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偏光赤外分光法を用いたロドプシンの構造変化過程の原子レベルでの解析

利用偏振红外光谱原子水平分析视紫红质的结构变化过程

基本信息

批准号：
03J05268
负责人：
古谷祐詞
金额：
$ 1.15万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2003
资助国家：
日本
起止时间：
2003 至 2004
项目状态：
已结题

项目摘要

ロドプシンは光受容後の構造変化により、情報伝達タンパク質との相互作用を変化させ、細胞内に光情報を伝達する。このようなタンパク質間の相互作用機構を明らかにすることを目的に、フォボロドプシンppRと情報伝達タンパク質pHtrIIとの相互作用を赤外分光法で解析した。その結果、pHtrIIとの結合が100倍程度弱くなるM中間体において、pHtrIIのAsn74側鎖のC=O伸縮振動が1693cm^<-1>から1684cm^<-1>へと低波数シフトすることが明らかになった。前年度の結果と併せて考察すると、K中間体の形成に伴って生じたタンパク質骨格の摂動およびThr204の水素結合強度の変化はM中間体の形成に伴って消失し、ppR-pHtrII間の相互作用変化はAsn74の水素結合強度を強くすると考えられる。M中間体形成時にpHtrIIとの結合が弱くなるという事実との整合性を考えると、Asn74の水素結合の相手はppRのTyr199から、Asn74の近傍に存在するpHtrIIのThr33などにスイッチする可能性が示唆される。もしくは、Asn74とTyr199の水素結合がM中間体でも維持され、その強度が強くなっているのであれば、他の部位、例えばppRのThr189とpHtrIIのSer62およびGlu43の水素結合もしくはppRとpHtrII間の疎水的な相互作用が弱まることが示唆される。また、pHtrIIに由来するタンパク質骨格の構造変化が認められなかったことから、ppR-pHtrII間の情報伝達機構は膜貫通ヘリックスの剛体的な運動を介していることが示唆された。

After the light is tolerated, the interaction is changed, the light is reached, and the light is reached. The interagency agency is responsible for the determination of the purpose and the ppR of the pHtrII interaction. The infrared spectrophotometry is used to analyze the interaction. The results of the experiment, the combination of the pHtrII filter and the 100-fold weakening of the body temperature, the pHtrII Asn74 filter, the vibration wave 1693cm^ & the lt;-1> spectrum 1684cm^ & lt;-1>, the low-wavenumber radar, the low-wave response, and the low-wave response. In the previous year, the results showed that the formation of phenotypic acid in the middle of the year, the formation of the body in K, the formation of the bone mass, the combination of the Thr204 water and the strength, the formation of the body, the disappearance of the salt, the interaction of the ppR-pHtrII, the strength of the binding of Asn74 water, the strength of the bond. The formation time of the medium body in M was tested by the combination of pHtrII and weak virus, the integration test of Asn74, the combination of ppR and water, and the possibility that there was a negative effect on pHtrII Thr33 in the vicinity of Asn74. The combination of ppR, Asn74 and Tyr199 water in M shows that the interaction between the body and the body, the strength of the body, the strength of the body, the location of the body, the Thr189 of the Ser62, the Glu43 of the Glu43, the interaction of the ppR and the cold water, indicates that the interaction between them is weak. The cause of the disease, the pHtrII system, the system, the information system, the information system