古細菌型ロドプシンの新奇情報伝達機構の解明
阐明古菌视紫红质的新型信号转导机制
基本信息
- 批准号:19045015
- 负责人:
- 金额:$ 4.03万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
- 财政年份:2007
- 资助国家:日本
- 起止时间:2007 至 2008
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
真正細菌から見つかったアナベナセンサリーロドプシン(ASR)は、水溶性の情報伝達タンパク質と相互作用し、新奇情報伝達経路を活性化する。古細菌の負の走光性受容体であるフォボロドプシン(pR)が、走化性受容体MCPファミリーに属するHtrIIと膜内で複合体を形成していることと対照的である。本研究の目的は、ASRがpRと異なる情報伝達経路を活性化する分子機構を高精度な赤外分光計測で明らかにし、古細菌型ロドプシンの分子進化過程でのモーダルシフト機構を解明することである。本年度の研究実績として主に以下のものが挙げられる。1, ASRのL中間体形成時の構造変化を解析し、細胞質側表面近傍に存在するGlu36や近傍の水分子の水素結合変化を見いだした(A. Kawanabe et al., Biochemsity, 2008)。従来の古細菌型ロドプシンでは見られない構造変化であり、ASRが水溶性タンパク質と相互作用するために獲得した機構ではないかと考えている。2, pRの光情報伝達がレチナールC14位とThr204との立体障害により開始されることを明らかにした(Ito et al., Biochemistry, 2008)。3, 真正細菌Salinibacter urberから新たに見つかったセンサリーロドプシンIについて、その光反応サイクル(T. Kitajima-Ihara et al., J. Biol. Chem, 2008)、光誘起構造変化の解析(D. Suzuki et al, Biochemistry, 2008)を行った。4, pRの全反射赤外分光計測により、Asp193が塩化物イオンの存在下でプロトン化していることを明らかにした(Y. Kitade et al., Biochemistry 2008)。イオン結合誘起赤外差スペクトル計測は、他のセルセンサータンパク質にも適用可能な汎用性の高い手法であることを示した。
Real bacteria are active in the form of water-soluble and novel information transport pathways. The negative photoreceptors of archaea are called pR and MCP, which belong to HtrII and intramembranous complexes. The purpose of this study is to elucidate the molecular mechanism of ASR, pR, pR. The results of the study for the year are as follows: 1. The structural transformation during the formation of ASR L intermediate was analyzed, and the existence of Glu36 near the cytoplasmic surface and the water-binding transformation of water molecules near the cytoplasmic surface were observed. Kawanabe et al., Biochemsity, 2008)。A study of the structure and structure of ancient bacteria in the past has been carried out. 2, pR's optical information transmission reaches the C14 position Thr204 and the stereo barrier starts to be bright (Ito et al., Biochemistry, 2008)。3, true bacteria Salinibacter urber I (T. Kitajima-Ihara et al., J. Biol. Chem, 2008), Analysis of photoinduced structural transformation (D. Suzuki et al, Biochemistry, 2008). 4, pR total reflection infrared spectrometer measurement, Asp193 compound in the presence of the first phase of the first phase of the second phase of the first phase of the second phase of the second phase of the second Kitade et al., Biochemistry 2008)。The combination of red heterodyne measurement and other high-quality methods is applicable to all kinds of applications.
项目成果
期刊论文数量(59)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
光センサーに変換したバクテリオロドプシンの構造と構造変化
细菌视紫红质转化为光传感器的结构和结构变化
- DOI:
- 发表时间:2007
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:須藤雄気;古谷祐詞;神取秀樹;John L. Spudich
- 通讯作者:John L. Spudich
赤外分光法による膜タンパク質の機能発現機構の解析-セルセンサー、チャネル、トランスポーターへの適用-
利用红外光谱分析膜蛋白的功能表达机制 - 在细胞传感器、通道和转运蛋白中的应用 -
- DOI:
- 发表时间:2009
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:古谷祐詞;神取秀樹;古谷祐詞
- 通讯作者:古谷祐詞
センサリーロドプシンIの正の走光性のための情報伝達におけるTyrの役割
Tyr 在感觉视紫红质 I 正趋光性信号传导中的作用
- DOI:
- 发表时间:2008
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:高橋はづき;古谷祐詞;佐々木純;John.L Spudich;神取秀樹
- 通讯作者:神取秀樹
Salinibacter sensory rhodopsin -: Sensory rhodopsin I-like protein from a eubacterium
- DOI:10.1074/jbc.m802990200
- 发表时间:2008-08-29
- 期刊:
- 影响因子:4.8
- 作者:Kitajima-Ihara, Tomomi;Furutani, Yuji;Sudo, Yuki
- 通讯作者:Sudo, Yuki
ロドブシンの赤外分光法:より生理的な測定を目指して
红霉素的红外光谱:旨在进行更多的生理测量
- DOI:
- 发表时间:2007
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:古谷祐詞;高橋はづき;佐々木純;須藤雄気;John L. Spudich;神取秀樹;神取秀樹
- 通讯作者:神取秀樹
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
古谷 祐詞其他文献
微生物ロドプシンの吸収波長の自在制御に向けた機械学習法の開発
自由控制微生物视紫红质吸收波长的机器学习方法开发
- DOI:
- 发表时间:
2020 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
井上 圭一;志甫谷 渉;今野 雅恵;樋口 晶光;但馬 聖也;古谷 祐詞;川﨑 佑真;永田 崇;八尾 寛;川村 出;神取 秀樹;濡木 理;井上 圭一 - 通讯作者:
井上 圭一
哺乳類における「非視覚」の光受容機能を支えるメラノプシンの分子基盤
