课题基金 / 基金详情

ATR-FTIR分光法によるロドプシンのタンパク質間相互作用の解析

ATR-FTIR分光法によるロドプシンのタンパク質間相互作用の解析
ATR-FTIR 光谱法分析视紫红质的蛋白质-蛋白质相互作用
批准号:
18870014
负责人:
古谷 祐詞
金额:
$1.74万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (Start-up)
财政年份:
2006
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2006 至 2007

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
本研究は、タンパク質間相互作用に伴う構造変化を明らかにし、タンパク質間の情報伝達メカニズムの本質に迫ることを目的としている。ATR(Attenuated Total Reflection)-FTIR法を導入することにより、これまで行ってきたタンパク質間相互作用解析を水が十分に存在する条件下にまで発展させる。本年度は、名古屋工業大学・大学院工学研究科・神取研究室に設置されている赤外分光器FTS6000に、SensIR社製ダイヤモンドATR測定装置を組み込み、さらに温度コントロール用のガラスセルを作製し、設置した。試料温度を生理的温度に保ち(0.1度程度の精度)、緩衝液存在下で、水和フィルム試料と遜色ない高精度な赤外差スペクトルを計測することに成功した。また、水和フィルム試料を用いた実験により以下のような知見を得た。(1)13-cis型レチナールを結合したアナベナセンサリーロドプシン(ASR)の初期中間体での構造変化がall-trans型のASRとは異なることを見いだした。(2)ファラオニスフォボロドプシン(ppR)と情報伝達タンパク質pHtrIIの系においては、情報伝達に伴うタンパク質の構造変化(アミドIバンドの強度)が温度依存的に変化することを見いだした。(3)ppRの初期中間体形成に伴うレチナールの構造変化を部位特異的に重水素標識したレチナールを用いることにより明らかにした。(4)ppRのThr204とTyr174の水素結合が情報伝達に必須であることを明らかにした。(5)レプトスファエリアロドプシンの内部プロトン移動反応にAsp150が必須であり、Gluでは置き換えられないことを明らかにした。これらの知見はロドプシンのタンパク質問相互作用についての理解を深めるものであり、ATR-FTIR分光法での対照実験ともなるものである。
英文摘要
本研究は、タンパク質間相互作用に伴う構造変化を明らかにし、タンパク質間の情報伝達メカニズムの本質に迫ることを目的としている。ATR(Attenuated Total Reflection)-FTIR法を導入することにより、これまで行ってきたタンパク質間相互作用解析を水が十分に存在する条件下にまで発展させる。本年度は、名古屋工業大学・大学院工学研究科・神取研究室に設置されている赤外分光器FTS6000に、SensIR社製ダイヤモンドATR測定装置を組み込み、さらに温度コントロール用のガラスセルを作製し、設置した。試料温度を生理的温度に保ち(0.1度程度の精度)、緩衝液存在下で、水和フィルム試料と遜色ない高精度な赤外差スペクトルを計測することに成功した。また、水和フィルム試料を用いた実験により以下のような知見を得た。(1)13-cis型レチナールを結合したアナベナセンサリーロドプシン(ASR)の初期中間体での構造変化がall-trans型のASRとは異なることを見いだした。(2)ファラオニスフォボロドプシン(ppR)と情報伝達タンパク質pHtrIIの系においては、情報伝達に伴うタンパク質の構造変化(アミドIバンドの強度)が温度依存的に変化することを見いだした。(3)ppRの初期中間体形成に伴うレチナールの構造変化を部位特異的に重水素標識したレチナールを用いることにより明らかにした。(4)ppRのThr204とTyr174の水素結合が情報伝達に必須であることを明らかにした。(5)レプトスファエリアロドプシンの内部プロトン移動反応にAsp150が必須であり、Gluでは置き換えられないことを明らかにした。これらの知見はロドプシンのタンパク質問相互作用についての理解を深めるものであり、ATR-FTIR分光法での対照実験ともなるものである。
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会议论文
Functional importance of the interhelical hydrogen bond between Thr204 and Tyr174 of sensory rhodopsin II and its alteration during the signaling process.
感觉视紫红质 II 的 Thr204 和 Tyr174 之间螺旋间氢键的功能重要性及其在信号传导过程中的变化。
DOI: 10.1074/jbc.m605907200
发表时间: 2006
期刊: The Journal of biological chemistry
影响因子: --
作者: [Sudo,Yuki, Furutani,Yuji, Kandori,Hideki, Spudich,JohnL]
通讯作者: Spudich,JohnL
Conformational Coupling between the Cytoplasmic Carboxylic Acid and the Retinal in a Fungal Light-Driven Proton Pump
真菌光驱动质子泵中细胞质羧酸与视网膜之间的构象耦合
DOI: --
发表时间: 2006
期刊: Biochemistry 45・51
影响因子: --
作者: [神山 勉, 吉村恵子, 倭 剛久, 倭 剛久, 倭 剛久, Hiderou Yoshida, Hiderou Yoshida, 倭 剛久, 倭 剛久, 倭 剛久, Hiderou Yoshida, Hiderou Yoshida, Hiderou Yoshida, 吉田秀郎, Hiderou Yoshida, Hiderou Yoshida, Yukako Oda, Satomi Nadanaka, Satomi Nadanaka, Satomi Nadanaka, 吉田秀郎, 吉田秀郎, Hiderou Yoshida, 吉田秀郎, 灘中里美, 灘中里美, 灘中里美, 吉田秀郎, 小田裕香子, Z.Huang, 吉田秀郎, Hiderou Yoshida, Hiderou Yoshida, Zhi-Ming Huang, 吉田秀郎, 吉田秀郎, T.Hirano et al., T.Ota et al., V.A.Lorenz-Fonfria et al., Y.Furutani et al., A.Kawanabe et al., K.Kamada et al., N.Muneda et al., M.Shibata et al., N.Mizuide et al., K.Zikihara et al., Y.Furutani et al., Y.Sudo et al., M.Shibata et al., Y.Furutani et al.]
通讯作者: Y.Furutani et al.
Photoisomerization Processes in the 13-cis and All-trans Forms of Anabaena Sensory Rhodopsin at 77K
鱼腥藻感觉视紫红质 13-顺式和全反式在 77K 下的光异构化过程
DOI: --
发表时间: 2006
期刊: Biochemistry 45・14
影响因子: --
作者: [福田 智行, 太田 邦史, A.Kawanabe et al.]
通讯作者: A.Kawanabe et al.
DOI: 10.1021/bi0610597
发表时间: 2006-10-03
期刊: BIOCHEMISTRY
影响因子: 2.9
作者: [Furutani, Yuji, Sudo, Yuki, Kandori, Hideki]
通讯作者: Kandori, Hideki
孤立ナノ空間に形成された水クラスターの水素結合ダイナミクス解析
光駆動プロトンポンプの動作機構の解明
  • 批准号:
    19042013
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额:
    $3.58万
  • 财政年份:
    2007
  • 负责人:
    古谷 祐詞
  • 依托单位:
古細菌型ロドプシンの新奇情報伝達機構の解明
  • 批准号:
    19045015
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额:
    $4.03万
  • 财政年份:
    2007
  • 负责人:
    古谷 祐詞
  • 依托单位:
時間分解赤外分光法によるロドプシンの情報伝達過程でのタンパク質間相互作用の解明
  • 批准号:
    05J02511
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 资助金额:
    $0.77万
  • 财政年份:
    2005
  • 负责人:
    古谷 祐詞
  • 依托单位:
海外基金