光駆動プロトンポンプの動作機構の解明
阐明光驱动质子泵的运行机制
基本信息
- 批准号:19042013
- 负责人:
- 金额:$ 3.58万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
- 财政年份:2007
- 资助国家:日本
- 起止时间:2007 至 2008
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
世界最小のイオンポンプであるバクテリオロドプシンは、最も研究が進んでいるポンプ蛋白質であるが、そのポンプ機構は解明されたとは言い難い。本研究では、光駆動プロトンポンプの動作機構を解明するため、機能転換を含めた蛋白質の変異、光駆動ポンプ活性の計測、そして申請者のグループが世界に誇る赤外分光法を駆使した網羅的な研究を古細菌型ロドプシンに対して行った。特に、古細菌に存在するロドプシンだけでなく、真核生物や真正細菌から新たに見つかった古細菌型ロドプシンを主要な研究対象に位置付けた。本年度の研究実績として主に以下のものが挙げられる。1, 真正細菌由来のプロトンポンプタンパク質であるプロテオロドプシンの細胞質側ループ部位にArgを導入したA178R変異体では、吸収極大波長が20mmほど長波長シフトした。これまでの常識に反し、発色団レチナールから25Aも離れた部位の変異が吸収スペクトルに影響するという特異な現象を発見した成果である(M. Yoshitsugu et al. Angew. Chem. Iht. Ed, 2008)。2, 生理的条件下では光センサーとしてはたらくが、情報伝達タンパク質が存在しない条件下ではプロトンポンプ活性を示すファラオニスフォボロドプシンについて、そのプロトン放出基の同定を全反射赤外分光計測により行った。その結果、Asp193が塩化物イオンの存在下でプロトン化しており、それが光反応中間体で解離することでプロトン放出を行っていることを明らかにした(Y. Kitade et al. Biochemistry 2008)。光反応を必要としないイオン結合誘起赤外差スペクトル計測は、他のイオン輸送タンパク質にも適用可能であり、汎用性の高い手法であることを示した。
World's smallest の イ オ ン ポ ン プ で あ る バ ク テ リ オ ロ ド プ シ ン が は, most も research into ん で い る ポ ン プ protein で あ る が, そ の ポ ン プ institutions は interpret さ れ た と は い い difficult. This study で は, light 駆 プ ロ ト ン ポ ン プ の action agencies を interpret す る た め, function planning in を め た protein の - vision, light 駆 ポ ン プ active の measuring, そ し て applicants の グ ル ー プ が outside world に kua る red spectrometry を 駆 make し た snare な research を archaea type ロ ド プ シ ン に し seaborne て line っ た. に, the archaea に exist す る ロ ド プ シ ン だ け で な く, eukaryotes や real bacteria か ら new た に see つ か っ た archaea type ロ ド プ シ ン を な main research like に seaborne position pay け た. The current year 's <s:1> research achievements と points て are mainly に and below <s:1> が挙げられる が挙げられる が挙げられる. 1, the real bacteria origin の プ ロ ト ン ポ ン プ タ ン パ ク qualitative で あ る プ ロ テ オ ロ ド プ シ ン の cytoplasmic side ル ー プ parts に Arg を import し た A178R - variant で は, 20 mm ほ 収 maximum absorption wavelength が ど long wavelength シ フ ト し た. こ れ ま で の sense に し, 発 color 団 レ チ ナ ー ル か ら 25 a も from れ の た parts - different が suction 収 ス ペ ク ト ル に influence す る と い な phenomena う を 発 see し た results で あ る (m. Yoshitsugu et al. Angew. Chem. Iht. Ed, 2008). 2, under the condition of physiological で は light セ ン サ ー と し て は た ら く が, intelligence 伝 タ ン パ ク qualitative が exist し な い conditions で は プ ロ ト ン ポ ン を プ activity in す フ ァ ラ オ ニ ス フ ォ ボ ロ ド プ シ ン に つ い て, そ の プ ロ ト ン release base の with spectrometer measuring を total reflection red outside に よ り line っ た. そ の results, Asp193 が salt compound イ オ ン の presence で プ ロ ト ン change し て お り, そ れ が light anti 応 intermediates で dissociation す る こ と で プ ロ ト ン line released を っ て い る こ と を Ming ら か に し た (Y. Kitade et al. Biochemistry, 2008). Light anti 応 を necessary と し な い イ オ ン combined lure red heterodyne ス ペ ク ト ル measuring は, he の イ オ ン conveying タ ン パ ク qualitative に も may apply で あ り, high domestic sex の い gimmick で あ る こ と を shown し た.
项目成果
期刊论文数量(68)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
光センサーに変換したバクテリオロドプシンの構造と構造変化
细菌视紫红质转化为光传感器的结构和结构变化
- DOI:
- 发表时间:2007
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:須藤雄気;古谷祐詞;神取秀樹;John L. Spudich
- 通讯作者:John L. Spudich
赤外分光法による膜タンパク質の機能発現機構の解析-セルセンサー、チャネル、トランスポーターへの適用-
利用红外光谱分析膜蛋白的功能表达机制 - 在细胞传感器、通道和转运蛋白中的应用 -
- DOI:
- 发表时间:2009
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:古谷祐詞;神取秀樹;古谷祐詞
- 通讯作者:古谷祐詞
センサリーロドプシンIの正の走光性のための情報伝達におけるTyrの役割
Tyr 在感觉视紫红质 I 正趋光性信号传导中的作用
- DOI:
- 发表时间:2008
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:高橋はづき;古谷祐詞;佐々木純;John.L Spudich;神取秀樹
- 通讯作者:神取秀樹
Salinibacter sensory rhodopsin -: Sensory rhodopsin I-like protein from a eubacterium
- DOI:10.1074/jbc.m802990200
- 发表时间:2008-08-29
- 期刊:
- 影响因子:4.8
- 作者:Kitajima-Ihara, Tomomi;Furutani, Yuji;Sudo, Yuki
- 通讯作者:Sudo, Yuki
FTIR Study of Nitrate-bound pharaonis Halorhodopsin
硝酸盐结合的鹳盐视紫红质的 FTIR 研究
- DOI:
- 发表时间:2007
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Keisuke Nakashima;Mikihiro Shibata;Makoto Demura and Hideki Kandori
- 通讯作者:Makoto Demura and Hideki Kandori
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
古谷 祐詞其他文献
微生物ロドプシンの吸収波長の自在制御に向けた機械学習法の開発
自由控制微生物视紫红质吸收波长的机器学习方法开发
- DOI:
- 发表时间:
2020 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
井上 圭一;志甫谷 渉;今野 雅恵;樋口 晶光;但馬 聖也;古谷 祐詞;川﨑 佑真;永田 崇;八尾 寛;川村 出;神取 秀樹;濡木 理;井上 圭一 - 通讯作者:
井上 圭一
哺乳類における「非視覚」の光受容機能を支えるメラノプシンの分子基盤
支持哺乳动物“非视觉”感光功能的黑视蛋白的分子基础
- DOI:
- 发表时间:
2016 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
塚本寿夫;久保 義弘;David Farrens;小柳光正;寺北明久;古谷 祐詞 - 通讯作者:
古谷 祐詞
光駆動型内向きH+ポンプ型シゾロドプシンのH+輸送メカニズムの分光及び構造研究
光驱动内向H+泵裂视紫红质H+传输机制的光谱和结构研究
- DOI:
- 发表时间:
2020 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
井上 圭一;志甫谷 渉;今野 雅恵;樋口 晶光;但馬 聖也;古谷 祐詞;川﨑 佑真;永田 崇;八尾 寛;川村 出;神取 秀樹;濡木 理 - 通讯作者:
濡木 理
アスガルド古細菌の持つ新奇光駆動型内向きプロトンポンプ、シゾロドプシンの輸送メカニズム
阿斯加德古菌新型光驱动内向质子泵裂视紫红质的运输机制
- DOI:
- 发表时间:
2020 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
井上 圭一;志甫谷 渉;今野 雅恵;樋口 晶光;但馬 聖也;古谷 祐詞;川﨑 佑真;永田 崇;八尾 寛;川村 出;神取 秀樹;濡木 理 - 通讯作者:
濡木 理
蛍光標識アミノ酸の導入によるタンパク質機能の蛍光分析
通过引入荧光标记氨基酸对蛋白质功能进行荧光分析
- DOI:
- 发表时间:
2007 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
古谷 祐詞;神取 秀樹;飯島一生・芳坂貴弘 - 通讯作者:
飯島一生・芳坂貴弘
古谷 祐詞的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('古谷 祐詞', 18)}}的其他基金
孤立ナノ空間に形成された水クラスターの水素結合ダイナミクス解析
孤立纳米空间中形成的水簇的氢键动力学分析
- 批准号:
20050013 - 财政年份:2008
- 资助金额:
$ 3.58万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
古細菌型ロドプシンの新奇情報伝達機構の解明
阐明古菌视紫红质的新型信号转导机制
- 批准号:
19045015 - 财政年份:2007
