偏光赤外分光法を用いたロドプシンの構造変化過程の原子レベルでの解析
偏光赤外分光法を用いたロドプシンの構造変化過程の原子レベルでの解析
批准号:
03J05268
负责人:
古谷 祐詞
金额:
$1.15万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2003
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2003 至 2004
中文摘要
ロドプシンは光受容後の構造変化により、情報伝達タンパク質との相互作用を変化させ、細胞内に光情報を伝達する。このようなタンパク質間の相互作用機構を明らかにすることを目的に、フォボロドプシンppRと情報伝達タンパク質pHtrIIとの相互作用を赤外分光法で解析した。その結果、pHtrIIとの結合が100倍程度弱くなるM中間体において、pHtrIIのAsn74側鎖のC=O伸縮振動が1693cm^<-1>から1684cm^<-1>へと低波数シフトすることが明らかになった。前年度の結果と併せて考察すると、K中間体の形成に伴って生じたタンパク質骨格の摂動およびThr204の水素結合強度の変化はM中間体の形成に伴って消失し、ppR-pHtrII間の相互作用変化はAsn74の水素結合強度を強くすると考えられる。M中間体形成時にpHtrIIとの結合が弱くなるという事実との整合性を考えると、Asn74の水素結合の相手はppRのTyr199から、Asn74の近傍に存在するpHtrIIのThr33などにスイッチする可能性が示唆される。もしくは、Asn74とTyr199の水素結合がM中間体でも維持され、その強度が強くなっているのであれば、他の部位、例えばppRのThr189とpHtrIIのSer62およびGlu43の水素結合もしくはppRとpHtrII間の疎水的な相互作用が弱まることが示唆される。また、pHtrIIに由来するタンパク質骨格の構造変化が認められなかったことから、ppR-pHtrII間の情報伝達機構は膜貫通ヘリックスの剛体的な運動を介していることが示唆された。
英文摘要
ロドプシンは光受容後の構造変化により、情報伝達タンパク質との相互作用を変化させ、細胞内に光情報を伝達する。このようなタンパク質間の相互作用機構を明らかにすることを目的に、フォボロドプシンppRと情報伝達タンパク質pHtrIIとの相互作用を赤外分光法で解析した。その結果、pHtrIIとの結合が100倍程度弱くなるM中間体において、pHtrIIのAsn74側鎖のC=O伸縮振動が1693cm^<-1>から1684cm^<-1>へと低波数シフトすることが明らかになった。前年度の結果と併せて考察すると、K中間体の形成に伴って生じたタンパク質骨格の摂動およびThr204の水素結合強度の変化はM中間体の形成に伴って消失し、ppR-pHtrII間の相互作用変化はAsn74の水素結合強度を強くすると考えられる。M中間体形成時にpHtrIIとの結合が弱くなるという事実との整合性を考えると、Asn74の水素結合の相手はppRのTyr199から、Asn74の近傍に存在するpHtrIIのThr33などにスイッチする可能性が示唆される。もしくは、Asn74とTyr199の水素結合がM中間体でも維持され、その強度が強くなっているのであれば、他の部位、例えばppRのThr189とpHtrIIのSer62およびGlu43の水素結合もしくはppRとpHtrII間の疎水的な相互作用が弱まることが示唆される。また、pHtrIIに由来するタンパク質骨格の構造変化が認められなかったことから、ppR-pHtrII間の情報伝達機構は膜貫通ヘリックスの剛体的な運動を介していることが示唆された。
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Yuji Furutani: "FTIR Spectroscopy of the complex between pharaonis Phoborhodopsin and its Transducer Protein"Biochemistry. 42・17. 4837-4842 (2003)
Yuji Furutani:“法老荧光紫红质及其转导蛋白之间的复合物的 FTIR 光谱”生物化学 42・17(2003)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Taro Tanimoto: "Structural Changes of Water in the Schiff Base Region of Bacteriorhodopsin : Proposal of a Hydration Switch Model"Biochemistry. 42・8. 2300-2306 (2003)
谷本太郎:“细菌视紫红质希夫碱区水的结构变化:水合开关模型的提议”生物化学 2300-2306(2003)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
FTIR Spectroscopy of the O Photointermediate in pharaonis Phoborhodopsin
法老紫磷紫红质中 O2 光中间体的 FTIR 光谱
DOI:
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发表时间:
2004
期刊:
Biochemistry (発表予定)
影响因子:
--
作者:
[Y.Furutani et al.]
通讯作者:
Y.Furutani et al.
Yuji Furutani: "Structural Changes of Water Molecules during the Photoactivation Processes in Bovine Rhodopsin"Biochemistry. 42・32. 9619-9625 (2003)
Yuji Furutani:“牛视紫红质光活化过程中水分子的结构变化”生物化学42・32(2003)。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
孤立ナノ空間に形成された水クラスターの水素結合ダイナミクス解析
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批准号:20050013
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.24万
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财政年份:2008
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负责人:古谷 祐詞
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依托单位:
光駆動プロトンポンプの動作機構の解明
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批准号:19042013
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$3.58万
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财政年份:2007
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负责人:古谷 祐詞
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依托单位:
古細菌型ロドプシンの新奇情報伝達機構の解明
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批准号:19045015
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.03万
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财政年份:2007
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负责人:古谷 祐詞
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依托单位:
ATR-FTIR分光法によるロドプシンのタンパク質間相互作用の解析
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批准号:18870014
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (Start-up)
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资助金额:$1.74万
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财政年份:2006
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负责人:古谷 祐詞
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依托单位:
時間分解赤外分光法によるロドプシンの情報伝達過程でのタンパク質間相互作用の解明
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批准号:05J02511
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.77万
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财政年份:2005
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负责人:古谷 祐詞
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依托单位:
海外基金