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NMRと糖鎖ライブラリーを利用した糖タンパク質の細胞内運命の決定機構の研究

利用NMR和聚糖文库研究决定糖蛋白细胞内命运的机制

基本信息

批准号：
17028047
负责人：
山口芳樹
金额：
$ 3.07万
依托单位：
Nagoya City University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至 2006
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-17028047/
关键词：
糖鎖生体分子薬学分子認識蛋白質生物物理分析科学

项目摘要

1.糖タンパク質と細胞内レクチンとの相互作用糖鎖修飾は、タンパク質の品質管理・輸送に密接に関係していることが明らかとされている。糖鎖ライブラリーを用いて、様々な細胞内レクチンとの相互作用を主にNMR法およびフロンタルアフィニティクロマトグラフィー法により解析した。これまでにカルレティキュリン、カルネキシン、Fbs1、VIP36、VIPL、ERGIC-53を対象として糖鎖認識の体系的解析を行い、細胞内レクチンの糖鎖の結合特異性および相互作用様式を明らかとした。これらの成果から、細胞内レクチンによる糖鎖認識とN型糖鎖のプロセシングの関係を明らかにすることができた。2.NEDD8修飾によるユビキチンリガーゼの活性化メカニズムの構造的基盤ユビキチンをチャージしたE2はE3との相互作用を介して基質にユビキチンを転移する。これまでSCF複合体型E3のcullin-1サブユニットがNEDD8による修飾を受けると、E2のSCF複合体へのリクルートメントが促進され、基質のユビキチン化が亢進することが報告されている。しかしながら、NEDD8修飾によるそのメカニズムの詳細は不明であった。そこで、SCF複合体のNEDD8修飾による活性化メカニズムを構造生物学的に明らかにすることを試みた。NMRによる化学シフト摂動と部位特異変異実験の結果、NEDD8はユビキチンのE2(UBC4)と相互作用するが、NEDD8自身のE2(UBC12)とは相互作用しないことが明らかとなった。興味深いことに、UBC4分子表面上でNEDD8結合部位とE3結合部位は隣接していることが判明した。これらの成果から、ひとたびNEDD8の修飾を受けたSCF複合体はNEDD8自身のE2であるUBC12を排除しつつ、RBX1と協働してユビキチンのE2であるUBC4を選択的にリクルートすることにより、高いE3活性を獲得しているというモデルを提唱した。

1. Glycosaminoglycans interacted with each other in the cells. The interacting sugars were repaired, and the quality control devices were sent to close contact. The NMR method was used to analyze the interaction between glucose and glucose in the cell. The results show that Fbs1, VIP36, VIPL, and ERGIC-53 are similar to the analysis of the sugar recognition system and the combination of specific interactions with specific interactions. The results were confirmed by the results of the study, the results of the results, the intracellular sugar, the sugar, the N-type sugar, the sugar. 2.NEDD8 revises the interaction between the two parts of the body by activating the substrate made by the device. The SCF clone E3

项目成果

期刊论文数量（18）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

薬学教科書シリーズ第2巻物理系薬学(日本薬学会編)

药学教科书系列第2卷物理药学（日本药学会编）

DOI：
发表时间：
2006
期刊：
影响因子：
0
作者：
Kato;D;Nakagawa M;Y.Yamaguchi et al.;H.Sasakawa et al.;S.Tashiro et al.;M.Kawasaki et al.;M.Nakasako et al.;M.Akutsu et al.;S.Tashiro et al.;加藤晃一他
通讯作者：
加藤晃一他

アミノピリジン標識糖鎖の質量分析法

氨基吡啶标记糖链的质谱分析