支持哺乳动物“非视觉”感光功能的黑视蛋白的分子基础
- DOI:
- 发表时间:
2016 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
塚本寿夫;久保 義弘;David Farrens;小柳光正;寺北明久;古谷 祐詞 - 通讯作者:
古谷 祐詞
光駆動型内向きH+ポンプ型シゾロドプシンのH+輸送メカニズムの分光及び構造研究
光驱动内向H+泵裂视紫红质H+传输机制的光谱和结构研究
- DOI:
- 发表时间:
2020 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
井上 圭一;志甫谷 渉;今野 雅恵;樋口 晶光;但馬 聖也;古谷 祐詞;川﨑 佑真;永田 崇;八尾 寛;川村 出;神取 秀樹;濡木 理 - 通讯作者:
濡木 理
アスガルド古細菌の持つ新奇光駆動型内向きプロトンポンプ、シゾロドプシンの輸送メカニズム
阿斯加德古菌新型光驱动内向质子泵裂视紫红质的运输机制
- DOI:
- 发表时间:
2020 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
井上 圭一;志甫谷 渉;今野 雅恵;樋口 晶光;但馬 聖也;古谷 祐詞;川﨑 佑真;永田 崇;八尾 寛;川村 出;神取 秀樹;濡木 理 - 通讯作者:
濡木 理
蛍光標識アミノ酸の導入によるタンパク質機能の蛍光分析
通过引入荧光标记氨基酸对蛋白质功能进行荧光分析
- DOI:
- 发表时间:
2007 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
古谷 祐詞;神取 秀樹;飯島一生・芳坂貴弘 - 通讯作者:
飯島一生・芳坂貴弘
古谷 祐詞的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('古谷 祐詞', 18)}}的其他基金
孤立ナノ空間に形成された水クラスターの水素結合ダイナミクス解析
孤立纳米空间中形成的水簇的氢键动力学分析
- 批准号:
20050013 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 4.03万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
光駆動プロトンポンプの動作機構の解明
阐明光驱动质子泵的运行机制
- 批准号:
19042013 - 财政年份:2007
- 资助金额:
$ 4.03万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
ATR-FTIR分光法によるロドプシンのタンパク質間相互作用の解析
ATR-FTIR 光谱法分析视紫红质的蛋白质-蛋白质相互作用
- 批准号:
18870014 - 财政年份:2006
- 资助金额:
$ 4.03万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (Start-up)
時間分解赤外分光法によるロドプシンの情報伝達過程でのタンパク質間相互作用の解明
使用时间分辨红外光谱阐明视紫红质信号转导过程中蛋白质-蛋白质相互作用
- 批准号:
05J02511 - 财政年份:2005
- 资助金额:
$ 4.03万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
偏光赤外分光法を用いたロドプシンの構造変化過程の原子レベルでの解析
利用偏振红外光谱原子水平分析视紫红质的结构变化过程
- 批准号:
03J05268 - 财政年份:2003
- 资助金额:
$ 4.03万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
相似海外基金
材料構造解析に向けた近赤外分光法の進化:NIR-MAIRS法の開発
用于材料结构分析的近红外光谱的发展:NIR-MAIRS 方法的发展
- 批准号:
23K23374 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 4.03万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
摩擦in-situ 3D赤外分光法による水潤滑のメカニズム解明
利用摩擦原位 3D 红外光谱阐明水润滑机理
- 批准号:
23K26024 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 4.03万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Ultrafast Infrared Spectroscopy Facility
超快红外光谱设备
- 批准号:
LE240100004 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 4.03万 - 项目类别:
Linkage Infrastructure, Equipment and Facilities
近赤外および中赤外分光法を併用した触媒表面の酸・塩基性質評価
使用近红外和中红外光谱评估催化剂表面的酸/碱性质
- 批准号:
24K08160 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 4.03万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
近赤外分光法と脳波を用いた社会性認知発達の神経基盤の解明
利用近红外光谱和脑电图阐明社会认知发展的神经基础
- 批准号:
22KJ2772 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 4.03万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
Microvascular autoregulation in skeletal muscle using near-infrared spectroscopy: First-in-human description in ICU patients and comparison with cerebral NIRS
使用近红外光谱进行骨骼肌微血管自动调节:对 ICU 患者的首次人体描述以及与脑 NIRS 的比较
- 批准号:
495291 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 4.03万 - 项目类别:
摩擦in-situ 3D赤外分光法による水潤滑のメカニズム解明
利用摩擦原位 3D 红外光谱阐明水润滑机理
- 批准号:
23H01329 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 4.03万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
A mechanistic understanding of treatment-related outcomes of sleep disordered breathing using functional near infrared spectroscopy
使用功能性近红外光谱从机制上理解睡眠呼吸障碍的治疗相关结果
- 批准号:
10565985 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 4.03万 - 项目类别:
Affordable Shortwave Infrared Spectroscopy for Stroke Risk Screening in Children with Sickle Cell Disease
经济实惠的短波红外光谱仪用于镰状细胞病儿童中风风险筛查
- 批准号:
10730967 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 4.03万 - 项目类别:
Risk prediction of cardiovascular surgery for patients on hemodialysis using near-infrared spectroscopy
利用近红外光谱技术预测血液透析患者心血管手术的风险
- 批准号:
23K15545 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 4.03万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists