転写単位とは無関係に挿入マーカーが発現した植物系統をT2,T3世代で同定し、新生プロモーターの候補を多数収集した。(4)クリプティックプロモーター活性化機構の解析プロモーターの新生に必要なシス因子を実験的に検討するため、種々のキメラ遺伝子群を設計作製し、シロイヌナズナに導入した。形質転換植物は順調に生育しており、その種子世代を用いて、次年度以降、実際の解析を行う。

The symbionts are responsible for the integration of the processes involved in the development of intracellular symbionts within the host. The symbionts are responsible for the migration of host nuclei from the host to the host. The host kernel of the transfer vector is transferred to the host kernel, and the host kernel is transferred to the host kernel. In this study, we analyzed the genetic diversity of plant nuclei in different ways. (1)Analysis of the TATA-box information on the plant's writing start position, detailed analysis of the plant's writing start position, comparison of the plant's writing start position, prediction and opening of the plant's writing start position. (2)Informatics analysis of plant species, including plant species, plant species, plant species. (3)The analysis of the new generation of the plant system in the T2,T3 generation is the same as that of the new generation of the plant system. (4)The analysis of the activation mechanism and the necessary factors for the realization of the activation mechanism are discussed in the design and introduction of the activation mechanism. The plants with morphological and qualitative changes are in order to reproduce, seed generations are used, the next year is declining, and the analysis is carried out.