- 资助金额:
$ 3.58万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
ATR-FTIR分光法によるロドプシンのタンパク質間相互作用の解析
ATR-FTIR 光谱法分析视紫红质的蛋白质-蛋白质相互作用
- 批准号:
18870014 - 财政年份:2006
- 资助金额:
$ 3.58万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (Start-up)
時間分解赤外分光法によるロドプシンの情報伝達過程でのタンパク質間相互作用の解明
使用时间分辨红外光谱阐明视紫红质信号转导过程中蛋白质-蛋白质相互作用
- 批准号:
05J02511 - 财政年份:2005
- 资助金额:
$ 3.58万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
偏光赤外分光法を用いたロドプシンの構造変化過程の原子レベルでの解析
利用偏振红外光谱原子水平分析视紫红质的结构变化过程
- 批准号:
03J05268 - 财政年份:2003
- 资助金额:
$ 3.58万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
相似海外基金
材料構造解析に向けた近赤外分光法の進化:NIR-MAIRS法の開発
用于材料结构分析的近红外光谱的发展:NIR-MAIRS 方法的发展
- 批准号:
23K23374 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 3.58万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
摩擦in-situ 3D赤外分光法による水潤滑のメカニズム解明
利用摩擦原位 3D 红外光谱阐明水润滑机理
- 批准号:
23K26024 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 3.58万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
近赤外および中赤外分光法を併用した触媒表面の酸・塩基性質評価
使用近红外和中红外光谱评估催化剂表面的酸/碱性质
- 批准号:
24K08160 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 3.58万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
近赤外分光法と脳波を用いた社会性認知発達の神経基盤の解明
利用近红外光谱和脑电图阐明社会认知发展的神经基础
- 批准号:
22KJ2772 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 3.58万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
摩擦in-situ 3D赤外分光法による水潤滑のメカニズム解明
利用摩擦原位 3D 红外光谱阐明水润滑机理
- 批准号:
23H01329 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 3.58万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
地域の食文化・習慣を考慮した近赤外分光法による調味料の客観的品質評価技術の確立
结合当地饮食文化和习俗建立近红外光谱客观调味品质量评价技术
- 批准号:
22K02115 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 3.58万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
近赤外分光法による高齢者への前腕浴が前頭葉機能の注意力に及ぼす効果の検証
利用近红外光谱验证前臂沐浴对老年人额叶功能和注意力的影响
- 批准号:
21K11146 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 3.58万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
近赤外分光法を用いた安全で効果的な他動運動の解明に向けた循環調節に関する基礎研究
利用近红外光谱进行循环调节基础研究以阐明安全有效的被动运动
- 批准号:
21K10613 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 3.58万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
近赤外分光法(fNIRS)を応用した歯原性疼痛の客観的評価法の開発
使用近红外光谱(fNIRS)开发牙源性疼痛的客观评估方法
- 批准号:
20K10172 - 财政年份:2020
- 资助金额:
$ 3.58万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
脳波-近赤外分光法同時記録を用いたサブプレート・ニューロンの脳血流動態の解明
使用脑电图和近红外光谱的同时记录阐明亚板神经元的脑血流动力学
- 批准号:
20K08228 - 财政年份:2020
- 资助金额:
$ 3.58万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)














{{item.name}}会员




