课题基金 / 基金详情

膜タンパク質会合過程の高速AFMイメージング

膜タンパク質会合過程の高速AFMイメージング
膜蛋白缔合过程的高速 AFM 成像
批准号:
19042009
负责人:
内橋 貴之
金额:
$3.84万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2007
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2007 至 2008

项目摘要

项目成果

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1. バクテリオロドプシン(bR)の構造変化の観察 : 光吸収サイクルが野性型bRよりも遅いD96N変異体を試料として、緑色レーザー光照射時の光吸収に伴う構造変化の観察を行った。細胞質側では光照射に同期してAFMで観察されるモノマーの輝点が約0.7nm変化することがわかった。光励起された分子の寿命を解析した結果、AFMで観察された構造変化は、基底状態からN中間体への遷移時に発生すると考えられている、EFループの移動であることが分かった。一方、このような構造変化は細胞外側では観察されなかった。また、EFループの移動により隣り合ったbRトライマー内のモノマー同士が相互作用した結果、励起分子の寿命が変化することが分かり、従来から分光法により議論されてきた光吸収サイクルの協同性が構造変化に起因することを明らかにした。2. ロドプシンの会合状態の観察 : 高速AFMでロドプシンの高分解能な動態変化過程や生理過程を捉えるため、AFM観察に適したロドプシン試料の調整としてウシロドプシンの抽出及び天然脂質膜へ再構成を行った。その結果、再構成時の脂質割合や界面活性剤の割合などの条件を変える事で2次元結晶の結晶化度が変化する事が分かった。また、天然の円盤膜中に存在するロドプシンでも、4℃で長時間インキュベーションを行うと2次元結晶化し、ダイマー構造をとることが確認できた。3. ATPaseの回転観察の試み : リジン基で修飾したF1モーターを用いることで、アミノシランおよびグルタルアルデヒド処理したマイカに比較的容易に固定できることが分かった。F1のYサブユニットに標識としてストレプトアビジンを固定し、ATP加水分解による回転運動を観察することができた。しかしながら、AFM観察によりYサブユニットが容易に引き抜かれてしまうことも判明し、再現性よく回転観察を行うところまでは達しなかった。
期刊论文(12)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Protein Dynamics Captured by High-speed AFM
高速 AFM 捕获蛋白质动力学
DOI: --
发表时间: 2007
期刊:
影响因子: --
作者: [T.Uchihashi, N.Kodera, H.Itoh, H.Yamashita, T.Ando, T. Uchihashi and T. Ando]
通讯作者: T. Uchihashi and T. Ando
DOI: 10.1002/jmr.843
发表时间: 2007-11-01
期刊: JOURNAL OF MOLECULAR RECOGNITION
影响因子: 2.7
作者: [Ando, Toshio, Uchihashi, Takayuki, Yamashita, Hayato]
通讯作者: Yamashita, Hayato
"Single Molecule Dynamics in Life Science", T. Yanagida & Yoshiharu Ishii (Eds.)
“生命科学中的单分子动力学”,T. Yanagida
DOI: --
发表时间: 2008
期刊:
影响因子: --
作者: [T. Ando, T. Uchihashi, N. Kodera, D. Yamamoto, M. Taniguchi, A. Miyagi, H. Yamashita]
通讯作者: H. Yamashita
DOI: 10.1063/1.2951594
发表时间: 2008-06
期刊: Applied Physics Letters
影响因子: 4
作者: [T. Fukuma;Yasutaka Okazaki;N. Kodera;T. Uchihashi;T. Ando]
通讯作者: T. Fukuma;Yasutaka Okazaki;N. Kodera;T. Uchihashi;T. Ando
9
    高速AFMで明らかにする一分子局所力学物性のダイナミクスと機能相関
    • 批准号:
      24K01309
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $11.9万
    • 财政年份:
      2024
    • 负责人:
      内橋 貴之
    • 依托单位:
    Development of microscopy techniques to simultaneously visualize the dynamics of the structure and local physical properties of a single protein
    • 批准号:
      22K18943
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
    • 资助金额:
      $4.16万
    • 财政年份:
      2022
    • 负责人:
      内橋 貴之
    • 依托单位:
    High-Speed-AFM Analysis of Structural and Mechanical Properties of Single Protein under Mechanical Stimulation
    • 批准号:
      21H01772
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $11.15万
    • 财政年份:
      2021
    • 负责人:
      内橋 貴之
    • 依托单位:
    Elucidation of mechanical property and self-repair mechanism of microtubule with high-speed AFM
    • 批准号:
      17F17701
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额:
      $1.47万
    • 财政年份:
      2017
    • 负责人:
      内橋 貴之
    • 依托单位:
    国内基金
    海外基金
    基于AFM纳米力学的锡石和方解石之间的界面力测量与作用机理研究
    • 批准号:
      2025JJ60313
    • 项目类别:
      省市级项目
    • 资助金额:
      --
    • 批准年份:
      2025
    • 负责人:
      刘胜
    • 依托单位:
    从GPR81/HIF-1 α驱动的MDSC代谢重塑联 合DESI-MSI/AFM策略探讨紫草多糖抑制 CRC进程的药效物质结构和作用机制
    • 批准号:
    • 项目类别:
      省市级项目
    • 资助金额:
      10.0万元
    • 批准年份:
      2025
    • 负责人:
      邵萌
    • 依托单位:
    新型B1类金属B-内酰胺酶AFM介导亚胺培南耐药的分子进化机制
    • 批准号:
      --
    • 项目类别:
      青年科学基金项目
    • 资助金额:
      --
    • 批准年份:
      2024
    • 负责人:
      张雪飞
    • 依托单位:
    基于AFM的限域水介电常数测量方法构建及在限域传质机制探究中的应用
    • 批准号:
      --
    • 项目类别:
      --
    • 资助金额:
      30万元
    • 批准年份:
      2023
    • 负责人:
      付宛宜
    • 依托单位: