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データグリッドによる異分野科学データベース統合技術の開発

利用数据网格开发跨学科科学数据库集成技术

基本信息

批准号：
19024050
负责人：
松田秀雄
金额：
$ 3.97万
依托单位：
Osaka University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2007
资助国家：
日本
起止时间：
2007 至 2008
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究では、広域に散在し、大容量化かつ多様化する科学データに対するスケーラブルな情報統合とそれにより得られる異分野科学データベースの横断的検索を、データグリッド技術を基盤としたワークフローによる動的な統合として実現した。ワークフローに基づく動的なデータベース統合の評価では、データベースの検索を行うサーバ間を接続するためのデータ転送サービスを考案し、この機能を含めたデータベース統合システムを開発した。複数のデータベースをつないで順次統合するワークフローの処理で、従来法では前段のサーバの出力をクライアントに返す必要があったが、提案する方式ではデータ転送サービスを経由して後段のサーバに直接転送することで通信の効率を上げる。これにより、100HBのデータ転送時間が従来法だと277.3秒かかっていたものが、提案法では3.2秒で短縮できた。スケーラブルなデータベース統合基盤の実現では、データ転送サービスマネージャを導入することで、データ転送サービスの転送の中継・集約を可能とするとともに、中間データ量を絞込みを行えるようにした。従来のワークフローエンジンでは、データベースサーバへの問合せ結果がすべてエンジンに返ってきてしまいメモリオーバフローが発生した。これに対して、データ転送マネージャの導入により、問合せ結果の統合はデータ転送サービスとそのマネージャの問で行われ、エンジンは統合結果だけを受け取るだけとなり、従来のワークフローエンジンでは処理が困難であった700ゲノムの比較ゲノム解析を実行することに成功した。

This study aims to achieve the goal of integrating scientific data into a wide range of technologies, including information integration, and integration. The basic functions of the system include the development of the system integration and evaluation system, and the development of the system integration and evaluation system. In order to improve the efficiency of communication, the first step of the process is to integrate the first step of the process into the second step. 100HB, 100HB The first step is to improve the quality of the product. The result of the interview was that the film was released. For example, if you want to improve the quality of the product, you can use the product to improve the product quality.