時間分解赤外分光法によるロドプシンの情報伝達過程でのタンパク質間相互作用の解明

使用时间分辨红外光谱阐明视紫红质信号转导过程中蛋白质-蛋白质相互作用

基本信息

  • 批准号:
    05J02511
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 0.77万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2005
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2005 至 2007
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

本研究は、視物質ロドプシンやファラオニスフォボロドプシン(ppR)などの様々なロドプシンと情報伝達タンパク質(視物質ロドプシンにおいてはトランスデューシン、ppRにおいてはpHtrII)との相互作用を室温において実時間で捉え、その構造ダイナミクスを原子レベルで明らかにすることを目的としている。そのため、本年度は時間分解赤外分光測定系を構築するために、構造変化情報が豊富なバクテリオロドプシンを用いた実験を行った。その結果、マイクロ秒からミリ秒の時間分解能での計測が可能であることを確認し、さらにはこれまでまったく情報がなかったタンパク質内部に結合した水分子のO-H伸縮振動の時間分解計測に成功した。この結果は、現在原著論文を作成中である。また、ppRとpHtrIIとのタンパク質間相互作用については、定常光照射により活性化中間体を蓄積させるという手法を用いることにより、低温である250Kだけでなく、より生理的な温度である293Kにおける赤外分光計測を行うことに成功した。その結果、膜内領域に存在するppRのTyr199とpHtrIIのAsn74の水素結合は温度に関係なく中間体形成に伴って強くなる一方で、ppRの膜貫通ヘリックスの動きは室温に近いほどpHtrIIとの相互作用により阻害されていることを明らかにした。前者の結果はBiochemistry誌44巻2909-2915頁に発表し、後者の結果についてもBiochemistry誌に掲載が決定している。研究代表者は名古屋工業大学工学研究科助手に就任するため、残念ながら視物質ロドプシンやppRの時間分解赤外分光計測には至らずに本研究を終了することとなるが、将来、新たに研究提案を行い本年度得られた結果を糧に研究目的を達成したいと考えている。
In this study, the interaction between visual substance and information was studied. The interaction between visual substance and information was studied at room temperature. The structure of visual substance was studied. This year's infrared spectroscopy system was constructed to provide information on the use of infrared spectroscopy. The measurement of the time decomposition energy of the water molecule is successful. The result is that the original paper is now being made. The method of accumulation of activated intermediates by steady light irradiation was successfully used in the measurement of mass-mass interaction at low temperature of 250K and physiological temperature of 293K. As a result, the presence of Tyr199 and pHtrII and Asn74 in the membrane domain is related to the formation of intermediates. The results of the former are reported in Biochemistry 44, pp. 2909-2915, and the results of the latter are disclosed in Biochemistry. The research representative was appointed as an assistant to the Graduate School of Engineering of Nagoya University of Technology. The results of this research were achieved in the future.

项目成果

期刊论文数量(6)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
FTIR studies of the photoactivation processes in squid retinochrome
  • DOI:
    10.1021/bi050219w
  • 发表时间:
    2005-06-07
  • 期刊:
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Furutani, Y;Terakita, A;Kandori, H
  • 通讯作者:
    Kandori, H
Strongly hydrogen-bonded water molecules in the Schiff base region of rhodopsins
  • DOI:
    10.1039/b416698a
  • 发表时间:
    2005-08
  • 期刊:
  • 影响因子:
    3.1
  • 作者:
    Y. Furutani;Mikihiro Shibata;H. Kandori
  • 通讯作者:
    Y. Furutani;Mikihiro Shibata;H. Kandori
Strongly hydrogen-bonded water molecule present near the retinal chromophore of Leptosphaeria rhodopsin, the bacteriorhodopsin-like proton pump from a eukaryote.
  • DOI:
    10.1021/bi0513498
  • 发表时间:
    2005-10
  • 期刊:
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Masayo Sumii;Y. Furutani;S. Waschuk;L. Brown;H. Kandori
  • 通讯作者:
    Masayo Sumii;Y. Furutani;S. Waschuk;L. Brown;H. Kandori
Steric Constraint in the Primary Photoproduct of an Archaeal Rhodopsin from Regiospecific Perturbation of C-C Stretching Vibration of the Retinyl Chromophore
视黄基发色团 C-C 拉伸振动的区域特异性扰动对古菌视紫红质初级光产物的空间约束
  • DOI:
  • 发表时间:
    2005
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Y.Sudo;Y.Furutani;A.Wada;M.Ito;N.Kamo;H.Kandori
  • 通讯作者:
    H.Kandori
FTIR Spectroscopy of the all-trans form of Anabaena sensory rhodopsin at 77 K:: Hydrogen bond of a water between the Schiff base and Asp75
  • DOI:
    10.1021/bi050841o
  • 发表时间:
    2005-09-20
  • 期刊:
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Furutani, Y;Kawanabe, A;Kandori, H
  • 通讯作者:
    Kandori, H
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  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    井上 圭一;志甫谷 渉;今野 雅恵;樋口 晶光;但馬 聖也;古谷 祐詞;川﨑 佑真;永田 崇;八尾 寛;川村 出;神取 秀樹;濡木 理
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    2020
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  • 作者:
    井上 圭一;志甫谷 渉;今野 雅恵;樋口 晶光;但馬 聖也;古谷 祐詞;川﨑 佑真;永田 崇;八尾 寛;川村 出;神取 秀樹;濡木 理
  • 通讯作者:
    濡木 理
蛍光標識アミノ酸の導入によるタンパク質機能の蛍光分析
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  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    古谷 祐詞;神取 秀樹;飯島一生・芳坂貴弘
  • 通讯作者:
    飯島一生・芳坂貴弘

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知道了