変異体の機能と構造との解析によるチトクロム酸化酵素のプロトンポンプ機構の研究
変異体の機能と構造との解析によるチトクロム酸化酵素のプロトンポンプ機構の研究
批准号:
18054030
负责人:
島田 秀夫
金额:
$4.16万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2006
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2006 至 2007
中文摘要
チトクロム酸化酵素は分子状酸素を還元し水にするとともにプロトン(H^+)を膜内側から外側に能動輸送 (ポンプ)する膜蛋白質複合体である。ウシ酵素のX線構造と変異体解析により我々はH-pathwayがH^+ポンプ経路であると提唱している。この経路は、水素結合ネットワークと、これと膜内側分子表面とを連結する水経路とから構成される。この水素結合ネットワークは、補欠分子であるヘムaの側鎖ホルミル基およびプロピオン酸基と水素結合をする。したがって、H^+まヘムaにより駆動されることが示唆される。今回このヘムa側鎖プロピオン酸基の役割を検証するモデル実験を実施した。ヘムbの側鎖プロピオン酸基(6,7位)が、それぞれメチル基に置換されたヘムを合成した。再構成法により6位欠損ヘムをチトクロムP450camに導入し、その機能を検討するとともにX線構造を決定した。構造変化は最小限であり、機能への影響も顕著でなかった(JACS,130,432,2008)。これまで、この側鎖は、ヘムの安定化に重要であるとともに、電子供与体からヘム鉄への電子伝達経路を形成すると提唱されていたが、上記結果は、これらを支持しなかった。側鎖欠損ヘムを利用した側鎖機能の検証が可能である。H^+ポンプの経路と機構との研究には、H^+ポンプ過程での機能中心アミノ酸側鎖官能基の化学構造および立体構造変化を赤外分光法で捕捉することが必要である。しかし、赤外スペクトルの検出と帰属のためには、無細胞系で蛋白合成をし、機能中心アミノ酸の部位特異的安定同位体標識化が不可欠である。細菌のチトクロム酸化酵素を大腸菌の無細胞系で機能発現する研究を10年続け、本年チトクロムc酸化活性と吸収スペクトルが正常である酵素標品を得る系を確立した。この無細胞発現系では、アミノ酸残基の標識化に加え、人工ヘムの導入も可能であり、構造に基づいた反応機構研究に有効である。
英文摘要
チトクロム酸化酵素は分子状酸素を還元し水にするとともにプロトン(H^+)を膜内側から外側に能動輸送 (ポンプ)する膜蛋白質複合体である。ウシ酵素のX線構造と変異体解析により我々はH-pathwayがH^+ポンプ経路であると提唱している。この経路は、水素結合ネットワークと、これと膜内側分子表面とを連結する水経路とから構成される。この水素結合ネットワークは、補欠分子であるヘムaの側鎖ホルミル基およびプロピオン酸基と水素結合をする。したがって、H^+まヘムaにより駆動されることが示唆される。今回このヘムa側鎖プロピオン酸基の役割を検証するモデル実験を実施した。ヘムbの側鎖プロピオン酸基(6,7位)が、それぞれメチル基に置換されたヘムを合成した。再構成法により6位欠損ヘムをチトクロムP450camに導入し、その機能を検討するとともにX線構造を決定した。構造変化は最小限であり、機能への影響も顕著でなかった(JACS,130,432,2008)。これまで、この側鎖は、ヘムの安定化に重要であるとともに、電子供与体からヘム鉄への電子伝達経路を形成すると提唱されていたが、上記結果は、これらを支持しなかった。側鎖欠損ヘムを利用した側鎖機能の検証が可能である。H^+ポンプの経路と機構との研究には、H^+ポンプ過程での機能中心アミノ酸側鎖官能基の化学構造および立体構造変化を赤外分光法で捕捉することが必要である。しかし、赤外スペクトルの検出と帰属のためには、無細胞系で蛋白合成をし、機能中心アミノ酸の部位特異的安定同位体標識化が不可欠である。細菌のチトクロム酸化酵素を大腸菌の無細胞系で機能発現する研究を10年続け、本年チトクロムc酸化活性と吸収スペクトルが正常である酵素標品を得る系を確立した。この無細胞発現系では、アミノ酸残基の標識化に加え、人工ヘムの導入も可能であり、構造に基づいた反応機構研究に有効である。
期刊论文(13)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
登录
查看更多内容
DOI:
10.1016/j.bbabio.2006.04.028
发表时间:
2006-05
期刊:
Biochimica et biophysica acta
影响因子:
--
作者:
[S. Yoshikawa;K. Muramoto;K. Shinzawa-Itoh;H. Aoyama;T. Tsukihara;T. Ogura;K. Shimokata;Y. Katayama;H. Shimada]
通讯作者:
S. Yoshikawa;K. Muramoto;K. Shinzawa-Itoh;H. Aoyama;T. Tsukihara;T. Ogura;K. Shimokata;Y. Katayama;H. Shimada
DOI:
10.1021/ja077902l
发表时间:
2008-01-16
期刊:
JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY
影响因子:
15
作者:
[Harada, Katsuyoshi, Sakurai, Keisuke, Hayashi, Takashi]
通讯作者:
Hayashi, Takashi
Mutational analyses of the proton pumping H-pathway of bacterial cytochrome c oxidase
细菌细胞色素c氧化酶质子泵H通路的突变分析
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
生物物理 46
影响因子:
--
作者:
[Kakiuchi, Seigo]
通讯作者:
Seigo
Effect of overexpressed YidC on the expression of Paracoccus denitrificans cytochrome c oxidase gene in an Escherichia coli cell-free transcription/translation system
过表达YidC对大肠杆菌无细胞转录/翻译系统中脱氮副球菌细胞色素c氧化酶基因表达的影响
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[片山 幸江, 他]
通讯作者:
他
Resonance Enhancement of the νFe=O Raman Mode upon Red Excitation
红色激发下νFe=O拉曼模式的共振增强
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
生物物理 46
影响因子:
--
作者:
[Ikemura, Kenichiro]
通讯作者:
Kenichiro
共 13 条
ウシチトクロム酸化酵素のプロトン輸送系の変異体解析
-
批准号:20051023
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
-
资助金额:$3.97万
-
财政年份:2009
-
负责人:島田 秀夫
-
依托单位:
チトクロム酸化酵素によるプロトンポンプ機構の研究
-
批准号:17053025
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
-
资助金额:$2.18万
-
财政年份:2005
-
负责人:島田 秀夫
-
依托单位:
カムオペロンの末端酸化酵素と電子供与体たんぱく質の複合体
-
批准号:13033036
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
-
资助金额:$1.92万
-
财政年份:2001
-
负责人:島田 秀夫
-
依托单位:
カンファー水酸化酵素P450と鉄イオウたんぱく質の複合体:複合体形成によって誘導されるP450の活性型構造と誘導機構の解明
-
批准号:11169236
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
-
资助金额:$2.3万
-
财政年份:1999
-
负责人:島田 秀夫
-
依托单位:
無細胞たんぱく合成系でのチトクロム酸化酵素の機能発現: 人工アミノ酸の部位特異的導入法を利用したプロトン能動輸送機構の解析を目指して
-
批准号:09878148
-
项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
-
资助金额:$1.34万
-
财政年份:1997
-
负责人:島田 秀夫
-
依托单位:
チトクロームP450camの構造と機能の相関ー活性部位に位置する酵素反応に必須のアミノ酸残基の役割
-
批准号:04680274
-
项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
-
资助金额:$1.22万
-
财政年份:1992
-
负责人:島田 秀夫
-
依托单位:
チトクロ-ムP450camにおける酸素ポケットの構造と機能の相関の解明ーアミノ酸置換による機能変換の解析ー
-
批准号:02680224
-
项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
-
资助金额:$1.41万
-
财政年份:1990
-
负责人:島田 秀夫
-
依托单位:
配位子の光解離反応における光量子収率を測定することによるヘム酵素の活性中心の研究
-
批准号:X00210----479198
-
项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
-
资助金额:$0.45万
-
财政年份:1979
-
负责人:島田 秀夫
-
依托单位:
緑のう菌カンファー水酸化反応機構の解析-シトクロームP450カンファーとプチダレドキシンの相互作用
-
批准号:X00210----278069
-
项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
-
资助金额:$0.22万
-
财政年份:1977
-
负责人:島田 秀夫
-
依托单位:
海外基金