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セル・ソーターとGeneChipを使用した単一根毛細胞の性質の解析

使用细胞分选仪和基因芯片分析单根毛细胞的特性

基本信息

批准号：
17027029
负责人：
和田拓治
金额：
$ 2.94万
依托单位：
The Institute of Physical and Chemical Research
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至 2006
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17027029/
关键词：
セル・ソーター GFP 表皮細胞シロイヌナズナ bHLH遺伝子セルソーター

项目摘要

本年度は、根毛細胞で発現するbHLH遺伝子(GL3,EGL3,AtMYC1)のpromoter::GFP形質転換体から根毛細胞由来のGFP蛍光プロトプラストをセル・ソーターで選別した。さらに選別した細胞からtotal RNAを抽出した後、Gene Chip解析を実施した。各bHLH遺伝子形質転換体と同様の処理を施したCol-Oの遺伝子発現パターンとも比較すると、GL3遺伝子発現領域とCol-Oの根totalRNAが似ており、EGL3遺伝子発現領域とAtMYC1遺伝子発現領域が似ていた。次に3種のbHLH遺伝子発現領域間で比較して、各遺伝子発現領域で大きく発現変動している遺伝子を調べた。GL3遺伝子発現領域で発現変動している遺伝子数は3bHLH遺伝子発現領域の中で最も多く、発現上昇している遺伝子は代謝、核酸・タンパク質・アミノ酸の生産や修飾、転写関連遺伝子が見られ、逆に発現低下している遺伝子はイオンやタンパク質輸送関連遺伝子、アミノ酸のリン酸化、環境応答関連遺伝子、生合成・異化に関連する遺伝子であった。このことはGL3遺伝子発現領域に静止中心が含まれており、遺伝子発現が活発であるからと考えられる。EGL3遺伝子領域で減少している遺伝子にはタンパク質の生合成・修飾や輸送、転写に関わる遺伝子が多く占めていた。これらの遺伝子は上部のAtMYC1遺伝子発現領域では発現が上昇していることから、EGL3遺伝子発現領域では遺伝子発現全体が多少落ちていると考えられる。AtMYC1遺伝子発現領域では輸送・タンパク質リン酸化に関わる遺伝子が発現上昇していた。この遺伝子リストには、EXP8のような細胞伸長関連遺伝子も含まれていた。本研究において、根毛細胞形態形成における遺伝子発現の新たな理解をすることができた。

This year は, root hair cells で発 now する bHLH heritage 伝 child (GL3, EGL3, AtMYC1) の promoter: : GFP form quality planning in body から hair cell origin の GFP 蛍 light プロトプラストをセル · ソーターで choose don't した. Youdaoplaceholder0 select the た cells らtotal RNAを extract the <s:1> た, then Gene Chip analysis を apply the た. Traces of the bHLH 伝 child form quality planning in body と with others の処 Richard を shi した Col - O の heritage 伝 son 発 now パターンとも compare すると, GL3 but 伝発 fields と Col - O の root totalRNA が like ており, EGL3 but 伝発 fields と AtMYC1 heritage 伝 son 発 fields が like ていた. Three times にの bHLH heritage 伝 son 発で comparison between fields して, all survived 伝発 fields で big きく発 now - move している heritage 伝 son を adjustable べた. GL3 posthumous son 伝発 fields で発 now - move している posthumous son 伝は 3 BHLH heritage 伝 child 発 now field のでもく, most 発 now rising している heritage 伝は metabolism, nucleic acid, タンパク qualitative · アミのノ acid production や modification, planning to write masato even survived 伝が see られ, reverse に発 now low している heritage 伝 son はイオンやタンパク mass transport masato even 伝 , アミノ acid のリン acidification, environmental 応 answer masato even heritage 伝, biosynthesis, alienation に masato even する posthumous son 伝であった. このことは GL3 posthumous son 伝発 fields に quiescent center contains がまれており, but 伝発が now live 発であるからと exam えられる. EGL3 heritage 伝 sub-fields で reduce している heritage 伝 son にはタンパク qualitative の biosynthesis, modified や delivery, planning to write に masato わる heritage 伝 son がく accounting for めていた. Upper これらの posthumous son 伝はの AtMYC1 heritage 伝 son 発 fields では発 now rising がしていることから, EGL3 but 伝発 fields では heritage 伝 son how many fall ち発 now all がていると exam えられる. AtMYC1 posthumous son 伝発 fields では conveying, タンパク qualitative リン acidification に masato わる heritage 伝 son が発 now rising していた. The <s:1> cultural heritage 伝 sub リストにリストに, EXP8 <s:1> ような cell elongation related heritage 伝 sub まれて contains まれてたたた. In this study, におにおて, the morphology of root hair cells is formed by における, and 伝 offspring are found. A new たな understanding is achieved at をする, とがで, and た.