高等植物における葉緑体RNAエディティングの分子機構の解明
高等植物における葉緑体RNAエディティングの分子機構の解明
批准号:
15030219
负责人:
小保方 潤一
金额:
$4.1万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2003
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2003 至 2004
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RNAエディティングとはゲノムDNAの配列がRNAレベルで編集(エディティング)される現象である。タバコの葉緑体ゲノムは約16万塩基対の大きさがあり、これまでC→U変換型のエディティング部位が34カ所同定されている。これらのエディティング部位周辺には共通の配列や構造が見つからず、これらのCがどのようにして認識されているのかが大きな謎とされてきた。本研究課題では、in vitro RNAエディティング系を用いて葉緑体におけるRNAエディティングの分子機構の解析を進めてきた。その結果、psbE遺伝子のmRNAではエディティング部位の上流-15から-6(エディティングされるCを+1)の領域に56kDaのトランス因子(p56)が、また、petB mRNAでは-20から-6までの配列に70kDaのトランス因子(p70)が、それぞれ配列特異的に結合することが明らかになった。つまり、個々のエディティング部位はそれぞれ特異的なタンパク質によって認識されていることが強く示唆された。ついで、p56をモデルに、エディティング部位とトランス因子の相互作用を、様々な塩基置換やUVクロスリンク法などを用いて詳しく解析した。その結果、p56とエディティング部位との直接の結合がpsbE mRNAのエディティング反応に必須であることが明らかになった。これらの結果から、部位特異的因子によるエディティング部位認識機構を世界で初めて示した。それは、トランス因子はまず上流シス配列に強く結合し、その一部を標的のCに近付け、接触すればエディティング反応が進行する、というものである。一つのタンパク質が2段階でエディティング部位を認識するこの機構は、他のRNAエディティングにはない、葉緑体独自のものである。さらに、エディティング部位が部位特異的因子に直接認識されることから、一つのタンパク質が部位決定とC→U変換反応の両方を行う可能性が示唆された。
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In vitro evolution of translational regulatory cis-elements.
翻译调节顺式元件的体外进化。
DOI:
--
发表时间:
2004
期刊:
Endocytobiosis and Cell Research 15
影响因子:
--
作者:
[Nagao, I., Masuyama, K., Obokata, J.]
通讯作者:
J.
Rice nuclear genome continuously integrates, shuffles and eliminates the chloroplast genome to cause chloroplast-nuclear DNA flux.
水稻核基因组不断整合、改组和消除叶绿体基因组,导致叶绿体-核DNA通量。
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
The Plant Cell 17
影响因子:
--
作者:
[Matsuo, M., Ito, Y., Yamauchi, R., Obokata, J.]
通讯作者:
J.
Miyamoto, T., J Obokata, M Sugiura: "A site-specific factor interacts directly and sequence specifically with its cognate RNA editing site in chloroplast transcripts."Proc Natl Acad Sci USA. 101. 48-52 (2004)
Miyamoto, T.、J Obokata、M Sugiura:“位点特异性因子与叶绿体转录本中的同源 RNA 编辑位点直接相互作用并特异性测序。”Proc Natl Acad Sci USA。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
DOI:
10.1073/pnas.0307163101
发表时间:
2004-01-06
期刊:
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
影响因子:
11.1
作者:
[Miyamoto, T, Obokata, J, Sugiura, M]
通讯作者:
Sugiura, M
Sasaki, T., Y.Yukawa, T.Miyamoto, J.Obokata, M.Sugiura: "Identification of RNA editing sites in chloroplast transcripts from the maternal and paternal progenitors of tobacco (Nicotiana tabacum) : comparative analysis shows the involvement of distinct tran
Sasaki, T., Y.Yukawa, T.Miyamoto, J.Obokata, M.Sugiura:“鉴定烟草(Nicotiana tabacum)母本和父本祖先叶绿体转录本中的 RNA 编辑位点:比较分析表明不同
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 10 条
転写開始点の超高速決定法の開発と植物ゲノム研究への応用
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批准号:19657016
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2007
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负责人:小保方 潤一
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依托单位:
シンビオジェネシスの基礎となるプロモーター獲得原理の解明
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批准号:18017014
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$5.63万
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财政年份:2006
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负责人:小保方 潤一
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依托单位:
「植物ゲノムの転写単位新生能」を定量的に評価する手法の確立と応用
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批准号:17657016
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.86万
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财政年份:2005
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负责人:小保方 潤一
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依托单位:
高等植物における葉緑体RNAエディティングの分子機構の解明
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批准号:17026014
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.52万
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财政年份:2005
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负责人:小保方 潤一
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依托单位:
シンビオジェネシスの基礎となるプロモーター獲得原理の解明
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批准号:17018017
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.78万
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财政年份:2005
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负责人:小保方 潤一
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依托单位:
植物の光合成遺伝子システムに特有なコアプロモーター構成の起源と役割
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批准号:16013217
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.1万
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财政年份:2004
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负责人:小保方 潤一
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依托单位:
植物の光合成遺伝子システムに特有なコアプロモーター構成の起源と役割
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批准号:15013222
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.84万
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财政年份:2003
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负责人:小保方 潤一
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依托单位:
植物の光合成遺伝子システムに特有なコアプロモーター構成の起源と役割
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批准号:14014216
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.33万
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财政年份:2002
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负责人:小保方 潤一
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依托单位:
In vitro進化を利用した翻訳制御配列の包括的検索手法の開発
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批准号:13878143
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$1.09万
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财政年份:2001
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负责人:小保方 潤一
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依托单位:
植物の光合成遺伝子システムに特有なコアプロモーター構造の起源と役割
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批准号:13206029
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
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资助金额:$3.52万
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财政年份:2001
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负责人:小保方 潤一
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依托单位:
高等植物mRNAで見い出された翻訳エンハンサー因子の作用メカニズム
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批准号:08680732
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1996
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负责人:小保方 潤一
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依托单位:
タバコ光合成核遺伝子のRNAエディティング
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批准号:06640830
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.28万
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财政年份:1994
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负责人:小保方 潤一
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依托单位:
葉緑体電子伝達鎖成分を支配する遺伝子群に作用する転写制御因子の解析
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批准号:04257202
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.92万
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财政年份:1992
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负责人:小保方 潤一
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依托单位:
光化学系工サブユニット遺伝子群の発現の誘導に関わるシス制御領域の同定
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批准号:03740339
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1991
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负责人:小保方 潤一
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依托单位:
光化学系複合体の可塑性を支配する遺伝子群の発現調節機構の解析
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批准号:03262201
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.54万
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财政年份:1991
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负责人:小保方 潤一
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依托单位:
重複遺伝子族によってコードされている光化学系Iサブユニットの解析
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批准号:02854083
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1990
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负责人:小保方 潤一
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依托单位:
核DNAにコ-ドされている光化学系Iサブユニットの分子構築機構の解析
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批准号:01621501
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.83万
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财政年份:1989
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负责人:小保方 潤一
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依托单位:
光化学系工タンパク質群の遺伝子構造及び生合成機構に関する研究
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批准号:62621501
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$0.83万
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财政年份:1987
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负责人:小保方 潤一
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依托单位:
核DNAにコードされている光化学系IサブユニットのcDNAクローンの作製
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批准号:62740385
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
-
财政年份:1987
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负责人:小保方 潤一
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依托单位: