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高等植物における葉緑体RNAエディティングの分子機構の解明

高等植物における葉緑体RNAエディティングの分子機構の解明
阐明高等植物叶绿体RNA编辑的分子机制
批准号：
17026014
负责人：
小保方 潤一
金额：
$3.52万
依托单位：
Nagoya University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2005
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2005 至 2006
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17026014/
关键词：
高等植物葉緑体RNAエディティングin vitro系トランス因子RNase感受性UVクロスリンク

项目摘要

项目成果

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本研究の目的は、生化学的手法によって、高等植物の葉緑体RNAエディティング因子を単離精製し、その構造・機能・進化を解明することである。本年度は、以下の成果が得られた。(1)RNAエディティング因子の精製前年度の研究によって改良されたタバコ葉緑体由来のin vitro RNAエディティング系から、psbE mRNAに作用するエディティング因子を含む画分を、硫安分画、イオン交換クロマトグラフィー、RNAアフィニティークロマトグラフィー等によって、濃縮・精製した。得られた活性画分を、SDSPAGEによって分離した後、トリプシン分解し、次いで、LC/MS法による質量分析にかけたが、シロイヌナズナのデーターベースを用いた検索では、目的とする蛋白質を同定するには至らなかった。そこで、出発材料をシロイヌナズナの葉緑体に変えて、上記の同様な精製・分析を進めている。(2)RNAエディティング因子のRNase感受性について葉緑体抽出液中のRNAエディティング活性がRNase感受性であることを見出した。RNase感受性を示すメカニズムはまだ不明であるが、RNA成分がRNAエディティングの(1)部位認識、(2)触媒活性、(3)活性の促進、などに関わっている可能性について、現在検討を進めている。(3)部位認識因子の複数部位RNAエディティング部位と部位認識トランス因子との間には一対一の対応関係があると考えられてきた。しかし、タバコのndhB-9部位とndhF-1部位は同一のトランス因子によって共認識されることを明らかにした。この知見は、RNAエディティング部位の進化・多様化のメカニズムを解明する上で、大きな手掛かりになる。
期刊论文(8)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
C-to-U RNA編集.
C 到 U RNA 编辑。
DOI： --
发表时间： 2005
期刊： 医学のあゆみ 215
影响因子： --
作者： [宮本徹也, 小保方潤一, 杉浦昌弘, 小保方潤一, 小保方潤一]
通讯作者： 小保方潤一
Identification of plant promoter constituents by analysis of local dstribution of short sequences.
通过分析短序列的局部分布来鉴定植物启动子成分。
DOI： --
发表时间： 2007
期刊： BMC Genomics 8
影响因子： --
作者： [Yamamoto, YY., Ichida, H., Matsui, M., Obokata, J., Sakurai, T., Satou, M., Seki, M., Shinozaki, K., Abe, T.]
通讯作者： T.
Remote control of photosynthetic genes by the mitochondrial respiratory chain.
DOI： 10.1111/j.1365-313x.2006.02839.x
发表时间： 2006-09
期刊： The Plant journal : for cell and molecular biology
影响因子： --
作者： [M. Matsuo;J. Obokata]
通讯作者： M. Matsuo;J. Obokata
Systematic enrichment of translational regulatory elements.
系统丰富翻译调控元件。
DOI： --
发表时间： 2006
期刊： Analytical Biochemistry 354
影响因子： --
作者： [Nagao, I., Obokata, J.]
通讯作者： J.
共 7 条
    転写開始点の超高速決定法の開発と植物ゲノム研究への応用
    • 批准号：
      19657016
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Exploratory Research
    • 资助金额：
      $2.3万
    • 财政年份：
      2007
    • 负责人：
      小保方 潤一
    • 依托单位：
      Nagoya University
    シンビオジェネシスの基礎となるプロモーター獲得原理の解明
    • 批准号：
      18017014
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $5.63万
    • 财政年份：
      2006
    • 负责人：
      小保方 潤一
    • 依托单位：
      Nagoya University
    「植物ゲノムの転写単位新生能」を定量的に評価する手法の確立と応用
    • 批准号：
      17657016
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Exploratory Research
    • 资助金额：
      $1.86万
    • 财政年份：
      2005
    • 负责人：
      小保方 潤一
    • 依托单位：
      Nagoya University
    シンビオジェネシスの基礎となるプロモーター獲得原理の解明
    • 批准号：
      17018017
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额：
      $3.78万
    • 财政年份：
      2005
    • 负责人：
      小保方 潤一
    • 依托单位：
      Nagoya University
    海外基金