DNA損傷応答におけるヒストンH2AXダイナミクスのプロテオミクス解析

DNA 损伤反应中组蛋白 H2AX 动力学的蛋白质组学分析

• 批准号: 18058004
• 负责人: 井倉 毅
• 金额: $ 2.82万
• 依托单位: Tohoku University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2007
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18058004/
• 关键词: DNA損傷応答; ヒストンH2AX; プロテオミクス解析; ユビキチン化; TIP60ヒストンアセチル化酵素; クロマチン構造変換; マス・スペクトロメトリー解析; UBC13ユビキチン結合因子; 蛋白質複合体; ポリユビキチン化; アセチル化; ヒストン放出

クロマチン構造は,転写、修復、複製および組み換えといったDNA代謝に対して抑制的に作用するため、クロマチン構造変換はこれらDNA代謝に対しての抑制を解除するために必要であると一般的に考えられている。しかしながらDNA損傷においては、損傷部位でのクロマチン構造変換のメカニズムおよび損傷部位での変換機構そのものが修復機構あるいはチェックポイント機構といかに連携を取って機能していくのかについては明らかにされていない点が多い。これまでに我々は、ヒストンH2AXが損傷部位のクロマチンから放出することをMicro-irradiationを組み合わせたFRAP解析により明らかにし、損傷部位での新たなクロマチン構造変換機構の一端を示すことに成功した。さらにヒストンH2AXを含む機能的蛋白質複合体を精製し、マス・スペクトロメトリー(MS)解析を行ない、H2AXは損傷依存的に、これまでのリン酸化に加え、アセチル化およびポリユビキチン化されることを見出した。またそれらの修飾がTIP60ヒストンアセチル化酵素とユビキチン結合酵素UBC13によって制御されていることを示した。興味深いことに損傷依存的なH2AXのポリユビキチン化はアセチル化に依存しており、これまで報告されている損傷依存的なリン酸化には依存しないことが明らかとなり、H2AXのアセチル化に依存したポリユビキチン化が新たな損傷応答シグナルとして機能する可能性が示唆された(Ikura,T.et al.Mol Cell Biol.2007)。

The structure of DNA is necessary for the inhibition of DNA metabolism. DNA damage, damage site, structural change, damage site, structural change, repair mechanism, damage site, structural change, repair mechanism, damage site, structural change, repair mechanism, repair The micro-radiation of the damaged part of the structure is combined with FRAP analysis, and the damage part of the structure is replaced by a new one. H2AX protein complex containing protein function is purified, analyzed and analyzed by MS, H2AX is damage-dependent, and H2AX protein complex is acidified and purified. The enzyme TIP60 is used to bind to the enzyme UBC13. The damage dependent H2AX is dependent on the damage dependent H2AX and the damage dependent H2AX is dependent on the damage dependent H2AX and the damage dependent H2AX is dependent on the damage dependent H2AX and the damage dependent H2AX is dependent on the damage dependent H2AX (Ikura, T. et al. Mol Cell Biol.2007).

项目成果

ヒストンバリアントとDNA代謝

组蛋白变异和 DNA 代谢

• 发表时间: 2006
• 期刊: 蛋白質核酸酵素 51
• 作者: Ochiai;K.;et al.;井倉 毅;井倉 毅
• 通讯作者: 井倉 毅

Heme induces ubiquitination and degradation of the transcription factor bach1

• DOI: 10.1128/mcb.02415-06
• 发表时间: 2007-10-01
• 期刊: MOLECULAR AND CELLULAR BIOLOGY
• 影响因子: 5.3
• 作者: Zenke-Kawasaki, Yukari;Dohi, Yoshihiro;Igarashi, Kazuhiko
• 通讯作者: Igarashi, Kazuhiko

Deubiquitylation of histone H2A activates transcriptional initiation via trans-histone cross-talk with H3K4 di- and trimethylation

• DOI: 10.1101/gad.1609708
• 发表时间: 2008-01-01
• 期刊: GENES & DEVELOPMENT
• 影响因子: 10.5
• 作者: Nakagawa, Takeya;Kajitani, Takuya;Ito, Takashi
• 通讯作者: Ito, Takashi

DNA修復とクロマチン構造変換

DNA修复和染色质结构转变

• 发表时间: 2006
• 期刊: 蛋白質核酸酵素 51
• 作者: Ochiai;K.;et al.;井倉 毅
• 通讯作者: 井倉 毅

Plasmacytic transcription factor Blimp-1 is repressed by Bach2 in B cells

• DOI: 10.1074/jbc.m607592200
• 发表时间: 2006-12-15
• 期刊: JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
• 影响因子: 4.8
• 作者: Ochiai, Kyoko;Katoh, Yasutake;Igarashi, Kazuhiko
• 通讯作者: Igarashi, Kazuhiko