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糖鎖を認識するユビキチンリガーゼの構造生物学的解析

识别糖链的泛素连接酶的结构生物学分析

基本信息

批准号：
16790037
负责人：
山口芳樹
金额：
$ 2.18万
依托单位：
Nagoya City University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至 2005
项目状态：
已结题

项目摘要

SCF^<Fbs1>は細胞質において、N結合型糖鎖を有するタンパク質を認識して分解マーカーであるユビキチン鎖を連結する酵素であり、プロテアソームによる糖タンパク質の分解において重要な役割を担っている。これまでSCF^<Fbs1>の基質認識ユニットであるFbs1の糖タンパク質に対する分子認識の詳細を前年度まで明らかとしてきた。今年度は、同じファミリーに属するFbs2の糖鎖結合特異性をフロンタルアフィニティクロマトグラフィにより明らかとした。Fbs1は糖鎖のトリマンノシルコアと糖鎖の結合しているAsn残基を認識する一方、Fbs2は広い糖鎖基質特異性を示すことが明らかとなった。また、Fbs1と密接に生体内で関係しているPeptide : N-glycanase(PNGase)は細胞質においてN結合型糖鎖の結合部位にあたるアスパラギン残基側鎖のアミド結合を加水分解し、糖鎖を遊離させる酵素として機能している。N末端領域に存在するPUBドメインは小胞体関連分解(ERAD)に関与するタンパク質(ユビキチン、19SプロテアソームサブユニットS4など)と相互作用することが報告されており、PUBドメインの立体構造は、糖タンパク質分解における糖鎖修飾系とユビキチン修飾系の連携の構造基盤を明らかにする上で重要である。NMR解析の結果、PUBドメインは、αヘリックスに富むフォールドであることが判明した。またそのユビキチン結合部位を同定することに成功した。

SCF <Fbs1>is responsible for the degradation of cytosol and N-linked glycoproteins. The molecular knowledge of SCF <Fbs1>and FBS1 is detailed in the previous year. This year's sugar chain binding specificity of Fbs2 is similar to that of Fbs2. Fbs1 is a protein that binds to a sugar chain, and Fbs2 is a protein that binds to a sugar chain. Peptide : N-glycanase(PNGase) Cytoplasmic binding site of N-linked glycan chain, binding site of N-linked glycan chain, hydrolysis of glycan chain and enzyme function. The existence of PUB in the N-terminal domain is of great importance to the structural basis for the interaction between PUB and ERAD (small cell associated decomposition). The results of NMR analysis show that PUB can be used to determine the content of the protein. The combination of the two parts was successful.

项目成果

期刊论文数量（14）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Development of structural analysis of sulfated N- glycans by multi-dimensional HPLC mapping methods.

通过多维 HPLC 作图方法开发硫酸化 N-聚糖结构分析。

DOI：
发表时间：
2005
期刊：
Glycobiology 15
影响因子：
0
作者：
Yagi;H.;Takahashi;N.;Yamaguchi;Y.;Kimura;N.;Uchimura;K.;Kannagi;R.;Kato;K.
通讯作者：
K.

薬学教科書シリーズ第2巻物理系薬学(日本薬学会編)

药学教科书系列第2卷物理药学（日本药学会编）

DOI：
发表时间：
2006
期刊：
影响因子：
0
作者：
Kato;D;Nakagawa M;Y.Yamaguchi et al.;H.Sasakawa et al.;S.Tashiro et al.;M.Kawasaki et al.;M.Nakasako et al.;M.Akutsu et al.;S.Tashiro et al.;加藤晃一他
通讯作者：
加藤晃一他

アミノピリジン標識糖鎖の質量分析法

氨基吡啶标记糖链的质谱分析

DOI：
发表时间：
2005
期刊：
影响因子：
0
作者：
通讯作者：

ファルマシア

法玛西亚

DOI：
发表时间：
2005
期刊：
影响因子：
0
作者：
Kato;D;Nakagawa M;Y.Yamaguchi et al.;H.Sasakawa et al.;S.Tashiro et al.;M.Kawasaki et al.;M.Nakasako et al.;M.Akutsu et al.;S.Tashiro et al.;加藤晃一他;神谷由紀子他;山口芳樹他
通讯作者：
山口芳樹他

Molecular mechanism of ubiquitin recognition by GGA3 GAT domain