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ATR-FTIR分光法によるロドプシンのタンパク質間相互作用の解析

ATR-FTIR 光谱法分析视紫红质的蛋白质-蛋白质相互作用

基本信息

批准号：
18870014
负责人：
古谷祐詞
金额：
$ 1.74万
依托单位：
Nagoya Institute of Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (Start-up)
财政年份：
2006
资助国家：
日本
起止时间：
2006 至 2007
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18870014/
关键词：
シグナル伝達赤外分光法生体分子蛋白質生物物理

项目摘要

本研究は、タンパク質間相互作用に伴う構造変化を明らかにし、タンパク質間の情報伝達メカニズムの本質に迫ることを目的としている。ATR(Attenuated Total Reflection)-FTIR法を導入することにより、これまで行ってきたタンパク質間相互作用解析を水が十分に存在する条件下にまで発展させる。本年度は、名古屋工業大学・大学院工学研究科・神取研究室に設置されている赤外分光器FTS6000に、SensIR社製ダイヤモンドATR測定装置を組み込み、さらに温度コントロール用のガラスセルを作製し、設置した。試料温度を生理的温度に保ち(0.1度程度の精度)、緩衝液存在下で、水和フィルム試料と遜色ない高精度な赤外差スペクトルを計測することに成功した。また、水和フィルム試料を用いた実験により以下のような知見を得た。(1)13-cis型レチナールを結合したアナベナセンサリーロドプシン(ASR)の初期中間体での構造変化がall-trans型のASRとは異なることを見いだした。(2)ファラオニスフォボロドプシン(ppR)と情報伝達タンパク質pHtrIIの系においては、情報伝達に伴うタンパク質の構造変化(アミドIバンドの強度)が温度依存的に変化することを見いだした。(3)ppRの初期中間体形成に伴うレチナールの構造変化を部位特異的に重水素標識したレチナールを用いることにより明らかにした。(4)ppRのThr204とTyr174の水素結合が情報伝達に必須であることを明らかにした。(5)レプトスファエリアロドプシンの内部プロトン移動反応にAsp150が必須であり、Gluでは置き換えられないことを明らかにした。これらの知見はロドプシンのタンパク質問相互作用についての理解を深めるものであり、ATR-FTIR分光法での対照実験ともなるものである。

In this study, the interaction between customers is related to the development of information and communication systems, and the relationship between them is in line with the requirements for the purpose of communication. The ATR (Attenuated Total Reflection)-FTIR method is used to analyze the interaction between the water and the water under the condition of very high temperature. This year, the Institute of Engineering, Graduate School of Engineering, Nagoya University of Technology, has set up the equipment of the infrared spectrometer FTS6000, the SensIR community, the ATR measuring device, and the temperature sensor. "material temperature" physiological temperature preservation (0.1 degree accuracy), low temperature solution, high precision, high-precision red heterodyne, high-precision, high-precision, high-precision Water, water and other materials are used to find out what you have heard. (1) in the early stage of ASR, there was a rapid development of all- transgenesis, which was caused by the combination of 13-cisplasters and microphones. (2) the temperature dependence of temperature dependence is affected by the temperature dependence of the pHtrII system. (2) the temperature dependence of the temperature dependence is different. (2) the temperature dependence of the pHtrII system is different. (3) in the initial stage of ppR, the body forms the heavy water mark of the specific part of the body, that is, the heavy water mark. (4) it is necessary to make sure that the water content of ppR Thr204 Tyr174 is satisfactory. (5) if you want to move the anti-Asp150 system, you have to check it, and the Glu configuration requires you to make sure that you are aware of the situation. I don't know how to understand the interaction. I don't know what to do. I don't know what to do. I don't know. I don't know.

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Functional importance of the interhelical hydrogen bond between Thr204 and Tyr174 of sensory rhodopsin II and its alteration during the signaling process.

感觉视紫红质 II 的 Thr204 和 Tyr174 之间螺旋间氢键的功能重要性及其在信号传导过程中的变化。

DOI：
10.1074/jbc.m605907200
发表时间：
2006
期刊：
The Journal of biological chemistry
影响因子：
0
作者：
Sudo,Yuki;Furutani,Yuji;Kandori,Hideki;Spudich,JohnL
通讯作者：
Spudich,JohnL

Conformational Coupling between the Cytoplasmic Carboxylic Acid and the Retinal in a Fungal Light-Driven Proton Pump

真菌光驱动质子泵中细胞质羧酸与视网膜之间的构象耦合

DOI：
发表时间：
2006
期刊：
Biochemistry 45・51
影响因子：
0
作者：
神山勉;吉村恵子;倭剛久;倭剛久;倭剛久;Hiderou Yoshida;Hiderou Yoshida;倭剛久;倭剛久;倭剛久;Hiderou Yoshida;Hiderou Yoshida;Hiderou Yoshida;吉田秀郎;Hiderou Yoshida;Hiderou Yoshida;Yukako Oda;Satomi Nadanaka;Satomi Nadanaka;Satomi Nadanaka;吉田秀郎;吉田秀郎;Hiderou Yoshida;吉田秀郎;灘中里美;灘中里美;灘中里美;吉田秀郎;小田裕香子;Z.Huang;吉田秀郎;Hiderou Yoshida;Hiderou Yoshida;Zhi-Ming Huang;吉田秀郎;吉田秀郎;T.Hirano et al.;T.Ota et al.;V.A.Lorenz-Fonfria et al.;Y.Furutani et al.;A.Kawanabe et al.;K.Kamada et al.;N.Muneda et al.;M.Shibata et al.;N.Mizuide et al.;K.Zikihara et al.;Y.Furutani et al.;Y.Sudo et al.;M.Shibata et al.;Y.Furutani et al.
通讯作者：
Y.Furutani et al.

Photoisomerization Processes in the 13-cis and All-trans Forms of Anabaena Sensory Rhodopsin at 77K

鱼腥藻感觉视紫红质 13-顺式和全反式在 77K 下的光异构化过程