全身性エリテマトーデスの遺伝素因における荘型インターフェロン制御系分子群の役割

庄型干扰素调节系统分子在系统性红斑狼疮遗传易感性中的作用

• 批准号: 18018005
• 负责人: 土屋 尚之
• 金额: $ 4.74万
• 依托单位: University of Tsukuba
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2007
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18018005/
• 关键词: 全身性エリテマトーデス; I型インターフェロン; STAT4; IRF5; HapMap; 発現解析; インターフェロン; interferon regulatory factor 5 (IRF5); 多型; ハプロタイプ; 疾患感受性

1.Type I interferon(IFN)pathway関連55遺伝子より選択した384tagSNPを搭載したマイクロアレイを作成し、全身性エリテマトーデス(SLE)105例、健常対照群102例の遺伝子型を決定し、関連解析を施行した。ヨーロッパ系集団において関連が報告されたSTAT4においてもっとも顕著な関連が検出され、STAT4が集団を超えたSLE関連遺伝子であることが強く示唆された。また、それ以外にも、過去に報告のない25遺伝子において、関連の可能性が示唆されるSNPが見出された。これらを有力な候補遺伝子として、今後、検体数を増やして関連を確認するとともに、高密度マッピングにより、機能的多聖部位を見出す計画である。2.ヨーロッパ系集団においてSLEとの関連が確立しているIRF5こ関して、日本人集団における関連解析を施行し、IRF5が集団を超えたSLE感受性遺伝子であることを見出した。しかしながら、そのハプロタイプ構造は、ヨーロッパ系集団と顕著に異なり、ヨーロッパ系集団においてリスクハプロタイプを構成するexon6の10アミノ酸挿入、polyAsignal部位多型は日本人では関連が見られず、逆に、ヨーロッパ系集団には見られないintron 1のSNPに有意な関連が検出された。3.HapMapドナーより樹立されたB細胞株のトランスクリプトームのデータベース(GENEVAR)を利用して、SNPとトランスクリプトームとの関連を解析する方法を確立した。この方法により、日本人集団においてSLEと関連するintron 1多型が、IRF5自体およびIRF5によって誘導される遺伝子群のmRNA量と有意に関連することから、機能的多型と考えられることを示した。

1. Type I interferon(IFN)pathway 55 gene pairs were selected, 384 tagSNPs were carried out, 105 systemic interferon (SLE), 102 healthy control groups were determined, and correlation analysis was performed. The relationship between STAT4 and SLE is reported by STAT 4. The relationship between STAT4 and SLE is reported by STAT 4. 25 SNPs reported in the past, showing the likelihood of association For example, the number of candidates will increase in the future, the number of candidates will increase in the future, and the number of candidates will increase in the future. 2. The relationship between SLE and IRF 5 was established. The relationship between SLE and IRF5 was analyzed. The structure of the gene is composed of exon6 and 10 of the gene, polysignature site polymorphism, Japanese gene, reverse gene, gene, and SNP. 3. HapMap was used to establish the method of analyzing the relationship between SNP and gene expression in B cell lines (GENEVAR). This method is used to detect the intron 1 polymorphism in SLE, IRF5 and IRF5, and to detect the mRNA level of the intron 1 polymorphism in SLE and IRF5.

项目成果

Total number of risk alleles in four susceptibility genes as a marker for genetic risk to SLE.

四个易感基因中风险等位基因的总数作为 SLE 遗传风险的标记。

• 发表时间: 2007
• 作者: Tsuchiya;N;et. al.
• 通讯作者: et. al.

Diversity of human immune system multigene families and its implication in the genetic background of rheumatic diseases

人类免疫系统多基因家族的多样性及其在风湿性疾病遗传背景中的意义

• 发表时间: 2007
• 期刊: Curr Med Chem 14
• 作者: Tsuchiya N;Kyogoku C;Miyashita R;Kuroki K.
• 通讯作者: Kuroki K.

Association of LILRA2 (ILT1, LIR7) splice site polymorphism with systemic lupus erythematosus and microscopic polyangiitis

• DOI: 10.1038/gene.2008.5
• 发表时间: 2008-04-01
• 期刊: GENES AND IMMUNITY
• 影响因子: 5
• 作者: Mamegano, K.;Kuroki, K.;Tsuchiya, N.
• 通讯作者: Tsuchiya, N.

目本人における全身性エリテマトーデスとinterferon regulatory factor 5(IR殉との関連

系统性红斑狼疮与干扰素调节因子5（IR死亡率）之间的关系

• 发表时间: 2007
• 作者: 土屋;尚之;ほか
• 通讯作者: ほか

A SNP in IRF5 intron 1 defines a protective haplotype against SLE in Japanese.

IRF5 内含子 1 中的 SNP 定义了日语中针对 SLE 的保护性单倍型。

• 发表时间: 2007
• 作者: Kawasaki;A;et. al.
• 通讯作者: et. al.