小胞体分子シャペロン・カルレティキュリンの糖タンパク質認識メカニズムの解明
小胞体分子シャペロン・カルレティキュリンの糖タンパク質認識メカニズムの解明
批准号:
14771312
负责人:
山口 芳樹
金额:
$2.05万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2002
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2002 至 2003
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英文摘要
各種オリゴ糖鎖(Glcα(1-3)Man_9GlcNA_<C2>、Glcβ(1-3)Man_9GlcNA_<C2>、Man_9GlcNA_<C2>、Glcα(1-3)Manα(1-2)Manα(1-2)Man、Manα(1-2)Manα(1-2)Man、[1^<-13>C]Glcα(1-3)Man)を用いてカルレティキュリンとの相互作用のNMR解析を行うことにより、カルレティキュリンはGlc_1Man_9GlcNA_<C2>のなかでも特に非還元末端のGlcα(1-3)Manα(1-2)Manα(1-2)Man部分を認識していることを明らかとした。グルコース残基の結合様式が重要であることから、このグルコース近傍のコンフォーメーションをNMR法により詳細に解析することを試みた。そのため、安定同位体標識を施した糖鎖リガンド([1^<-13>C]Glcα(1-3)Man)とカルレティキュリンとをモル比で2:1で共存させ、糖鎖の結合・解離状態の化学交換を利用して転移核オーバーハウザー効果(TRNOE)を測定することにより、糖鎖リガンドのコンフォーメーションを解析した。スペクトル解析の結果、Glc H1、とMan H3、Glc H2間にTRNOEが観測されることが明らかとなった。Man H3、Glc H2由来のピーク強度の混合時間依存性から、プロトン間の距離を算出したところ、Man H3とGlc H2間の距離は約2.5Åあることが判明した。遊離状態における当該プロトン間の距離は、2.33〜2.50Åであることから、結合した状態にあっても糖鎖の立体配置は変化しないことが明らかとなった。さらに、カルレティキュリンに結合した状態のGlcα(1-3)Manのグリコシド結合の周りの二面角(φ、ψ)は-65°、+10°と見積もることができた。
期刊论文(2)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Ichiro Matsuno et al.: "Synthesis of Monoglucosylated High-Mannose-Type Dodecasaccharide, a Putative Ligand for Molecular Chaperone, Calnexin, and Calreticurin"Journal of the American Chemical Society. 125・12. 3402-3403 (2003)
Ichiro Matsuno 等人:“单葡萄糖基化高甘露糖型十二糖的合成,分子伴侣、钙联蛋白和钙网蛋白的假定配体”,美国化学会杂志 125・12 3402-3403。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
高橋禮子, 栗本英治, 山口芳樹, 加藤晃一: "多次元HPLC法のグライコミクス解析への展開"蛋白質 核酸 酵素. 48・10. 1412-1418 (2003)
Reiko Takahashi、Eiji Kurimoto、Yoshiki Yamaguchi、Koichi Kato:“糖组分析多维 HPLC 方法的开发”蛋白质核酸酶 48・10(2003 年)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
NMR構造生物学に基づいた薬物相互作用の解析と神経変性疾患への治療応用
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批准号:20023033
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.61万
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财政年份:2008
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负责人:山口 芳樹
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依托单位:
NMR構造生物学による神経変性疾患の発症機構の解析
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批准号:18023032
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.86万
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财政年份:2006
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负责人:山口 芳樹
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依托单位:
ユビキチン・プロテアソーム系の破綻に起因する神経変性疾患のNMR構造生物学
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批准号:17025036
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.86万
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财政年份:2005
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负责人:山口 芳樹
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依托单位:
NMRと糖鎖ライブラリーを利用した糖タンパク質の細胞内運命の決定機構の研究
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批准号:17028047
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.07万
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财政年份:2005
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负责人:山口 芳樹
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依托单位:
糖鎖を認識するユビキチンリガーゼの構造生物学的解析
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批准号:16790037
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.18万
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财政年份:2004
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负责人:山口 芳樹
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依托单位:
NMRを用いた糖タンパク質の高次構造解析
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批准号:98J03932
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.54万
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财政年份:1998
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负责人:山口 芳樹
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依托单位:
海外基金